タンパク質複合体の立体構造と機械学習によるゲノムに潜む免疫ペプチドの網羅的探索

Research Project

Project/Area Number	23K18030
Research Category	Grant-in-Aid for Challenging Research (Exploratory)
Allocation Type	Multi-year Fund
Review Section	Medium-sized Section 39:Agricultural and environmental biology and related fields
Research Institution	Okayama University
Principal Investigator	河野洋治岡山大学, 資源植物科学研究所, 教授 (00406175)
Co-Investigator(Kenkyū-buntansha)	児嶋長次郎横浜国立大学, 大学院工学研究院, 教授 (50333563)
Project Period (FY)	2023-06-30 – 2025-03-31
Project Status	Granted (Fiscal Year 2023)
Budget Amount *help	¥6,500,000 (Direct Cost: ¥5,000,000、Indirect Cost: ¥1,500,000) Fiscal Year 2024: ¥3,250,000 (Direct Cost: ¥2,500,000、Indirect Cost: ¥750,000) Fiscal Year 2023: ¥3,250,000 (Direct Cost: ¥2,500,000、Indirect Cost: ¥750,000)
Keywords	機械学習 / サイトカイン / 立体構造予測
Outline of Research at the Start	これまでの相互作用推定は、ドメイン構造などの一次配列を用いられてきたが、立体構造情報により相互作用予測ができれば、未知の相互作用分子や相互作用モチーフが推定できる。Googleによって開発されたタンパク質立体構造予測プログラムAlphaFold2は、サイエンス界のゲームチェンジャーとなった。AlphaFold2は、実験を行うことなしにタンパク質の立体構造予測が可能である。AlphaFoldを用いた立体構造予測を基盤とした新奇タンパク質相互作用同定法を確立できれば、学術体系を大きく変革転換させるような成果を生み出すことを試みる。