| Project/Area Number |
23K14127
|
|---|
| Research Category |
Grant-in-Aid for Early-Career Scientists
|
| Allocation Type | Multi-year Fund |
|---|
| Review Section |
Basic Section 43010:Molecular biology-related
|
|---|
| Research Institution | Okinawa Institute of Science and Technology Graduate University |
|---|
Principal Investigator |
佐古 博皓 沖縄科学技術大学院大学, 細胞シグナルユニット, ポストドクトラルスカラー (80793570)
|
|---|
| Project Period (FY) |
2023-04-01 – 2026-03-31
|
| Project Status |
Granted (Fiscal Year 2023)
|
| Budget Amount *help |
¥4,680,000 (Direct Cost: ¥3,600,000、Indirect Cost: ¥1,080,000)
Fiscal Year 2025: ¥910,000 (Direct Cost: ¥700,000、Indirect Cost: ¥210,000)
Fiscal Year 2024: ¥1,430,000 (Direct Cost: ¥1,100,000、Indirect Cost: ¥330,000)
Fiscal Year 2023: ¥2,340,000 (Direct Cost: ¥1,800,000、Indirect Cost: ¥540,000)
|
|---|
| Keywords | タンパク質分解 / protein truncation / プロテアソーム / タンパク質の多様性 / 翻訳速度 / 新生鎖 |
|---|
| Outline of Research at the Start |
リボソームの局所的な翻訳速度は，新生タンパク質のERへの転座と関連する重要因子である．本研究では，miRNAによるリボソームの翻訳速度の低下が，タンパク質のERもしくはミトコンドリアへの転座に寄与しているという概念を検討する．このため以下の３つの研究課題を遂行する：①miRNAによるリボソームの局所的な速度低下の網羅的な解析②miRNAによりERやミトコンドリアへの転座が調節されている可能性のあるタンパク質のスクリーニング③miRNAによる翻訳速度低下とタンパク質の転座効率との因果関係の検証
|
| Outline of Annual Research Achievements |
今年度は、当初の想定を上回る興味深いデータが得られた。転座調節と翻訳に関するタンパク質を検討していたところ、あるタンパク質のバリアントが、alternative splicing/translation非依存的かつプロテアソーム分解依存的にマウスの各組織で発現していることがわかった。
|
| Current Status of Research Progress |
Current Status of Research Progress
1: Research has progressed more than it was originally planned.
Reason
当初の想定を上回る興味深いデータが得られたため。
|
| Strategy for Future Research Activity |
当初の研究計画を部分的に変更し、マウス各組織に発現する異なるタンパク質のバリアントがどのようにプロテアソーム分解依存的に発現するのか、そのメカニズムを検討する。
具体的には、当該タンパク質をモデルにしたプロテアソーム分解依存的にバリアントが産生されるレポーターを作成し、CRISPRノックアウトスクリーニングによってどの遺伝子が関与しているのか検討する。また、マウス各組織のRNA-Seqデータを利用し、当該タンパク質のバリアントと相関するような発現パターンを示す遺伝子も検討する。
|
