Research Project
Grant-in-Aid for Research Activity Start-up
ゲノムの大きな構造変異は従来のショートリードのNGSデータでは検出が難しく、データ駆動型育種をはじめとして、その利用は困難なままであった。しかし、近年ロングリードのNGSによるデータが集積し始めたことにより、その検出が容易になりつつある。カンキツは少数の祖先品種のゲノムが複雑に組み合わさり、その後代の品種に受け継がれているため、ゲノムの構造変異の利用価値が高く、また、変異のパターンも比較的限られていると考えられる。このことから、カンキツの祖先品種ゲノムにおいて大きな挿入・欠失変異を網羅的に検出し、育種等に利用可能なDNAマーカー作成の情報基盤を整備することを本研究の目的とした。
