Development of dropletomics that clarifies transcriptional regulation under liquid-liquid phase separation

• Project/Area Number: 23K17439
• Research Category: Grant-in-Aid for Challenging Research (Pioneering)
• Allocation Type: Multi-year Fund
• Review Section: Medium-sized Section 57:Oral science and related fields
• Research Institution: Okayama University
• Principal Investigator: 久保田 聡 岡山大学, 医歯薬学域, 教授 (90221936)
• Co-Investigator(Kenkyū-buntansha): 西田 崇 岡山大学, 医歯薬学域, 准教授 (30322233) ; 服部 高子 岡山大学, 医歯薬学域, 助教 (00228488) ; 高江洲 かずみ (河田かずみ) 岡山大学, 医歯薬学域, 助教 (10457228) ; 滝川 正春 岡山大学, 医歯薬学域, 教授 (20112063) ; 青山 絵理子 岡山大学, 医歯薬学域, 助教 (10432650) ; 大野 充昭 岡山大学, 医歯薬学域, 准教授 (60613156)
• Project Period (FY): 2023-06-30 – 2027-03-31
• Project Status: Granted (Fiscal Year 2023)
• Budget Amount: ¥25,740,000 (Direct Cost: ¥19,800,000、Indirect Cost: ¥5,940,000); Fiscal Year 2026: ¥5,460,000 (Direct Cost: ¥4,200,000、Indirect Cost: ¥1,260,000); Fiscal Year 2025: ¥4,940,000 (Direct Cost: ¥3,800,000、Indirect Cost: ¥1,140,000); Fiscal Year 2024: ¥5,850,000 (Direct Cost: ¥4,500,000、Indirect Cost: ¥1,350,000); Fiscal Year 2023: ¥9,490,000 (Direct Cost: ¥7,300,000、Indirect Cost: ¥2,190,000)
• Keywords: LLPS / gene regulation / CCN2 / lncRNA / droplet

Outline of Research at the Start

核内では、共通の分子を使いながら別個の転写制御が混乱なく行なわれるが、なぜそれが可能なのか長きにわたり謎であった。そして最近、液・液相分離によって形成されるドロップレット(液滴)が変幻自在の小部屋を核内に提供し、その中で個々の転写が独立性を保ちつつ起こることが判ってきた。液滴形成には特殊なタンパク質とRNAが重要だが、液滴を分離・解析することは難しい。この状況を打開するため、本研究では転写の場としての液滴の現状と、液滴形成の制御機構を網羅的に解明できる方法の確立に挑戦する。より具体的には、相分離を介した長鎖非コードRNAによる遺伝子発現制御機構を解明するための新戦略の開拓を目指す。