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低酸素下で形成される動的な代謝酵素集合体METAbody制御仮説の構築

Research Project

Project/Area Number 23K21174
Project/Area Number (Other) 21H02121 (2021-2023)
Research Category

Grant-in-Aid for Scientific Research (B)

Allocation TypeMulti-year Fund (2024)
Single-year Grants (2021-2023)
Section一般
Review Section Basic Section 38030:Applied biochemistry-related
Research InstitutionOsaka Metropolitan University (2022-2024)
Osaka Prefecture University (2021)

Principal Investigator

三浦 夏子  大阪公立大学, 大学院農学研究科, 准教授 (80724559)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 原田 直樹  大阪公立大学, 大学院農学研究科, 准教授 (00529141)
弓場 英司  大阪公立大学, 大学院工学研究科, 准教授 (80582296)
片岡 道彦  大阪公立大学, 大学院農学研究科, 教授 (90252494)
Project Period (FY) 2021-04-01 – 2026-03-31
Project Status Granted (Fiscal Year 2024)
Budget Amount *help
¥17,810,000 (Direct Cost: ¥13,700,000、Indirect Cost: ¥4,110,000)
Fiscal Year 2025: ¥1,300,000 (Direct Cost: ¥1,000,000、Indirect Cost: ¥300,000)
Fiscal Year 2024: ¥2,080,000 (Direct Cost: ¥1,600,000、Indirect Cost: ¥480,000)
Fiscal Year 2023: ¥2,080,000 (Direct Cost: ¥1,600,000、Indirect Cost: ¥480,000)
Fiscal Year 2022: ¥2,080,000 (Direct Cost: ¥1,600,000、Indirect Cost: ¥480,000)
Fiscal Year 2021: ¥10,270,000 (Direct Cost: ¥7,900,000、Indirect Cost: ¥2,370,000)
KeywordsMETA body / 低酸素 / 解糖系酵素 / Saccharomyces cerevisiae / 代謝酵素 / G-body / スクリーニング / 経時変化
Outline of Research at the Start

低酸素条件下では酵母やヒトの細胞内で20以上の代謝酵素が集合体を形成して代謝効率を上げ、細胞の生存に寄与するとされる。本研究では2013年に申請者らが酵母で初めて報告した、低酸素条件下で形成される大規模なタンパク質集合体を“META body”と名付け、これまでの知見をもとに酵素集合体研究を展開・総括して、「「META body形成仮説」の構築を目指す。

Outline of Annual Research Achievements

低酸素条件下では酵母やヒトの細胞内で20以上の代謝酵素が集合体を形成して代謝効率を上げ、細胞の生存に寄与するとされる。本研究では2013年に我々が出芽酵母で初めて報告した、低酸素条件下で形成される大規模なタンパク質集合体を“META body”と名付け、細胞内におけるその制御機構の解明を目指す。2021年度は低酸素条件下における代謝酵素集合体の形成においてコアとなる酵素群を同定することを目的とし、新たに導入した蛍光顕微鏡自動タイムラプス・Z軸スタック撮影機能を用いて、任意の内在性META body構成酵素のC末端に蛍光タンパク質を融合した出芽酵母レポーター細胞の経時的な解析を行った。低酸素培養時におけるMETA body構成酵素のうち、複数の酵素の挙動変化を経時的に追跡した結果、各酵素の集合順序が厳密に制御されていることを示唆する結果を得たほか、低酸素培養開始から最短で1時間後に集合体形成が観察できる酵素を見出した。また、各種阻害剤等をスクリーニングすることで、複数のMETA body制御タンパク質候補を見出したほか、特定の条件下において試験管内で人為的にタンパク質集合体を形成させることに成功した。さらに、ヒトがん細胞株を用いた免疫染色により、酵母で見出した複数のMETA body構成酵素が一部の細胞株において低酸素条件下で集合体を形成することを見出し、META body形成機構が種を超えて保存されている可能性を示した。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.

Reason

小スケール低酸素培養による酵素群の動態解析により、集合体のコア/シード候補分子を得ることに成功しており、次の段階である各種株の作成・解析についても順調に進行している。また、in vitro再構成系を用いた集合体形成にも成功したことから、次年度の計画であるin vitro系の最適化・解析にもスムーズに移行できる。以上より、2021年度の本研究は当初の計画に沿って概ね順調に進展していると言える。

Strategy for Future Research Activity

未解析のマイナーなMETA body構成酵素群に加え、作成した各種変異株等の解析を進めることで、集合体のコアとなる酵素群を決定する。また、共同研究者と協力してin vitro系の最適化と検証を進めることで、集合体の生理的な形成条件をハイスループットに決定できる実験系を構築する。

Report

(1 results)
  • 2021 Annual Research Report
  • Research Products

    (4 results)

All 2022 2021

All Presentation (4 results) (of which Invited: 3 results)

  • [Presentation] 出芽酵における代謝酵素集合体G-body 形成を介した代謝制御とその展開2022

    • Author(s)
      三浦夏子
    • Organizer
      日本農芸化学会2022年度大会シンポジウム「2DS 新・代謝制御ストラテジー」
    • Related Report
      2021 Annual Research Report
    • Invited
  • [Presentation] 低酸素条件下における代謝酵素集合体“G-body”の形成2021

    • Author(s)
      三浦 夏子
    • Organizer
      第94回日本生化学会大会シンポジウム3S11a「相分離メガネを通して見た酵素の機能」
    • Related Report
      2021 Annual Research Report
    • Invited
  • [Presentation] 低酸素条件下における代謝酵素集合体“G-body"形成メカニズムの解明と制御に向けて2021

    • Author(s)
      三浦 夏子
    • Organizer
      第44 回分子生物学会年会ワークショップ1PWS2-07「液-液相分離の酵素連続反応に対する効果」
    • Related Report
      2021 Annual Research Report
    • Invited
  • [Presentation] 低酸素環境下における酵素反応のin silico/in vitroリアルタイム測定系構築に関する検討2021

    • Author(s)
      三浦 夏子
    • Organizer
      量子生命科学先端フォーラム 2021冬の研究会
    • Related Report
      2021 Annual Research Report

URL: 

Published: 2021-04-28   Modified: 2024-08-08  

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