| Project/Area Number |
23K18047
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| Research Category |
Grant-in-Aid for Challenging Research (Exploratory)
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| Allocation Type | Multi-year Fund |
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| Review Section |
Medium-sized Section 40:Forestry and forest products science, applied aquatic science, and related fields
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| Research Institution | Shizuoka University |
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Principal Investigator |
平井 浩文 静岡大学, グローバル共創科学部, 教授 (70322138)
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| Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) |
中村 彰彦 静岡大学, 農学部, 准教授 (20752968)
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| Project Period (FY) |
2023-06-30 – 2025-03-31
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| Project Status |
Granted (Fiscal Year 2023)
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| Budget Amount *help |
¥6,370,000 (Direct Cost: ¥4,900,000、Indirect Cost: ¥1,470,000)
Fiscal Year 2024: ¥2,990,000 (Direct Cost: ¥2,300,000、Indirect Cost: ¥690,000)
Fiscal Year 2023: ¥3,380,000 (Direct Cost: ¥2,600,000、Indirect Cost: ¥780,000)
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| Keywords | 白色腐朽菌 / リグニン / 3-ヒドロキシアジピン酸 / バイオリファイナリー / 高活性リグニン分解菌 / アジピン酸誘導体 / 低分子リグニン / 分子育種 |
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| Outline of Research at the Start |
高活性リグニン分解菌における低分子リグニン代謝を改良し、HMAをHEAへと還元するHMA reductaseを改変しHEA reductaseを創出し、さらにHEA CoA transferase遺伝子をノックアウトすることで、HAAを高産生する株の分子育種を行う。
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| Outline of Annual Research Achievements |
(1) 3-hydroxyhex-2-enedioic acid（HEA） CoA transferase遺伝子ノックダウン株の作出
3-ヒドロキシアジピン酸（3-HAA）を高蓄積させるには、Phanerochaete sordida YK-624株が有するHEA CoA transferase遺伝子のノックアウト/ノックダウンが必要不可欠である。今回、本酵素がCoA transferaseであることから、ノックアウトすることで一次代謝系にダメージを与える影響を懸念し、RNAi法によるノックダウンシステムの構築を試みた。本年度は、HEA CoA transferase遺伝子ノックダウンプラスミドの構築に成功した。
(2) HEA reductase（HEAR）の創出
HEARの創出にあたり、AlphaFold により3-hydroxymuconic acid（HMA) reductase（HMAR）の構造予測を行った結果、HEAを還元するためには、HMARの活性ポケットにおいてOH基が入るためのスペースを作る必要が予測された。つまり、HMARにおいて、アミノ酸置換〔 (i) T152S、(ii) L255V or T〕を施す必要が予測されたため、① T152S+L255V、② T152S+L255T、をそれぞれを発現するプラスミドを構築し、大腸菌による異種発現を行った。その結果、(1)及び(2)ともに可溶性タンパク質として取得した。その後、trihydroxybenzene (THB) dioxygenase、HMAR、①もしくは②を混合し、THBより3-HAAが生成するか試験した結果、HEAの生成が確認されたものの、3-HAAの生成は認められなかった。
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| Current Status of Research Progress |
Current Status of Research Progress
2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.
Reason
本研究のコアとなる実験である(1) HEA CoA transferase遺伝子ノックダウン株の作出においては、目的遺伝子ノックダウンプラスミドの構築まで終了しており、もう一つのコアとなる実験である(2) HEARの創出について、活性が発現すると思われる改変酵素の作成まで終了していることから、概ね順調に進展していると判断した。
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| Strategy for Future Research Activity |
今後は(2) HEARの創出について、重点的に研究を展開する。活性型HEARを創出すべく、T152及びL255について、その他のアミノ酸置換を実施し、活性が発現するアミノ酸を網羅的に検索する。その後、活性型HEAR遺伝子及び(1)で作成したノックダウンプラスミドを供試菌に導入し、3-HAAの産生挙動を解析する。
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