| Project/Area Number |
23K16142
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| Research Category |
Grant-in-Aid for Early-Career Scientists
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| Allocation Type | Multi-year Fund |
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| Review Section |
Basic Section 57060:Surgical dentistry-related
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| Research Institution | Chiba University |
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Principal Investigator |
駒 綾香 千葉大学, 大学院医学研究院, 特任助教 (60963098)
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| Project Period (FY) |
2023-04-01 – 2025-03-31
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| Project Status |
Granted (Fiscal Year 2023)
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| Budget Amount *help |
¥4,550,000 (Direct Cost: ¥3,500,000、Indirect Cost: ¥1,050,000)
Fiscal Year 2024: ¥2,470,000 (Direct Cost: ¥1,900,000、Indirect Cost: ¥570,000)
Fiscal Year 2023: ¥2,080,000 (Direct Cost: ¥1,600,000、Indirect Cost: ¥480,000)
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| Keywords | スーパーエンハンサー / オープンクロマチン / ATAC-seq / Chip-seq / OSCC / 機能性RNA / マイクロRNA / セツキシマブ |
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| Outline of Research at the Start |
細胞は、自分自身の運命を決定する極めて重要な場面において、「スーパーエンハンサー」（SE）と定義される強力な転写制御領域をゲノム上に形成し、細胞の生死に関わる「マスター分子」を強力に発現させる事が明らかになった. この概念を癌細胞の治療抵抗性獲得機序に当てはめ、癌細胞は抗癌剤などの薬剤に暴露された際に、自らの生存を賭けてSEを形成し、治療抵抗獲得に不可欠な「マスター分子」を発現させると考えられる.
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| Outline of Annual Research Achievements |
本申請研究では、OSCC細胞に放射線照射や抗癌剤を暴露させた際に形成されるスーパーエンハンサー（SE）などのゲノム領域を同定し、申請者がこれまでに作成している「OSCC機能性RNA発現プロファイル」と、SEなどのゲノム情報を統合することで、治療抵抗性に関与する「マスター分子」を同定することを目的としている。本年度は、抗癌剤（セツキシマブ）抵抗性に関与するSEや放射線抵抗性に関与するオープンクロマチン領域、抗癌剤（シスプラチン）作用時間によって変化するオープンクロマチン領域をOSCC細胞で同定した。
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| Current Status of Research Progress |
Current Status of Research Progress
2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.
Reason
OSCC細胞において、BRD4やH3K27ac抗体を用いてセツキシマブ（CTX）抵抗性に関与するSE領域を同定した。また、OSCC細胞における放射線抵抗性・感受性に関与するオープンクロマチン領域をATAC－seq解析で同定した。さらに、シスプラチン(CDDP)を作用させて、時間経過（６H、２４H）と共に形成されるオープンクロマチン領域についてもOSCC細胞で同定した。申請者が以前の研究で作成した「HNSCC/OSCC機能性RNA発現プロファイル」と、CDDPや放射線暴露時のオープンクロマチン領域もしくはCTX関連のSE領域の情報を統合し、抗癌剤や放射線抵抗性に関与する「機能性RNA分子」の候補を探索している。
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| Strategy for Future Research Activity |
候補となった「機能性RNA分子」について、The Cancer Genome Atlas (TCGA)データベース解析を行い、癌組織における発現や、臨床病理学的解析を行い、更なる絞り込みを行う。さらに、遺伝子改変OSCC細胞を作製し、各種抗癌剤や放射線に対する感受性が変化するか、検討する。
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