• Search Research Projects
  • Search Researchers
  • How to Use
  1. Back to previous page

Peripatric speciation of pantropical plants with sea-drifted seeds

Research Project

Project/Area Number 23K20303
Project/Area Number (Other) 20H03310 (2020-2023)
Research Category

Grant-in-Aid for Scientific Research (B)

Allocation TypeMulti-year Fund (2024)
Single-year Grants (2020-2023)
Section一般
Review Section Basic Section 45030:Biodiversity and systematics-related
Research InstitutionKyoto University

Principal Investigator

高山 浩司  京都大学, 理学研究科, 准教授 (60647478)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 田村 実  京都大学, 理学研究科, 教授 (20227292)
布施 静香  京都大学, 理学研究科, 准教授 (30344386)
梶田 忠  琉球大学, 熱帯生物圏研究センター, 教授 (80301117)
Project Period (FY) 2020-04-01 – 2025-03-31
Project Status Granted (Fiscal Year 2024)
Budget Amount *help
¥17,810,000 (Direct Cost: ¥13,700,000、Indirect Cost: ¥4,110,000)
Fiscal Year 2024: ¥390,000 (Direct Cost: ¥300,000、Indirect Cost: ¥90,000)
Fiscal Year 2023: ¥2,600,000 (Direct Cost: ¥2,000,000、Indirect Cost: ¥600,000)
Fiscal Year 2022: ¥3,770,000 (Direct Cost: ¥2,900,000、Indirect Cost: ¥870,000)
Fiscal Year 2021: ¥3,770,000 (Direct Cost: ¥2,900,000、Indirect Cost: ¥870,000)
Fiscal Year 2020: ¥7,280,000 (Direct Cost: ¥5,600,000、Indirect Cost: ¥1,680,000)
Keywords海流散布 / 海流散布植物 / 系統地理 / 種子散布 / 種分化 / 局所適応 / 集団ゲノミクス / 日本列島 / 小笠原諸島 / 遺伝的多様性 / 周辺種分化 / 広域分布種
Outline of Research at the Start

汎熱帯海流散布植物の分布の北限域である日本列島の温帯海岸域や小笠原諸島では、汎熱帯海流散布植物を母種として分化したと推測される地域固有種が複数種知られている。これらの地域固有種は、分布周縁部における地域的な選択圧や集団隔離が、種子散布によって維持される集団間の遺伝子流動の効果を上回ったために、平行的に種分化してきたと考えられる。本研究では、温帯域への適応や島嶼環境での地理的隔離が汎熱帯海流散布植物の分布周縁部での種分化をもたらしたという仮説を、複数の種群を対象にした集団ゲノミクス解析等により検証し、海流散布植物を中心とした海洋分散型生物の多様性維持創機構の理解に貢献する。

Outline of Annual Research Achievements

本研究では、汎熱帯海流散布植物の分布周縁における地域固有種の進化過程を解明することを目的としている。日本列島の温帯海岸域や小笠原諸島には、汎熱帯海流散布植物から派生したと推測される地域固有種が複数存在する。これら複数の分類群に着目して、(1)地域固有種を生み出した集団動態、(2)種分化・集団分化のパターンをもたらす自然選択、(3)地域固有種を生み出した地史的背景を解明する。
1.試料収集:オオハマボウ、ナガミハマナタマメ、ハマオモト、グンバイヒルガオ、イワタイゲキのDNAおよびRNA試料を日本国内、台湾およびグアムで収集した。
2.広義ハマオモトの系統地理:葉緑体ゲノムおよびゲノムワイド一塩基多型解析により、ハマオモト種内の系統関係と集団の遺伝構造を解析した。現在までのところ日本列島の集団が単一起源である可能性が示されている。さらに琉球列島付近を境にした南北の集団遺伝構造が見られることが明らかとなった。
3.イワタイゲキの系統地理:中琉球を境に南北で遺伝的分化が見られることが明らかとなった。生態ニッチモデリングおよび分岐年代推定から、最終氷期から現在にかけての集団の移動拡散がイワタイゲキ種内に見られた遺伝構造に強く影響していることが推察された。本内容を国際誌に発表した。
今後は、他の種についても同様の解析を進め、種間の遺伝構造の共通性と固有性を明らかにしていく。また、集団遺伝学的解析に加え、生態ニッチモデリングや海流分散モデリングを行うことで、分布形成過程を解明していく予定である。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

3: Progress in research has been slightly delayed.

Reason

海外での試料収集が遅れていたが、台湾およびグアムで試料採集を行い、遅れを取り戻しつつある。最も解析が進んでいるオオハマボウとイワタイゲキニついて誌上発表まで行うことができた。種間比較の結果から、ハマボウ、ハマオモト、イワタイゲキでは、それぞれ異なる種内の遺伝構造が存在することが示されている。この違いに関しては、集団遺伝学的解析に加え、生態ニッチモデリングや海流分散モデリングを行うことで、分布形成過程を解明していく予定である。

Strategy for Future Research Activity

今年度は未解析の分類群(グンバイヒルガオとハマナタマメ)を中心に既存のサンプルを用いて遺伝解析を進めていく。さらに、生態ニッチモデリングや海流分散モデリングを行うことで、多面的アプローチにより分布形成過程を解明していく予定である。また、これまでの研究成果を国際植物学会議(IBC 2024)で発表する予定である。

Report

(4 results)
  • 2023 Annual Research Report
  • 2022 Annual Research Report
  • 2021 Annual Research Report
  • 2020 Annual Research Report
  • Research Products

    (23 results)

All 2024 2023 2022 2021 2020 Other

All Int'l Joint Research (2 results) Journal Article (7 results) (of which Int'l Joint Research: 1 results,  Peer Reviewed: 6 results,  Open Access: 3 results) Presentation (14 results) (of which Int'l Joint Research: 1 results,  Invited: 5 results)

  • [Int'l Joint Research] 台湾中興大学(その他の国・地域)

    • Related Report
      2023 Annual Research Report
  • [Int'l Joint Research] グアム大学(米国)

    • Related Report
      2023 Annual Research Report
  • [Journal Article] Spatiotemporal process of long‐distance seed dispersal in a pantropically distributed sea hibiscus group2023

    • Author(s)
      Yamazaki Yuri、Kajita Tadashi、Takayama Koji
    • Journal Title

      Molecular Ecology

      Volume: 32 Issue: 7 Pages: 1726-1738

    • DOI

      10.1111/mec.16836

    • Related Report
      2022 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] 沈水植物マツモの南大東島からの初報告 ― 沖縄島(うるま市)および石垣島の集団との比較 ―2023

    • Author(s)
      梶田結衣、赤井賢成、梶田 忠
    • Journal Title

      沖縄生物学会誌

      Volume: 61 Pages: 25-31

    • Related Report
      2022 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] First record of potential bird pollination in the holoparasitic genus <i>Orobanche</i> L.2022

    • Author(s)
      Nishimura Akihiro、Takayama Koji
    • Journal Title

      Plant Species Biology

      Volume: 38 Issue: 1 Pages: 6-17

    • DOI

      10.1111/1442-1984.12389

    • Related Report
      2022 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] The complete chloroplast genome of a coastal plant, <i>Euphorbia jolkinii</i> (Euphorbiaceae)2022

    • Author(s)
      Iwata Hiroyuki、Ito Takuro、Kokubugata Goro、Takayama Koji
    • Journal Title

      Mitochondrial DNA Part B

      Volume: 7 Issue: 3 Pages: 569-570

    • DOI

      10.1080/23802359.2022.2055502

    • Related Report
      2021 Annual Research Report
    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Multiple origins of two Ochrosia (Apocynaceae) species endemic to the Bonin (Ogasawara) Islands2022

    • Author(s)
      Noda Hiroshi、Nishimura Akihiro、Kato Hidetoshi、Naiki Akiyo、Xiao Wei、Martinez Mario、Marutani Mari、McConnell James、Takayama Koji
    • Journal Title

      Molecular Phylogenetics and Evolution

      Volume: 171 Pages: 107455-107455

    • DOI

      10.1016/j.ympev.2022.107455

    • Related Report
      2021 Annual Research Report
    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] 非調和な森が織りなす小笠原諸島固有植物の進化2021

    • Author(s)
      高山浩司
    • Journal Title

      milsil

      Volume: 14 Pages: 9-11

    • Related Report
      2021 Annual Research Report
  • [Journal Article] The complete chloroplast genome of a pantropical legume, Canavalia rosea2021

    • Author(s)
      Imai Ryosuke、Kajita Yui、Yamamoto Takashi、Takayama Koji、Kajita Tadashi
    • Journal Title

      Mitochondrial DNA Part B

      Volume: 6 Issue: 2 Pages: 295-296

    • DOI

      10.1080/23802359.2020.1859341

    • Related Report
      2020 Annual Research Report
    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Presentation] グミ属における小笠原諸島固有種から伊豆諸島の広域分布種への遺伝子浸透2024

    • Author(s)
      塚本佳生、高山浩司
    • Organizer
      日本植物分類学会第23回大会
    • Related Report
      2023 Annual Research Report
  • [Presentation] 海流散布植物ハマオモトの日本列島集団の起源と遺伝構造2024

    • Author(s)
      小嶋健太、野田博士、高山浩司
    • Organizer
      日本植物分類学会第23回大会
    • Related Report
      2023 Annual Research Report
  • [Presentation] 小笠原固有寄生植物シマウツボにおける集団動態と宿主転換の歴史性2024

    • Author(s)
      西村
    • Organizer
      日本植物分類学会第23回大会
    • Related Report
      2023 Annual Research Report
  • [Presentation] 小笠原諸島西之島に定着したスベリヒユの起源2024

    • Author(s)
      野田博士、中野智之、川上和人、上條隆志、高山 浩司
    • Organizer
      日本植物分類学会第23回大会
    • Related Report
      2023 Annual Research Report
  • [Presentation] 海洋島固有植物の分岐による種分化と分岐によらない種分化2023

    • Author(s)
      高山浩司
    • Organizer
      第55回種生物学シンポジウム
    • Related Report
      2023 Annual Research Report
    • Invited
  • [Presentation] 日本列島におけるハマウツボとオカウツボの系統解析2023

    • Author(s)
      西村明洋、高山浩司
    • Organizer
      日本植物分類学会第22回大会
    • Related Report
      2022 Annual Research Report
  • [Presentation] 植物の生物地理・系統地理 -海浜植物を中心に-2022

    • Author(s)
      高山浩司
    • Organizer
      日本土壌生物学会第44回大会
    • Related Report
      2022 Annual Research Report
    • Invited
  • [Presentation] 日本海浜における海流散布植物イワタイゲキ(トウダイグサ科)の地理的遺伝構造2022

    • Author(s)
      岩田寛之、伊東拓朗、國府方吾郎、野田博士、高山 浩司
    • Organizer
      日本植物学会第86回大会
    • Related Report
      2022 Annual Research Report
  • [Presentation] 日本列島におけるハマオモトの遺伝構造2022

    • Author(s)
      小嶋健太、野田博士、高山浩司
    • Organizer
      日本植物学会第86回大会
    • Related Report
      2022 Annual Research Report
  • [Presentation] 小笠原固有寄生植物シマウツボにおける宿主転換の歴史と遺伝的背景2022

    • Author(s)
      西村明洋、高山浩司
    • Organizer
      日本植物学会第86回大会
    • Related Report
      2022 Annual Research Report
  • [Presentation] 海洋島における海流散布植物の内陸適応と進化2021

    • Author(s)
      高山浩司
    • Organizer
      日本植物学会第85回大会
    • Related Report
      2021 Annual Research Report
    • Invited
  • [Presentation] 小笠原諸島の自然環境と固有種2021

    • Author(s)
      高山浩司
    • Organizer
      日本植物学会第85回大会
    • Related Report
      2021 Annual Research Report
    • Invited
  • [Presentation] 南方起源海流散布植物ハマボウの集団遺伝構造と種子散布能力2021

    • Author(s)
      山﨑由理・Marina Cho,・Ji Young Yang・髙山浩司
    • Organizer
      日本植物分類学会第20回大会
    • Related Report
      2020 Annual Research Report
  • [Presentation] Endemic species on an uninhabited island as a witness for extinct lineages: an example from the Bonin Islands2020

    • Author(s)
      Koji Takayama
    • Organizer
      Island Biology Symposium 2020
    • Related Report
      2020 Annual Research Report
    • Int'l Joint Research / Invited

URL: 

Published: 2020-04-28   Modified: 2024-12-25  

Information User Guide FAQ News Terms of Use Attribution of KAKENHI

Powered by NII kakenhi