胆汁中cfDNAを用いた次世代ゲノムシーケンスによるIPNB type分類の分子病理学的解析

• Project/Area Number: 23K15003
• Research Category: Grant-in-Aid for Early-Career Scientists
• Allocation Type: Multi-year Fund
• Review Section: Basic Section 53010:Gastroenterology-related
• Research Institution: Yamagata University
• Principal Investigator: 小林 敏一 山形大学, 医学部, 助教 (60772944)
• Project Period (FY): 2023-04-01 – 2026-03-31
• Project Status: Granted (Fiscal Year 2023)
• Budget Amount: ¥4,680,000 (Direct Cost: ¥3,600,000、Indirect Cost: ¥1,080,000); Fiscal Year 2025: ¥1,560,000 (Direct Cost: ¥1,200,000、Indirect Cost: ¥360,000); Fiscal Year 2024: ¥1,040,000 (Direct Cost: ¥800,000、Indirect Cost: ¥240,000); Fiscal Year 2023: ¥2,080,000 (Direct Cost: ¥1,600,000、Indirect Cost: ¥480,000)
• Keywords: IPNB / ゲノムシーケンス

Outline of Research at the Start

胆管内乳頭状腫瘍(IPNB)は、胆管内腔に乳頭状の発育を示す一群の胆管上皮性腫瘍で、臨床的には粘液を産生する腫瘍であり、膵管内乳頭粘液性腫瘍(IPMN)に病理学的に類似する病変とされる。しかし、病理学的特徴や従来の胆道癌との違いなどでまだ分類に課題が多く、病理組織学的特徴から2つのtypeに分類されることが提唱された。この分類はまだ新しい分類であり、臨床的特徴や病理的特徴は現在も様々な施設で検討されている。本研究では、IPNB症例の胆汁からcfDNAを抽出し、ゲノムシーケンスを施行して遺伝子変異を解析し、内科的な視点からIPNBのtype分類の特徴を分子病理学的視点で解析する。

Outline of Annual Research Achievements

ERCPを施行し、内科的精査を施行した後に外科にて手術を施行されるIPNB症例が年間5例と計画していたが、新規のIPNB症例は想定より圧倒的に少ない状況であり、昨年2023年度はIPNB疑い症例で2例であった。いずれの症例でもERCPにて胆汁を回収し、cfDNA抽出には成功している。

Current Status of Research Progress

4: Progress in research has been delayed.

Reason

上述したように、ERCPを施行し内科的精査を施行した後に外科にて手術を施行されるIPNB症例が年間5例と計画していたが、新規のIPNB症例は想定より圧倒的に少ない状況であり、昨年2023年度はIPNB疑い症例で2例であった。いずれの症例でもERCPにて胆汁を回収し、cfDNA抽出には成功している。

Strategy for Future Research Activity

採取した胆汁からのcfDNA抽出は定性定量ともに良好な結果であった。そのため、まずは症例の蓄積を引き続きおこなっていうこととなる。cfDNAはある程度数がまとまった際には次世代シーケンサーによるゲノム解析を行っていく予定である。
採取方法としては、ERCP時・経鼻胆管ドレナージチューブからの胆汁(ENBD胆汁)、術後検体から直接回収した胆汁(術後検体胆汁)など、異なるシチュエーションでの胆汁採取も検討している。