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遺伝性腫瘍における新規バリアントの機能解明と多次元解析

Research Project

Project/Area Number 23K19508
Research Category

Grant-in-Aid for Research Activity Start-up

Allocation TypeMulti-year Fund
Review Section 0901:Oncology and related fields
Research InstitutionOkayama University

Principal Investigator

奥舎 有加  岡山大学, 医歯薬学域, 研究准教授 (50762027)

Project Period (FY) 2023-08-31 – 2025-03-31
Project Status Granted (Fiscal Year 2023)
Budget Amount *help
¥2,860,000 (Direct Cost: ¥2,200,000、Indirect Cost: ¥660,000)
Fiscal Year 2024: ¥1,430,000 (Direct Cost: ¥1,100,000、Indirect Cost: ¥330,000)
Fiscal Year 2023: ¥1,430,000 (Direct Cost: ¥1,100,000、Indirect Cost: ¥330,000)
Keywords遺伝性腫瘍 / VUS
Outline of Research at the Start

近年、次世代シークエンス技術(NGS)の進歩により遺伝性腫瘍の原因遺伝子の病的バリアント検出率は飛躍的に上昇した一方で、それに伴い膨大なVUSが蓄積されている。そこで申請者は、所属する研究グループから得た臨床情報から、PTEN遺伝子に未だ報告のないVUSを有する患者において、明らかな悪性腫瘍の家族集積を認め、さらには血縁者における同じPTENバリアントの存在だけでなく、巨頭症、知的障害が認められる複数の症例に着目し、これらの未だ知られていないVUSがどのように遺伝性腫瘍の発生および全身に影響を及ぼすのか、という学術的問いに対して、生物種・領域横断的にその機能を解明することを本研究課題の核心とした。

Outline of Annual Research Achievements

近年、NGSの進歩により遺伝性腫瘍の原因遺伝子PTENの病的バリアント検出率は飛躍的に上昇した一方で、それに伴い膨大なVUSが蓄積されている。また、機能的解析が十分でないVUSが多数存在することが、様々なコホート研究で問題となっている。申請者らは、遺伝性腫瘍におけるVUSの機能解明のため、まずin silico構造解析を行い、高い病原性が疑われる変異によりPTENタンパク質の電荷が変化し、結合タンパク質との複合体形成に変化が出るという結果を得た。また申請者は、高い病原性が疑われるPTEN_VUSのin vitro 解析のため、CRISPR/Cas9ゲノム編集法を用いてVUSを特異的標的とするsgRNAおよび修復オリゴを設計後、SpCas9-2A-GFPベクターに組み込み、細胞に導入することで、PTEN欠失細胞株およびPTEN変異細胞株を樹立した。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.

Reason

in silico構造解析およびCRISPR/Cas9ゲノム編集法を用いたPTEN欠失細胞株およびPTEN変異細胞株の樹立は、申請者の計画通り実行できている。

Strategy for Future Research Activity

今後はPTEN遺伝子改変モデル動物の作製を行う。具体的には、変異細胞株を作成した高い病原性が疑われるVUSの変異点を特異的標的とするsgRNA、修復オリゴおよびCas9をICR系偽妊娠マウスに胚移植し、得られた個体のジェノタイピングによりPTEN遺伝子改変マウスを作製する。PTEN遺伝子改変マウス作製後は、PTEN過誤腫症候群を念頭に置いた精神疾患の検証については、空間学習・作業記憶の解析のための8方向放射状迷路試験などの行動実験解析を行う。次にマウスを灌流固定し、35μmの凍結脳切片を作成した後、中枢神経系において記憶を司る海馬のc-fos免疫組織染色を行い、神経活動の指標を比較する。

Report

(1 results)
  • 2023 Research-status Report
  • Research Products

    (9 results)

All 2023 2022 Other

All Int'l Joint Research (1 results) Journal Article (7 results) (of which Int'l Joint Research: 7 results,  Peer Reviewed: 7 results) Presentation (1 results) (of which Int'l Joint Research: 1 results)

  • [Int'l Joint Research] ハーバード大学(米国)

    • Related Report
      2023 Research-status Report
  • [Journal Article] Transfection and Thermotolerance Methods for Analysis of miR-570 Targeting the HSP Chaperone Network.2023

    • Author(s)
      Okusha Y, Calderwood SK.
    • Journal Title

      Methods Mol Biol.

      Volume: 2693 Pages: 73-79

    • DOI

      10.1007/978-1-0716-3342-7_6

    • ISBN
      9781071633410, 9781071633427
    • Related Report
      2023 Research-status Report
    • Peer Reviewed / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Proteotoxic stress-induced autophagy is regulated by the NRF2 pathway via extracellular vesicles.2023

    • Author(s)
      Okusha Y, Murshid A, Calderwood SK.
    • Journal Title

      Cell Stress Chaperones.

      Volume: 28 Issue: 2 Pages: 167-175

    • DOI

      10.1007/s12192-023-01326-z

    • Related Report
      2023 Research-status Report
    • Peer Reviewed / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Protocol for CRISPR/Cas Genome Editing for Investigating Cell Communication Network.2023

    • Author(s)
      Okusha Y, Eguchi T.
    • Journal Title

      Methods Mol Biol.

      Volume: 2582 Pages: 157-167

    • DOI

      10.1007/978-1-0716-2744-0_11

    • ISBN
      9781071627433, 9781071627440
    • Related Report
      2023 Research-status Report
    • Peer Reviewed / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Western Blot Protocols for Analysis of CCN Proteins and Fragments in Exosomes, Vesicle-Free Fractions, and Cells2023

    • Author(s)
      Ono Kisho、Okusha Yuka、Tran Manh Tien、Umemori Koki、Eguchi Takanori
    • Journal Title

      Methods Mol Biol.

      Volume: 2582 Pages: 39-57

    • DOI

      10.1007/978-1-0716-2744-0_5

    • ISBN
      9781071627433, 9781071627440
    • Related Report
      2023 Research-status Report
    • Peer Reviewed / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Cdc37 as a Co-chaperone to Hsp90.2023

    • Author(s)
      Prince TL, Lang BJ, Okusha Y, Eguchi T, Calderwood SK.
    • Journal Title

      Subcell Biochem.

      Volume: 101 Pages: 141-158

    • DOI

      10.1007/978-3-031-14740-1_5

    • ISBN
      9783031147395, 9783031147401
    • Related Report
      2023 Research-status Report
    • Peer Reviewed / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Comprehensive Method for Exosome Isolation and Proteome Analysis for Detection of CCN Factors in/on Exosomes2022

    • Author(s)
      Eguchi Takanori、Okusha Yuka、Lu Yanyin、Ono Kisho、Taha Eman A.、Fukuoka Shiro
    • Journal Title

      Methods in Molecular Biology

      Volume: 2582 Pages: 59-76

    • DOI

      10.1007/978-1-0716-2744-0_6

    • ISBN
      9781071627433, 9781071627440
    • Related Report
      2023 Research-status Report
    • Peer Reviewed / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Transfection, Spinfection, Exofection, and Luciferase Assays for Analysis of CCN Genes Expression Mechanism2022

    • Author(s)
      Eguchi Takanori、Lu Yanyin、Taha Eman A.、Okusha Yuka
    • Journal Title

      Methods Mol Biol.

      Volume: 2582 Pages: 103-126

    • DOI

      10.1007/978-1-0716-2744-0_9

    • ISBN
      9781071627433, 9781071627440
    • Related Report
      2023 Research-status Report
    • Peer Reviewed / Int'l Joint Research
  • [Presentation] Targeting chaperone networks with micro-RNA.2023

    • Author(s)
      Okusha Y.
    • Organizer
      Cell stress society international meeting
    • Related Report
      2023 Research-status Report
    • Int'l Joint Research

URL: 

Published: 2023-09-11   Modified: 2024-12-25  

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