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Studies on the developmental mechanism and evolutionary basis of a novel plant meristematic tissue for vegetative propagation

Research Project

Project/Area Number 23K21318
Project/Area Number (Other) 21H02513 (2021-2023)
Research Category

Grant-in-Aid for Scientific Research (B)

Allocation TypeMulti-year Fund (2024)
Single-year Grants (2021-2023)
Section一般
Review Section Basic Section 44030:Plant molecular biology and physiology-related
Research InstitutionKyoto Sangyo University

Principal Investigator

木村 成介  京都産業大学, 生命科学部, 教授 (40339122)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 朝比奈 雅志  帝京大学, 理工学部, 教授 (00534067)
武田 征士  京都府立大学, 生命環境科学研究科, 准教授 (90508053)
工藤 洋  京都大学, 生態学研究センター, 教授 (10291569)
Project Period (FY) 2021-04-01 – 2025-03-31
Project Status Granted (Fiscal Year 2024)
Budget Amount *help
¥16,120,000 (Direct Cost: ¥12,400,000、Indirect Cost: ¥3,720,000)
Fiscal Year 2024: ¥3,770,000 (Direct Cost: ¥2,900,000、Indirect Cost: ¥870,000)
Fiscal Year 2023: ¥3,770,000 (Direct Cost: ¥2,900,000、Indirect Cost: ¥870,000)
Fiscal Year 2022: ¥3,770,000 (Direct Cost: ¥2,900,000、Indirect Cost: ¥870,000)
Fiscal Year 2021: ¥4,810,000 (Direct Cost: ¥3,700,000、Indirect Cost: ¥1,110,000)
Keywords再生繁殖芽 / 栄養繁殖 / 新奇器官 / 植物 / 再生 / 水陸両生植物
Outline of Research at the Start

北米原産の水陸両生植物Rorippa aquaticaは、有性生殖能を失っており、茎生葉からの個体再生による栄養繁殖に依存している。最近、この植物の茎生葉に栄養繁殖のための特別な器官「再生繁殖芽」を持つことを発見した。この器官は、他の植物にはない新奇なもので、水環境への適応によって進化した可能性がある。本研究では、再生繁殖芽の発生メカニズムや進化的背景の分子基盤を明らかにすることを目的とする。

Outline of Annual Research Achievements

本研究では、水陸両生植物のRorippa aquaticaで発見された、栄養繁殖に関わる新奇器官「再生繁殖芽」の発生メカニズムや進化的背景の分子基盤を明らかにすることを目的として研究を進めている。令和5年度においては、以下の研究を進めた。
(1) 再生繁殖芽と離層の形成を司る遺伝子制御ネットワークの解明:再生繁殖芽の発生と離層形成のメカニズムを明らかにするため、トランスクリプトーム解析をすすめる準備を行った。前年度までの形態学的な観察から、再生繁殖芽が形成される位置やタイミングは明らかにしていた。再生繁殖芽が形成された直後のトランスクリプトーム解析をおこなったところ、STMやCUCなどの分裂組織の維持や器官形成に関わる遺伝子が発現していた。そこで、再生繁殖芽の形成初期において形成部位特異的なトランスクリプトーム解析を行うために、レーザーマイクロダイセクションを実施するための組織の採取法の検討などを開始した。
(2) 植物における再生繁殖芽の存在の普遍性の調査:これまで、R. aquatica以外に再生繁殖芽を持つ植物は見つかってなかったので、再生繁殖芽の存在の普遍性を調査した。昨年度までに、日本において入手が可能なイヌガラシ属植物やタネツケバナ属の植物(イヌガラシ、スカシタゴボウ、クレソンなど)の調査を終えていた。そこで、今年度は、イギリスとの共同研究により、キュー植物園等で入手可能なアブラナ科植物について同様の調査を行ったが、再生繁殖芽を持つ植物は見つらなかった。R. aquaticaと近縁の水陸両生植物のR. amphibiaも持っていないことから、再生繁殖芽は珍しい新奇器官であることが示唆された。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.

Reason

研究項目(1) の「再生繁殖芽と離層の形成を司る遺伝子制御ネットワークの解明」については、初期的なトランスクリプトーム解析を行うことができた。しかしながら、レーザーマイクロダイセクションを実施するには至らなかったので、今後できるだけ早く試料の採取条件等を確立し、再生繁殖芽の形成初期におけるトランスクリプトーム解析を実施したい。また、研究項目(2)の「植物における再生繁殖芽の存在の普遍性の調査」については、計画当初の目的を完了することができた。以上のことから、本研究は概ね計画通り、かつ、順調に進展していると考えている。

Strategy for Future Research Activity

次年度については、これまでに実施した研究項目について引き続き取り組むとともに、研究成果を学会発表や学術論文として発表する。昨年度からは、本研究の成果を学会で発表しており、高い評価を得られただけでなく、有益なフィードバックも受けることができた。これらも参考にしながら研究を進め、引き続き学会で研究成果を積極的に発信するとともに、年度の後半には学術論文の執筆を完了させて投稿することを目指す。

Report

(3 results)
  • 2023 Annual Research Report
  • 2022 Annual Research Report
  • 2021 Annual Research Report
  • Research Products

    (29 results)

All 2024 2023 2022 2021 Other

All Int'l Joint Research (6 results) Journal Article (5 results) (of which Int'l Joint Research: 3 results,  Peer Reviewed: 3 results,  Open Access: 2 results) Presentation (13 results) (of which Int'l Joint Research: 2 results,  Invited: 6 results) Remarks (5 results)

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    • Author(s)
      Sakamoto Tomoaki、Ikematsu Shuka、Nakayama Hokuto、Mand?kov? Terezie、Gohari Gholamreza、Sakamoto Takuya、Li Gaojie、Hou Hongwei、Matsunaga Sachihiro、Lysak Martin A.、Kimura Seisuke
    • Journal Title

      Communications Biology

      Volume: 7 Issue: 1 Pages: 1-14

    • DOI

      10.1038/s42003-024-06088-7

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      Han Ting‐Shen、Yu Chih‐Chieh、Zheng Quan‐Jing、Kimura Seisuke、Onstein Renske E.、Xing Yao‐Wu
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      Global Ecology and Biogeography

      Volume: 33 Issue: 3 Pages: 458-469

    • DOI

      10.1111/geb.13798

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      Ikematsu Shuka、Umase Tatsushi、Shiozaki Mako、Nakayama Sodai、Noguchi Fuko、Sakamoto Tomoaki、Hou Hongwei、Gohari Gholamreza、Kimura Seisuke、Torii Keiko U.
    • Journal Title

      Current Biology

      Volume: 33 Issue: 3 Pages: 543-556

    • DOI

      10.1016/j.cub.2022.12.064

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      Tomoaki Sakamoto, Shuka Ikematsu, Kazuki Namie, Hongwei Hou, Gaojie Li, Seisuke Kimura
    • Journal Title

      International Journal of Molecular Sciences

      Volume: 23 Issue: 18 Pages: 1-10

    • DOI

      10.3390/ijms231810401

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    • Author(s)
      Gaojie Li, Jingjing Yang, Yimeng Chen, Xuyao Zhao, Yan Chen, Seisuke Kimura, Shiqi Hu, Hongwei Hou
    • Journal Title

      Plant Physiology

      Volume: 190 Issue: 3 Pages: 1777-1791

    • DOI

      10.1093/plphys/kiac382

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      Seisuke Kimura, Shuka Ikematsu, Tomoaki Sakamoto
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    • Author(s)
      坂本智昭,木村成介
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      池松朱夏、佐々木亜美、坂本智昭、木村成介
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      日本植物学会第87回大会シンポジウム「植物の多様な増殖」
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      Seisuke Kimura
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    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] アブラナ科植物Rorippa aquaticaの形質転換法およびゲノム編集法の開発、天野瑠美2022

    • Author(s)
      平野朋子、坂本智昭、木村成介、佐藤雅彦
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      第63回日本植物生理学会年会
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  • [Presentation] 水陸両生植物Rorippa aquaticaは水中環境へ適応のためエチレンと光のシグナル経路を再配線し水没に応答した気孔分化制御を行なっている2022

    • Author(s)
      池松朱夏、馬瀬樹志、塩崎真子、中山壮大、野口楓子、坂本智昭、木村成介、鳥居啓子
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      第63回日本植物生理学会年会
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  • [Presentation] 異質倍数性植物Rorippa aquaticaのサブゲノム解析2022

    • Author(s)
      坂本智昭、木村成介
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      日本植物学会第86回大会
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  • [Presentation] 水陸両生植物Rorippa aquaticaの水没による気孔分化抑制メカニズムをエチレン・光経路により解明する2022

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      池松朱夏、馬瀬樹志、坂本智昭、鳥居啓子、木村成介
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      天野瑠美、中山北斗、桃井理沙、小俣恵美、郡司玄、竹林裕美子、小嶋美紀子、池松朱夏、池内桃子、岩瀬哲、坂本智昭、笠原博幸、榊原均、Ali Ferjani、木村成介
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      天野瑠美、平野朋子、坂本智昭、木村成介、佐藤雅彦
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Published: 2021-04-28   Modified: 2024-12-25  

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