Project/Area Number |
23K15533
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Research Category |
Grant-in-Aid for Early-Career Scientists
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Allocation Type | Multi-year Fund |
Review Section |
Basic Section 55020:Digestive surgery-related
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Research Institution | Aichi Cancer Center Research Institute |
Principal Investigator |
浅野 智成 愛知県がんセンター(研究所), 分子診断TR分野, 研究員 (20973978)
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Project Period (FY) |
2023-04-01 – 2026-03-31
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Project Status |
Granted (Fiscal Year 2023)
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Budget Amount *help |
¥4,680,000 (Direct Cost: ¥3,600,000、Indirect Cost: ¥1,080,000)
Fiscal Year 2025: ¥1,690,000 (Direct Cost: ¥1,300,000、Indirect Cost: ¥390,000)
Fiscal Year 2024: ¥1,430,000 (Direct Cost: ¥1,100,000、Indirect Cost: ¥330,000)
Fiscal Year 2023: ¥1,560,000 (Direct Cost: ¥1,200,000、Indirect Cost: ¥360,000)
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Keywords | 膵癌 / 患者由来細胞 / CRISPR-Cas9 / 機能スクリーニング / ジェムシタビン / パクリタキセル / 細胞表面タンパク質 / プロテオミクス / ジェムシタビン・ナブパクリタキセル 併用療法 / 患者由来細胞株 |
Outline of Research at the Start |
膵癌は、もっとも予後が不良な固形癌の一つである。進行期膵癌に対しては、GnP療法とFOLFIRINOX療法が第一選択となる化学療法であるが、予後の大きな改善にはつながっておらず、革新的なアプローチによって膵癌の克服に取り組む必要がある。本研究では、膵癌患者由来細胞株(PDC)を用いてCRISPR-Cas9システムによるゲノムワイド機能スクリーニングを行い、GnP療法の感受性に関与する分子を網羅的に捕捉する。これにより、GnP療法耐性に重要な分子機構を解明し、特に抗体医薬の標的となる細胞表面タンパク質分子に着目してGnP療法にシナジーを示す新規分子標的治療法を開発する。
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Outline of Annual Research Achievements |
膵癌は、もっとも予後が不良な固形癌の一つである。進行期膵癌に対しては、GnP療法とFOLFIRINOX療法が第一選択となる化学療法であるが、予後の大きな改善にはつながっておらず、革新的なアプローチによって膵癌の克服に取り組む必要がある。本研究では、膵癌患者由来細胞株(PDC)を用いてCRISPR-Cas9システムによるゲノムワイド機能スクリーニングを行い、GnP療法の感受性に関与する分子を網羅的に捕捉する。これにより、GnP療法耐性に重要な分子機構を解明し、特に抗体医薬の標的となる細胞表面タンパク質分子に着目してGnP療法にシナジーを示す新規分子標的治療法を開発する。本年度は、ジェムシタビン、パクリタキセルに耐性を示す膵癌PDCにCas-9を強制発現させたのちに、CRISPR knockout pooled library (GeCKO v2)を用いたゲノムワイド機能スクリーニングを行った。やや導入効率が低かったことから、プロトコルの最適化を再度行うのと並行して、機能スクリーニングから同定されたジェムシタビン、またはパクリタキセルと合成致死を示す遺伝子群について機能的な解析を行っている。また、スクリーニングに用いたPDCのエクソーム解析、RNAシーケンス解析、細胞表面タンパク質解析を含むプロテオーム解析に加えて、正常膵組織のRNAシーケンス解析を進めている。
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Current Status of Research Progress |
Current Status of Research Progress
1: Research has progressed more than it was originally planned.
Reason
ジェムシタビン、パクリタキセルに耐性を示す膵癌PDCにCas-9を強制発現させ、CRISPR knockout pooled library (GeCKO v2)を用いたゲノムワイド機能スクリーニングを行った。同定されたジェムシタビン、またはパクリタキセルと合成致死を示す遺伝子群について、機能的な解析を現在行っている。また、スクリーニングに用いたPDCのエクソーム解析、RNAシーケンス解析、細胞表面タンパク質解析を含むプロテオーム解析に加えて、正常膵組織のRNAシーケンス解析を進めている。
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Strategy for Future Research Activity |
標的遺伝子について、PDCや膵癌細胞株を用いてin vitroでその機能的重要性や制御機構について検討し、さらにPDXモデルを用いてin vivoでの検証実験を行う。また、ELISA、免疫組織学的染色などを用いたアッセイを確立し、組織・血液検体での検出を試みるとともに、GnP療法の治療効果予測バイオマーカーとしての有用性について検討する。
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