Development of carbohydrate force field to elucidate the mechanism of sugar chain interactions

Research Project

Project/Area Number	23K18510
Research Category	Grant-in-Aid for Challenging Research (Exploratory)
Allocation Type	Multi-year Fund
Review Section	Medium-sized Section 62:Applied informatics and related fields
Research Institution	University of Miyazaki
Principal Investigator	宇都卓也宮崎大学, 工学部, 准教授 (60749084)
Co-Investigator(Kenkyū-buntansha)	湯井敏文宮崎大学, 工学部, 教授 (50230610)
Project Period (FY)	2023-06-30 – 2026-03-31
Project Status	Granted (Fiscal Year 2023)
Budget Amount *help	¥6,500,000 (Direct Cost: ¥5,000,000、Indirect Cost: ¥1,500,000) Fiscal Year 2025: ¥2,210,000 (Direct Cost: ¥1,700,000、Indirect Cost: ¥510,000) Fiscal Year 2024: ¥2,210,000 (Direct Cost: ¥1,700,000、Indirect Cost: ¥510,000) Fiscal Year 2023: ¥2,080,000 (Direct Cost: ¥1,600,000、Indirect Cost: ¥480,000)
Keywords	糖鎖 / 立体構造 / 相互作用 / 力場パラメータ / 分子シミュレーション
Outline of Research at the Start	計算化学は、従来の「実験結果の説明」から「未知事象を予測」する段階に突入している。しかし、生体機能解析や材料物性予測などが関わる分子シミュレーション研究は未踏領域が数多い。本研究では、糖質関連物質の複雑な分子間相互作用を定量的に解析できなかった問題を、計算精度に依存する分子力場パラメータの開発と斬新な計算コンセプトによって解決する。分子シミュレーション技術の基盤構築によって、糖鎖における未知機能の解明や天然多糖材料の産業利用を推進することが期待される。