Comprehensive understanding and application of protein 3D domain swapping

• Project/Area Number: 23K21152
• Project/Area Number (Other): 21H02060 (2021-2023)
• Research Category: Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
• Allocation Type: Multi-year Fund (2024); Single-year Grants (2021-2023)
• Section: 一般
• Review Section: Basic Section 37010:Bio-related chemistry
• Research Institution: Nara Institute of Science and Technology
• Principal Investigator: 廣田 俊 奈良先端科学技術大学院大学, 先端科学技術研究科, 教授 (90283457)
• Co-Investigator(Kenkyū-buntansha): 小林 直也 奈良先端科学技術大学院大学, 先端科学技術研究科, 助教 (60781945)
• Project Period (FY): 2021-04-01 – 2025-03-31
• Project Status: Granted (Fiscal Year 2024)
• Budget Amount: ¥17,420,000 (Direct Cost: ¥13,400,000、Indirect Cost: ¥4,020,000); Fiscal Year 2024: ¥3,380,000 (Direct Cost: ¥2,600,000、Indirect Cost: ¥780,000); Fiscal Year 2023: ¥3,770,000 (Direct Cost: ¥2,900,000、Indirect Cost: ¥870,000); Fiscal Year 2022: ¥3,770,000 (Direct Cost: ¥2,900,000、Indirect Cost: ¥870,000); Fiscal Year 2021: ¥6,500,000 (Direct Cost: ¥5,000,000、Indirect Cost: ¥1,500,000)
• Keywords: タンパク質 / 3Dドメインスワッピング / 多量化 / タンパク質デザイン / タンパク質構造体

Outline of Research at the Start

タンパク質3Dドメインスワッピングは同一タンパク質が分子間で同じ構造領域を交換する現象で、1994年に初めて報告された。3Dドメインスワッピングは、分子間の相互作用が単量体の分子内の相互作用と同じ様式で起こるため非常に強く、タンパク質構造体の構築に適している。しかし、3Dドメインスワッピングの原理には未解明な点が多く、応用法の開発も十分ではない。そこで、本研究では、3Dドメインスワッピングの包括的理解と応用の研究を行う。