| Project/Area Number |
23K17514
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| Research Category |
Grant-in-Aid for Challenging Research (Exploratory)
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| Allocation Type | Multi-year Fund |
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| Review Section |
Medium-sized Section 3:History, archaeology, museology, and related fields
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| Research Institution | Kyushu University (2024)
The Graduate University for Advanced Studies (2023) |
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Principal Investigator |
澤藤 りかい 九州大学, 比較社会文化研究院, 講師 (50814612)
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| Project Period (FY) |
2023-06-30 – 2026-03-31
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| Project Status |
Granted (Fiscal Year 2024)
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| Budget Amount *help |
¥6,500,000 (Direct Cost: ¥5,000,000、Indirect Cost: ¥1,500,000)
Fiscal Year 2024: ¥3,510,000 (Direct Cost: ¥2,700,000、Indirect Cost: ¥810,000)
Fiscal Year 2023: ¥2,990,000 (Direct Cost: ¥2,300,000、Indirect Cost: ¥690,000)
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| Keywords | 古代DNA / 動植物DNA / メタゲノム / 歯石 / 土壌 / 文化財 |
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| Outline of Research at the Start |
本研究では、古代のメタゲノムサンプル（歯石・土壌など様々な生物のゲノムを含む試料）から動植物の分類群の確実な同定を行う。特に動植物に関しては、食物や環境など得られる情報が多い一方で、確実な分類群の同定は現段階で難しい側面がある。DNAの濃縮を組み合わせ、古代DNAの特徴（デアミネーション）を確認することで、動物・植物の確実な同定を行い、花粉分析や炭化物の種同定と同程度の信頼性を持つ種同定を目指す。また、この手法を様々な試料に応用することで、食物や古環境のより詳細な復元が可能になり、考古学や文化財科学、人類学などの分野に貢献できると考えられる。
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| Outline of Annual Research Achievements |
近年、さまざまな資料からDNA分析が可能になっており、特に歯石や土壌などさまざまな動 植物のDNAが含まれるメタゲノムサンプルを分析することで、過去の食物や環境が明らかに なりつつある。一方で、これらの資料において、動植物の確実な同定を行うことは難しく 、特に日本のような動植物の種類が豊富な地域では困難を伴う。本研究では、DNAの濃縮を 組み合わせ、古代DNAの特徴(デアミネーション)を確認することで、動物・植物の確実な 同定を行い、花粉分析や炭化物の種同定と同程度の信頼性を持つ種同定を目指す。また、 この手法を様々な試料に応用することで、食物や古環境のより詳細な復元が可能になり、 考古学や文化財科学、人類学などの分野に貢献できると考えられる。
当該年度においては、ショットガンシーケンスを用いた、特にミトコンドリアと葉緑体の動植物の同定の解析手法についてクライテリアの作成を行なった。複数の遺跡から得られた土壌DNA解析の結果を比較し、確実性の高いクライテリアの基準を作成することができた。来年度はそれを核ゲノムに拡張し、そちらでもフィルタリングやクライテリアの設定を行い、確実性の高い同定を行うことを試みる。
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| Current Status of Research Progress |
Current Status of Research Progress
3: Progress in research has been slightly delayed.
Reason
代表者が2024年9月までデンマークにおいて研究を行っており、その後九州大学に異動したため、解析に十分な時間が取れなかった。またデータ解析の方法を改良したため、解析自体にも時間がかかるようになった。そのような経緯もあり、研究期間の延長を申請した。
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| Strategy for Future Research Activity |
来年度は今までの手法を核ゲノムに拡張し、そちらでもフィルタリングやクライテリアの設定を行い、確実性の高い同定を行うことを試みる。
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