• Search Research Projects
  • Search Researchers
  • How to Use
  1. Back to previous page

カワリヌマエビにおける恒常的及び組織特異的なin vivo遺伝子発現系の確立

Research Project

Project/Area Number 23K14115
Research Category

Grant-in-Aid for Early-Career Scientists

Allocation TypeMulti-year Fund
Review Section Basic Section 42040:Laboratory animal science-related
Research InstitutionKeio University

Principal Investigator

足立 晴彦  慶應義塾大学, 政策・メディア研究科(藤沢), 特任助教 (90965443)

Project Period (FY) 2023-04-01 – 2026-03-31
Project Status Granted (Fiscal Year 2023)
Budget Amount *help
¥4,680,000 (Direct Cost: ¥3,600,000、Indirect Cost: ¥1,080,000)
Fiscal Year 2025: ¥1,560,000 (Direct Cost: ¥1,200,000、Indirect Cost: ¥360,000)
Fiscal Year 2024: ¥1,040,000 (Direct Cost: ¥800,000、Indirect Cost: ¥240,000)
Fiscal Year 2023: ¥2,080,000 (Direct Cost: ¥1,600,000、Indirect Cost: ¥480,000)
Keywordsゲノムシークエンス / ミナミヌマエビ / ゲノム
Outline of Research at the Start

本研究では、透明な小型淡水エビ(ミナミヌマエビ)について、新規実験動物として確立させるため、遺伝学的ツールの拡充を行う。申請者はミナミヌマエビにおいて蛍光試薬を用いたin vivoライブイメー ジング系を確立しつつある。一方で、ミナミヌマエビはいわゆる非モデル生物であり、遺伝学的なツールは揃っていない。そこで、本研究では、ミナミヌマエビの全ゲノムシーケンス及 びアセンブリを行い、それに基づいて、恒常的及び発生段階・組織特異的に機能するプロモーター、エンハンサーを同定することで、遺伝子発現制御が可能なツールの作製に繋げることを目的とする。

Outline of Annual Research Achievements

本研究では、ライブイメージングをはじめとした、種々の細胞学的実験への応用が期待されている、カワリヌマエビにおいて、in vivo遺伝子発現系の確立を目指している。遺伝子発現系の確立に必要なゲノム情報を得るために、本年度は、ナノポアシークエンサーPromethION(Oxford Nanopore Technologies)を用いて、ロングリードシークエンスを行った。3回のシークエンスを行うことで、30xに近いカバレッジのリードセットが得られ、それを用いてアセンブルを行うことで、ドラフトゲノムの獲得に成功した。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

1: Research has progressed more than it was originally planned.

Reason

今後の展開に重要なドラフトゲノムを獲得できたため。

Strategy for Future Research Activity

今後は、これまで研究で獲得されたドラフトゲノム情報を用いて、特定の遺伝子の5'上流配列をクローニングし、蛍光レポーターとともにコンストラクトを作製、および個体への導入を行うことで、in vivo遺伝子発現系の確立を目指す。

Report

(1 results)
  • 2023 Research-status Report
  • Research Products

    (2 results)

All 2024 2023

All Journal Article (1 results) (of which Open Access: 1 results) Presentation (1 results)

  • [Journal Article] Post-embryonic tail development through molting of the freshwater shrimp<i>Neocaridina denticulata</i>2024

    • Author(s)
      Adachi Haruhiko、Moritoki Nobuko、Shindo Tomoko、Arakawa Kazuharu
    • Journal Title

      bioRxiv

      Volume: -

    • DOI

      10.1101/2024.03.13.583832

    • Related Report
      2023 Research-status Report
    • Open Access
  • [Presentation] カワリヌマエビの脱皮を介した尾形成2023

    • Author(s)
      足立晴彦、盛一伸子、信藤知子、荒川和晴
    • Organizer
      第46回日本分子生物学会年会
    • Related Report
      2023 Research-status Report

URL: 

Published: 2023-04-13   Modified: 2024-12-25  

Information User Guide FAQ News Terms of Use Attribution of KAKENHI

Powered by NII kakenhi