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イネ大規模交雑集団からの高温登熟耐性系統の選抜と遺伝・形態・環境要因の解明

Research Project

Project/Area Number 23K21184
Project/Area Number (Other) 21H02165 (2021-2023)
Research Category

Grant-in-Aid for Scientific Research (B)

Allocation TypeMulti-year Fund (2024)
Single-year Grants (2021-2023)
Section一般
Review Section Basic Section 39010:Science in plant genetics and breeding-related
Research InstitutionNiigata University

Principal Investigator

山崎 将紀  新潟大学, 自然科学系, 教授 (00432550)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 松葉 修一  国立研究開発法人農業・食品産業技術総合研究機構, 北海道農業研究センター, 上級研究員 (00370594)
Project Period (FY) 2021-04-01 – 2025-03-31
Project Status Granted (Fiscal Year 2024)
Budget Amount *help
¥17,160,000 (Direct Cost: ¥13,200,000、Indirect Cost: ¥3,960,000)
Fiscal Year 2024: ¥3,510,000 (Direct Cost: ¥2,700,000、Indirect Cost: ¥810,000)
Fiscal Year 2023: ¥4,420,000 (Direct Cost: ¥3,400,000、Indirect Cost: ¥1,020,000)
Fiscal Year 2022: ¥4,420,000 (Direct Cost: ¥3,400,000、Indirect Cost: ¥1,020,000)
Fiscal Year 2021: ¥4,810,000 (Direct Cost: ¥3,700,000、Indirect Cost: ¥1,110,000)
Keywordsイネ / 高温登熟耐性と感受性 / 大規模交雑集団 / 遺伝・形態・環境要因 / 高温登熟性 / 気象条件 / 出穂期 / QTL / 品種や系統の選抜 / 品種選抜
Outline of Research at the Start

日本全国で夏場の高温が続くため、イネの高温登熟に伴う白未熟粒発生要因の解明と対策が必要である。将来においてもコメの生産を大きく担う、北海道は高温登熟を警戒すべき時期が到来している。大規模な日本水稲交雑集団より高温登熟耐性系統を選抜して、4地点(北海道、新潟、福井、兵庫)で栽培して高温登熟性やイネの形態ならびに環境を複数年にわたって調査し、遺伝的要因も含めた特性を解明していく。また、これらの系統は高温登熟耐性育種への母本としての貢献が期待できる。その一方で、日本水稲における高温登熟性の遺伝様式を明らかにする。高温登熟耐性を付与するために、日本各地に最適なハプロタイプ組み合わせが提唱できる。

Outline of Annual Research Achievements

日本全国で夏場の高温が続くため、イネの高温登熟に伴う白未熟粒発生要因の解明と対策が必要である。将来においてもコメの生産を大きく担う、北海道は高温登熟を警戒すべき時期が到来している。大規模な日本水稲交雑集団より高温登熟耐性系統を選抜して、これまで4地点(北海道、新潟、福井、兵庫)で栽培して高温登熟性やイネの形態ならびに環境を複数年にわたって調査し、全ゲノム解読や遺伝子型決定によって遺伝的要因も含めた特性を解明していく。また、これらの系統は高温登熟耐性育種への母本としての貢献が期待できる。その一方で、日本水稲における高温登熟性の遺伝様式を明らかにするため、QTL解析を行う。高温登熟耐性を付与するために、日本各地に最適なハプロタイプ組み合わせが提唱できる。
本年度は新潟市、札幌市、福井市でRIL集団を栽培して、高温登熟に関する種子形質を調べ、整粒率が高い系統を高温登熟耐性候補系統として複数選出できた。2024年度はこの候補系統の栽培試験や生産力検定試験を実施していく。新たな高温登熟耐性指標で、出穂期が異なっていても品種間差を測定できる高温登熟耐性モデルを開発できた。各形質についてQTL解析を行い、出穂期の影響と登熟気温の影響を受けながらも複数QTLの関与が考えられた。
2023年度は全国的に猛暑となり、当初申請していた兵庫県加西市、新潟市、札幌市、福井市でこれまでに得られた形質データや環境データは貴重であり、引き続きデータの収集に努めていく。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.

Reason

新潟市で栽培された組換え自殖系統(RIL)集団を、穀粒判別器(サタケRGQI20A)などを利用して測定したところ、各系統の出穂期や千粒重ならびに高温登熟耐性には年次間に正の相関関係が認められ、年次変動は確実に認められるものの、各系統の形質の傾向は同様であった。高温登熟耐性の指標としている整粒比と収量性との相関は高くなく、白未熟粒である乳白や基白の発生率と弱い相関がある環境で検出された。「コシヒカリ」/「きらら397」RILからは2系統が、早生で高い整粒率、収量性は「コシヒカリ」並を示す候補として選抜できた。またこの系統については、札幌市や福井市でも同様の結果が得られ、引き続き栽培試験を重ねていく。各RIL集団はGRAS-Di技術による遺伝子型が決定されて連鎖地図が作成され、各RILゲノムの概要が把握できたが、高温登熟耐性には複数のQTLの関与が示唆された。
「コシヒカリ」/「きらら397」RILのQTL解析を行ったところ、千粒重は染色体6に札幌と新潟で安定したQTLがあったが、整粒率はGhd7の影響が大きかった。染色体5の粒長QTLが札幌と新潟で安定していて候補遺伝子があった。
北海道での高温登熟耐性の指標となる品種群が選定できた。強-やや強-中-やや弱-弱の5段階で絞り込まれてきた。
福井では、予測モデルから出穂期による高温登熟性を考慮するために、一定の気温による推定整粒率を推定し、その検証を行った。早生、中生、晩生で分類し、それぞれ高温登熟耐性品種や系統が絞り込まれてきた。新たな指標となることがわかったので、2024年度も栽培試験を行い、成果を取りまとめる。

Strategy for Future Research Activity

2023年度は全国的に猛暑となり、新潟市、兵庫県加西市、札幌市、福井市で得られた形質データや環境データは貴重であり、引き続きデータの収集に努めていき、4ヵ年のデータをまとめていく。各地域での高温登熟性と高温登熟耐性育種の研究を推進していく。

Report

(3 results)
  • 2023 Annual Research Report
  • 2022 Annual Research Report
  • 2021 Annual Research Report
  • Research Products

    (24 results)

All 2024 2023 2022 2021 Other

All Journal Article (10 results) (of which Int'l Joint Research: 1 results,  Peer Reviewed: 10 results,  Open Access: 8 results) Presentation (12 results) (of which Int'l Joint Research: 1 results,  Invited: 3 results) Remarks (2 results)

  • [Journal Article] Dual ensemble approach to predict rice heading date by integrating multiple rice phenology models and machine learning-based genetic parameter regression models2024

    • Author(s)
      Kawakita Satoshi、Yamasaki Masanori、Teratani Ryo、Yabe Shiori、Kajiya-Kanegae Hiromi、Yoshida Hiroe、Fushimi Erina、Nakagawa Hiroshi
    • Journal Title

      Agricultural and Forest Meteorology

      Volume: 344 Pages: 109821-109821

    • DOI

      10.1016/j.agrformet.2023.109821

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    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] 水稲高温登熟性標準品種を用いた玄米外観品質判定の器種比較2023

    • Author(s)
      村田和優・長岡令・小島洋一朗・山崎将紀
    • Journal Title

      北陸作物・育種研究

      Volume: 58 Pages: 13-19

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    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Integrated genome-wide differentiation and association analyses identify causal genes underlying breeding-selected grain quality traits in japonica rice2023

    • Author(s)
      Yoshida H, Wang F, Shiota S, Mori M, Kawamura M, Zhao X, Wang Y, Nishigaki N, Kobayashi A, Miura K, Yoshida S, Ikegami M, Ito A, Huang L, Caroline H, Yamagata Y, Morinaka Y, Yamasaki M, Kotake T, Yamamoto E, Sun J, Hirano K, Matsuoka M
    • Journal Title

      Molecular Plant

      Volume: 16 Issue: 9 Pages: 1460-1477

    • DOI

      10.1016/j.molp.2023.09.002

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    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] High-Density Linkage Maps from Japanese Rice japonica Recombinant Inbred Lines Using Genotyping by Random Amplicon Sequencing-Direct (GRAS-Di)2023

    • Author(s)
      Fekih Rym、Ishimaru Yohei、Okada Satoshi、Maeda Michihiro、Miyagi Ryutaro、Obana Takahiro、Suzuki Kazuyo、Inamori Minoru、Enoki Hiroyuki、Yamasaki Masanori
    • Journal Title

      Plants

      Volume: 12 Issue: 4 Pages: 929-929

    • DOI

      10.3390/plants12040929

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  • [Journal Article] Identification of Novel Quantitative Trait Loci for Culm Thickness of Rice Derived from Strong-Culm Landrace in Japan, Omachi2023

    • Author(s)
      Chigira Koki、Yamasaki Masanori、Adachi Shunsuke、Nagano Atsushi J.、Ookawa Taiichiro
    • Journal Title

      Rice

      Volume: 16 Issue: 1 Pages: 4-4

    • DOI

      10.1186/s12284-023-00621-8

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    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] γ‐Oryzanol concentrations in various rice genotypes ripened under different air temperatures2022

    • Author(s)
      Nakano Hiroshi、Yoshida Hiroe、Yabe Shiori、Fushimi Erina、Tanaka Ryo、Yamasaki Masanori、Nakagawa Hiroshi
    • Journal Title

      Cereal Chemistry

      Volume: 99 Issue: 6 Pages: 1362-1372

    • DOI

      10.1002/cche.10597

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  • [Journal Article] Identification of a unique allele in the quantitative trait locus for crown root number in <i>japonica</i> rice from Japan using genome-wide association studies2022

    • Author(s)
      Teramoto Shota、Yamasaki Masanori、Uga Yusaku
    • Journal Title

      Breeding Science

      Volume: 72 Issue: 3 Pages: 222-231

    • DOI

      10.1270/jsbbs.22010

    • ISSN
      1344-7610, 1347-3735
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  • [Journal Article] Genetic Background Negates Improvements in Rice Flour Characteristics and Food Processing Properties Caused by a Mutant Allele of the PDIL1-1 Seed Storage Protein Gene2022

    • Author(s)
      Hori Kiyosumi、Okunishi Tomoya、Nakamura Kenji、Iijima Ken、Hagimoto Masahiro、Hayakawa Katsuyuki、Shu Koka、Ikka Takashi、Yamashita Hiroto、Yamasaki Masanori、Takeuchi Yoshinobu、Koyama Shota、Tsujii Yoshimasa、Kayano Toshiaki、Ishii Takuro、Kumamaru Toshihiro、Kawagoe Yasushi、Yamamoto Toshio
    • Journal Title

      Rice

      Volume: 15 Issue: 1 Pages: 13-13

    • DOI

      10.1186/s12284-022-00560-w

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    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Development of an Aus-Derived Nested Association Mapping (Aus-NAM) Population in Rice2021

    • Author(s)
      Kitony Justine K.、Sunohara Hidehiko、Tasaki Mikako、Mori Jun-Ichi、Shimazu Akihisa、Reyes Vincent P.、Yasui Hideshi、Yamagata Yoshiyuki、Yoshimura Atsushi、Yamasaki Masanori、Nishiuchi Shunsaku、Doi Kazuyuki
    • Journal Title

      Plants

      Volume: 10 Issue: 6 Pages: 1255-1255

    • DOI

      10.3390/plants10061255

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    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] 酒米品種「白鶴錦」の遺伝特性2021

    • Author(s)
      玉田佳大・窪寺隆文・広畑修二・山崎将紀
    • Journal Title

      日本醸造協会誌

      Volume: 116 Pages: 339-346

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  • [Presentation] 「コシヒカリ」と「アケボノ」の組換え自殖系統を用いた水稲の高温登熟性に関するQTL解析2024

    • Author(s)
      中岡史裕・小林麻子・茶谷弦輝・渡辺脩斗・佐藤信仁・山崎将紀
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      第257回作物学会講演会
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  • [Presentation] 水稲品種「いちほまれ」より糊化開始温度が低い突然変異系統の特性2023

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      中岡史裕・小林麻子・渡辺脩斗・両角悠作・町田芳恵・茶谷弦輝・三浦孝太郎・山崎 将紀
    • Organizer
      第144回講演会日本育種学会
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  • [Presentation] 大学発の日本酒開発プロジェクトと酒米研究2023

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      山崎将紀
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      第143回日本育種学会講演会
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      山崎将紀・鐘ケ江弘美・千装公樹・大川泰一郎・岩田洋佳・中川博視
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      第255回日本作物学会講演会
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  • [Presentation] 発育予測モデルを用いた水稲の出穂に関する環境応答QTLの検出法の開発2023

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      第255回日本作物学会講演会
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  • [Remarks] 山崎研究室ホームページ

    • URL

      http://www.agr.niigata-u.ac.jp/~crop_rice/

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  • [Remarks] 山崎将紀クラウドファンデイング(READYFORサイト)

    • URL

      https://readyfor.jp/projects/rice-niigata

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URL: 

Published: 2021-04-28   Modified: 2024-12-25  

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