Project/Area Number |
23K15903
|
Research Category |
Grant-in-Aid for Early-Career Scientists
|
Allocation Type | Multi-year Fund |
Review Section |
Basic Section 56060:Ophthalmology-related
|
Research Institution | Chiba University |
Principal Investigator |
吉原 正仁 千葉大学, 大学院医学研究院, 准教授 (70807065)
|
Project Period (FY) |
2023-04-01 – 2025-03-31
|
Project Status |
Granted (Fiscal Year 2023)
|
Budget Amount *help |
¥4,550,000 (Direct Cost: ¥3,500,000、Indirect Cost: ¥1,050,000)
Fiscal Year 2024: ¥1,170,000 (Direct Cost: ¥900,000、Indirect Cost: ¥270,000)
Fiscal Year 2023: ¥3,380,000 (Direct Cost: ¥2,600,000、Indirect Cost: ¥780,000)
|
Keywords | プロテオーム / 増殖性硝子体網膜症 / バイオマーカー / 機械学習 / 硝子体蛋白 |
Outline of Research at the Start |
増殖性硝子体網膜症 (Proliferative vitreoretinopathy; PVR)は、網膜剥離の術後や眼外傷により眼内に増殖膜が形成され、牽引性網膜剥離を来たす非常に難治な疾患である。現時点での唯一の治療法は手術であるが、その視力予後は不良である。 本研究では、重症度の異なるPVR患者から硝子体液を採取し、プロテオーム解析により硝子体蛋白の網羅的プロファイリングを行い、PVRの発症・進展に関与する蛋白を同定することを目的とする。これらの蛋白は治療標的の候補となりうるため、新規薬物治療開発に繋がり、将来、多くのPVR患者の予後改善に貢献することが期待される。
|
Outline of Annual Research Achievements |
本研究は、重症度の異なる増殖性硝子体網膜症 (Proliferative vitreoretinopathy; PVR)患者から硝子体液を採取し、高深度プロテオーム解析によってPVRの発症・進展に関与する蛋白を同定することで、PVRの病態の解明および治療標的の探索を目的とする。
初年度となる当該年度は、千葉大学大学院医学研究院 眼科学教室の協力のもと、網膜硝子体手術に際し、硝子体液の採取を行った。正常コントロールとして、眼内レンズ偏位症例を使用した。当初予定していた、軽度・重度PVR症例を含む合計約40症例の検体を回収を完了した。
さらに、予備検討として、ヘルシンキ大学(フィンランド)のVarjosaloグループから、 既報の網膜剥離のプロテオーム解析の非公開生データ (Ohman et al., Sci Rep. 2021)を入手し、PVR症例で特異的に高発現する蛋白を同定した。ヒト網膜組織のシングルセルRNA-seqデータ (Liang et al., Nat Commun. 2019)の再解析により、細胞種特異的遺伝子を同定し、このデータを用いて、PVRで高発現する蛋白が網膜内のどの細胞種由来であるか、検討を行った。既報では検出された蛋白数が少なかったため、有意な結果は得られなかったが、本研究では高深度プロテオーム解析を用いることで、より多くの蛋白が検出されることが期待される。
|
Current Status of Research Progress |
Current Status of Research Progress
3: Progress in research has been slightly delayed.
Reason
研究開始時には、2023年度内にプロテオーム定量を開始する予定であったが、正常コントロール検体の回収に時間を要したため、次年度にプロテオーム定量を行うこととなった。2023年度末に、既に予定していた検体数の回収を完了しており、近日中にプロテオーム定量を行う予定である。
|
Strategy for Future Research Activity |
プロテオーム定量の結果が得られ次第、解析を開始する。臨床情報との統合解析により、PVRの発症・進展に関与する蛋白を同定し、さらには予後予測マーカーの同定や実験的検証、治療薬候補の探索を予定している。
|