Research on the spatiotemporal modeling methods of soil and water metagenome data

• Project/Area Number: 23K18513
• Research Category: Grant-in-Aid for Challenging Research (Exploratory)
• Allocation Type: Multi-year Fund
• Review Section: Medium-sized Section 62:Applied informatics and related fields
• Research Institution: Sophia University
• Principal Investigator: 矢入 郁子 上智大学, 理工学部, 教授 (10358880)
• Co-Investigator(Kenkyū-buntansha): 平田 均 上智大学, 理工学部, 助教 (20266076) ; 岩澤 有祐 東京大学, 大学院工学系研究科(工学部), 講師 (70808336)
• Project Period (FY): 2023-06-30 – 2026-03-31
• Project Status: Granted (Fiscal Year 2023)
• Budget Amount: ¥6,370,000 (Direct Cost: ¥4,900,000、Indirect Cost: ¥1,470,000); Fiscal Year 2025: ¥1,950,000 (Direct Cost: ¥1,500,000、Indirect Cost: ¥450,000); Fiscal Year 2024: ¥2,210,000 (Direct Cost: ¥1,700,000、Indirect Cost: ¥510,000); Fiscal Year 2023: ¥2,210,000 (Direct Cost: ¥1,700,000、Indirect Cost: ¥510,000)
• Keywords: Metagenome / Microbiome / Soil / Water / 機械学習

Outline of Research at the Start

本研究は，SDGsの15.陸の豊かさを守る，6.安全な水への貢献を目的に，微生物叢ビッグデータの解析を通して，以下を開拓することを目的とする．
(i)水・土壌の微生物叢ビッグデータの時空間分析アルゴリズムの開拓
(ii)河川流域の表層水の微生物叢ビッグデータモデルの開拓
(iii)土壌環境再生手法提言のための微生物叢ビッグデータモデルの開拓
本研究の成果は，異分野融合(生物学・情報学・数学)を通して，社会的重要性の高いSDGs課題に貢献する新しいバイオインフォマティクスの手法の実現に貢献する．