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光遺伝学の未来を拓く新規チャネルロドプシンにおけるチャネル開閉メカニズムの解明

Research Project

Project/Area Number 23K19342
Research Category

Grant-in-Aid for Research Activity Start-up

Allocation TypeMulti-year Fund
Review Section 0701:Biology at molecular to cellular levels, and related fields
Research InstitutionThe University of Tokyo

Principal Investigator

柴田 桂成  東京大学, 物性研究所, 特任研究員 (40983929)

Project Period (FY) 2023-08-31 – 2025-03-31
Project Status Granted (Fiscal Year 2023)
Budget Amount *help
¥2,860,000 (Direct Cost: ¥2,200,000、Indirect Cost: ¥660,000)
Fiscal Year 2024: ¥1,430,000 (Direct Cost: ¥1,100,000、Indirect Cost: ¥330,000)
Fiscal Year 2023: ¥1,430,000 (Direct Cost: ¥1,100,000、Indirect Cost: ¥330,000)
Keywordsチャネルロドプシン / 振動分光 / ダイナミクス / 時間分解分光
Outline of Research at the Start

チャネルロドプシン(ChR)は光受容イオンチャネルとして機能し、光遺伝学の中心的なツールとして注目されている。しかし、チャネル開閉メカニズムはほとんど明らかになっていない。そのため、イオン輸送特性の改良が進まず、光遺伝学の適用範囲は限定されている。開閉メカニズムの解明には、ChRの構造情報が欠かせない。そこで、光遺伝学への応用に適したChRの開閉メカニズムを、その構造変化を明らかにすることで解明する。メカニズム解明により、ChRに関する基礎的な理解が深まるだけでなく、輸送特性改良に向けた指針も得られる。

Outline of Annual Research Achievements

チャネルロドプシン(ChR)は、7本の膜貫通ヘリックスと発色団であるレチナールを有する光受容イオンチャネルである。ChRは、光により神経細胞の興奮状態を操作する光遺伝学の中心的なツールであり、神経科学や脳神経疾患の治療法開発に欠かせない。しかし光遺伝学の発展に反して、ChRのチャネル開閉メカニズムは未解明である。そのため、イオン輸送量や透過イオン選択性の改良が進まず、光遺伝学の適応範囲は限定されている。
開閉メカニズムの解明には、構造情報が欠かせない。ChRの構造測定には、X線結晶構造解析が主として用いられてきた。しかし、結晶化に伴うタンパク質のパッキングにより、最も重要なチャネル開口時や、それ以降における構造を測定することはできていない。そこで私は、結晶化が不要で生理的な環境に近い条件下で構造変化を測定できる振動分光法に注目してきた。
2023年度は、陽イオンの輸送量が多く、光遺伝学への応用に適したChRであるChRmineや、陰イオンを輸送するGtACR1を対象に、時間分解共鳴ラマン測定を行った。その結果、これらChRにおけるイオン輸送経路や、レチナールの構造変化がチャネル開閉にどのように寄与しているのかを明らかにすることに成功した。
その一方で、一価の陽イオンのみを輸送するなど、イオン選択性に関するメカニズムには未解明な点が多い。イオン選択性を生み出すメカニズムを明らかにすることで、例えば光遺伝学で従来用いられてきたChRに対してイオン選択性を新たに付与するための指針を得られれば、光遺伝学による細胞活動操作により多くの自由度を与えることができると見込まれる。
そこで今後は、一価の陽イオンのみを輸送するChRを対象とし、その構造変化を振動分光法を用いて明らかにすることで、イオン選択性を生み出すメカニズムを解明することを計画している。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.

Reason

これまでに陽イオンの輸送量が多く、光遺伝学への応用に適したChRであるChRmineや、陰イオンを輸送するGtACR1を対象に、時間分解共鳴ラマン測定を行った。その結果、これらChRにおけるイオン輸送経路や、レチナールの構造変化がチャネル開閉にどのように寄与しているのかを明らかにすることに成功した。これらは、ChRにおけるチャネル開閉メカニズムの解明に貢献するだけでなく、より輸送性能の優れたChRの設計・開発にも繋がる。上記の見解より、本研究課題の進捗状況として概ね順調に進展していると評価する。

Strategy for Future Research Activity

これまでの研究より、ChRにおけるイオン輸送経路の位置やチャネル開閉の駆動力に関する知見は得られつつある。その一方で、一価の陽イオンのみを輸送するなど、イオン選択性に関するメカニズムには未解明な点が多い。イオン選択性を生み出すメカニズムを明らかにすることで、例えば光遺伝学で従来用いられてきたChRに対してイオン選択性を新たに付与するための指針を得られれば、光遺伝学による細胞活動操作により多くの自由度を与えることができると見込まれる。
そこで今後は、イオン選択性を有するChRを対象とし、その構造変化を振動分光法を用いて明らかにすることで、イオン選択性を生み出すメカニズムを解明することを計画している。

Report

(1 results)
  • 2023 Research-status Report
  • Research Products

    (6 results)

All 2023

All Presentation (6 results) (of which Int'l Joint Research: 1 results)

  • [Presentation] Twisting and Protonation of Retinal Chromophore Regulate Channel Gating of Channelrhodopsin C1C22023

    • Author(s)
      Keisei Shibata, Kazumasa Oda, Tomohiro Nishizawa, Yuji Hazama, Ryohei Ono, Shunki Takaramoto, Reza Bagherzadeh, Hiromu Yawo, Osamu Nureki, Keiichi Inoue, Hidefumi Akiyama
    • Organizer
      8th Asian Spectroscopy Conference 2023
    • Related Report
      2023 Research-status Report
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Twisting and Protonation of Retinal Chromophore Regulate Channel Gating of Channelrhodopsin C1C22023

    • Author(s)
      Keisei Shibata, Kazumasa Oda, Tomohiro Nishizawa, Yuji Hazama, Ryohei Ono, Shunki Takaramoto, Reza Bagherzadeh, Hiromu Yawo, Osamu Nureki, Keiichi Inoue, Hidefumi Akiyama
    • Organizer
      第61回日本生物物理学会年会
    • Related Report
      2023 Research-status Report
  • [Presentation] レチナール発色団のねじれとプロトン化によるチャネルロドプシンC1C2のチャネル開閉制御2023

    • Author(s)
      柴田桂成, 小田和正, 西澤知宏, 挾間優治, 小野稜平, 寶本俊輝, Reza Bagherzadeh, 八尾寛, 濡木理, 井上圭一, 秋山英文
    • Organizer
      第17回分子科学討論会
    • Related Report
      2023 Research-status Report
  • [Presentation] チャネルロドプシンC1C2におけるレチナール発色団のねじれとプロトン化によるチャネル開閉メカニズム2023

    • Author(s)
      柴田桂成, 小田和正, 西澤知宏, 挾間優治, 小野稜平, 寶本俊輝, Reza Bagherzadeh, 八尾寛, 濡木理, 井上圭一
    • Organizer
      第78回日本物理学会年次大会
    • Related Report
      2023 Research-status Report
  • [Presentation] レチナール発色団のねじれとプロトン化によるチャネルロドプシンC1C2のチャネル開閉メカニズム2023

    • Author(s)
      柴田桂成, 小田和正, 西澤知宏, 挾間優治, 小野稜平, 寶本俊輝, Reza Bagherzadeh, 八尾寛, 濡木理, 井上圭一, 秋山英文
    • Organizer
      第8回フォトニクスワークショップ
    • Related Report
      2023 Research-status Report
  • [Presentation] カチオンチャネルロドプシンChRmineのイオン輸送メカニズム2023

    • Author(s)
      宝本 俊輝, 川﨑 佑真, 柴田 桂成, 岸 孝一郎, 加藤 英明, 井上 圭一
    • Organizer
      文科省・学際領域展開ハブ形成プログラム「マルチスケール量子-古典生命インターフェース研究コンソーシアム」キックオフシンポジウム
    • Related Report
      2023 Research-status Report

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Published: 2023-09-11   Modified: 2024-12-25  

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