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Development of sterically controlled boranophosphate nucleic acid drugs with both high potency and low toxicity

Research Project

Project/Area Number 23K21353
Project/Area Number (Other) 21H02610 (2021-2023)
Research Category

Grant-in-Aid for Scientific Research (B)

Allocation TypeMulti-year Fund (2024)
Single-year Grants (2021-2023)
Section一般
Review Section Basic Section 47010:Pharmaceutical chemistry and drug development sciences-related
Research InstitutionTokyo University of Science

Principal Investigator

和田 猛  東京理科大学, 薬学部生命創薬科学科, 教授 (90240548)

Project Period (FY) 2021-04-01 – 2025-03-31
Project Status Granted (Fiscal Year 2024)
Budget Amount *help
¥17,160,000 (Direct Cost: ¥13,200,000、Indirect Cost: ¥3,960,000)
Fiscal Year 2024: ¥4,160,000 (Direct Cost: ¥3,200,000、Indirect Cost: ¥960,000)
Fiscal Year 2023: ¥4,160,000 (Direct Cost: ¥3,200,000、Indirect Cost: ¥960,000)
Fiscal Year 2022: ¥4,160,000 (Direct Cost: ¥3,200,000、Indirect Cost: ¥960,000)
Fiscal Year 2021: ¥4,680,000 (Direct Cost: ¥3,600,000、Indirect Cost: ¥1,080,000)
Keywords核酸医薬 / ボラノホスフェート核酸 / アンチセンス核酸 / 立体選択的合成 / リン原子修飾核酸 / 立体制御 / 不斉合成
Outline of Research at the Start

本研究では、リン原子の立体化学が制御されたPB-DNAの合成法を開発する。PB-DNAの合成では、天然型のDNAやホスホロチオエートDNA合成で用いられるアシル型の塩基部保護基を用いることができない。塩基部アミノ基をアシル基で保護すると、合成中間体の亜リン酸誘導体をボラノ化する際にアミドが非可逆的に還元されてアルキルアミノ基に変換されてしまうからである。そこで本研究では、塩基部無保護のオキサザホスホリジンモノマーの構造を最適化し、リン原子の立体化学が厳密に制御されたPB-DNAを合成し、その性質を明らかにする。

Outline of Annual Research Achievements

本研究の目的は、従来のホスホロチオエート核酸医薬を凌駕し、高い標的遺伝子発現制御活性と低毒性を両立する、リン原子の立体化学が制御されたボラノホスフェート核酸医薬を創製することである。ボラノホスフェート核酸の合成では、天然型核酸やホスホロチオエート核酸の合成で用いられるアシル型の塩基部保護基を用いることができない。塩基部アミノ基をアシル基で保護すると、合成中間体の亜リン酸誘導体をボラノ化する際にアミドが非可逆的に還元されてアルキルアミノ基に変換されてしまうからである。そこで、本研究では、塩基性条件下除去される不斉補助基を有する塩基部無保護のオキサザホスホリジン誘導体をモノマーユニットとして用いる新規合成法の開発を行うこととした。塩基部無保護のモノマーは、有機溶媒に対する溶解度が低いことが問題である。
前年度に見出した最適構造である、脂溶性官能基Xを窒素原子に導入したリン原子の立体が制御されたオキサザホスホリジン誘導体を合成し、固相法による縮合反応を試みたところ、若干ではあるがモノマーユニットのエピマー化が起こり、得られた2量体の立体化学純度が低下した。そこで、さらなるモノマーの構造の探索を行ったところ、オキサザホスホリジン骨格のフェニル基に脂溶性置換基Yを導入すると、モノマーユニットの縮合反応溶媒に対する溶解度を向上させる効果があることを見出した。そこで、この構造を有するリン原子の立体化学が制御された4種類の核酸塩基を有するオキサザホスホリジンモノマーをそれぞれ合成し、高い立体化学純度で目的物を得ることができた。これらの立体化学的に純粋なモノマーユニットを用いて2量体の固相合成を試みたところ、いずれのモノマーを用いても立体選択的な縮合反応を行うことができ、目的とするリン原子の立体化学が制御されたボラノホスフェートDNA2量体を高収率で得ることができた。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.

Reason

前年度の検討をさらに進展させ、より有効な構造を有するモノマーの開発に成功した。さらに、新規な骨格を有する4種類の核酸塩基を有するリン原子の立体化学が制御されたモノマーの合成を達成し、それらを用いた固相法による縮合反応と立体選択性の評価を行うことができ、十分な性能を発揮することが確かめられた。

Strategy for Future Research Activity

研究目的を達成するために有効な新規な構造を有するモノマーの合成に成功したので、これらを用いてリン原子の立体化学が制御された誘導体の合成を行い、縮合反応効率、立体選択性、長鎖オリゴマーの合成を検討する。

Report

(2 results)
  • 2022 Annual Research Report
  • 2021 Annual Research Report
  • Research Products

    (34 results)

All 2023 2022 2021

All Journal Article (15 results) (of which Int'l Joint Research: 2 results,  Peer Reviewed: 13 results,  Open Access: 10 results) Presentation (13 results) (of which Int'l Joint Research: 3 results,  Invited: 13 results) Book (3 results) Patent(Industrial Property Rights) (3 results) (of which Overseas: 1 results)

  • [Journal Article] Development of a new synthetic method for oligodeoxynucleotides using 3′-<i>H</i>-phosphonamidate derivatives2023

    • Author(s)
      Tsurusaki Taiki、Sato Kazuki、Wada Takeshi
    • Journal Title

      Organic & Biomolecular Chemistry

      Volume: 21 Issue: 12 Pages: 2486-2492

    • DOI

      10.1039/d2ob02292c

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  • [Journal Article] Properties of artificial cationic oligodiaminosaccharides and oligopeptides that bind to A-type oligonucleotide duplexes2023

    • Author(s)
      Shiraishi Tomomi、Sato Kazuki、Hara Rintaro Iwata、Wada Takeshi
    • Journal Title

      Nucleosides, Nucleotides, Nucleic Acids

      Volume: - Issue: 8 Pages: 1-18

    • DOI

      10.1080/15257770.2023.2182444

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    • Author(s)
      Sato Kazuki、Nukaga Yohei、Wada Takeshi
    • Journal Title

      Royal Society Open Science

      Volume: 10 Issue: 4

    • DOI

      10.1098/rsos.230095

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      Onishi Shoichi、Shionoya Kento、Sato Kazuki、Mubuchi Ayumu、Maruyama Shiori、Nakajima Tadaaki、Komeno Masahiro、Miyata Shinji、Yoshizawa Kazumi、Wada Takeshi、Linhardt Robert J.、Toida Toshihiko、Higashi Kyohei
    • Journal Title

      Carbohydrate Polymers

      Volume: 313 Pages: 120847-120847

    • DOI

      10.1016/j.carbpol.2023.120847

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    • Author(s)
      Sato Kazuki、Chiba Akie、Shiraishi Tomomi、Ogawa Yuki、Hara Rintaro Iwata、Wada Takeshi
    • Journal Title

      Carbohydrate Research

      Volume: 518 Pages: 108585-108585

    • DOI

      10.1016/j.carres.2022.108585

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      Ishii Ayumu、Sato Kazuki、Kusakabe Kosuke、Kato Noriyuki、Wada Takeshi
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      Journal of Analytical Toxicology

      Volume: 47 Issue: 1 Pages: 59-65

    • DOI

      10.1093/jat/bkac026

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      Shiraishi Tomomi、Sato Kazuki、Hara Rintaro Iwata、Wada Takeshi
    • Journal Title

      Organic & Biomolecular Chemistry

      Volume: 20 Issue: 42 Pages: 8243-8258

    • DOI

      10.1039/d2ob01575g

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    • Author(s)
      Sato Kazuki、Wada Takeshi
    • Journal Title

      Springer

      Volume: - Pages: 1-20

    • DOI

      10.1007/978-981-16-1313-5_73-1

    • ISBN
      9789811613135
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      Hara Rintaro Iwata、Wada Takeshi
    • Journal Title

      Springer

      Volume: - Pages: 1-13

    • DOI

      10.1007/978-981-16-1313-5_103-1

    • ISBN
      9789811613135
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      Suzuki Ayaka, Takagi Kazunori, Sato Kazuki, Wada Takeshi
    • Journal Title

      Tetrahedron Lett.

      Volume: 75 Pages: 153179-153179

    • DOI

      10.1016/j.tetlet.2021.153179

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      Rintaro Iwata Hara, Takeshi Wada
    • Journal Title

      Organic & Biomolecular Chemistry

      Volume: 19 Issue: 31 Pages: 6865-6870

    • DOI

      10.1039/d1ob00983d

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    • Author(s)
      Sato Kazuki, Hagio Tomoya, Sano Michi, Muramoto Kazumasa, Yaoita Aya, Noro Mihoko, Hara Rintaro Iwata, Wada Takeshi
    • Journal Title

      ACS Omega

      Volume: 6 Issue: 30 Pages: 20026-20041

    • DOI

      10.1021/acsomega.1c03058

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      Nagata T, Dwyer CA, Yoshida-Tanaka K, Ihara K, Ohyagi M, Kaburagi H, Miyata H, Ebihara S, Yoshioka K, Ishii T, Miyata K, Miyata K, Powers B, Igari T, Yamamoto S, Arimura N, Hirabayashi H, Uchihara T, Hara RI, Wada T, Bennett CF, Seth PP, Rigo F, Yokota T
    • Journal Title

      Nat Biotechnol

      Volume: 39 Issue: 12 Pages: 1529-1536

    • DOI

      10.1038/s41587-021-00972-x

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    • Author(s)
      Matsuda Hiromasa, Yoshida Erina, Shinoda Takaaki, Sato Kazuki, Hara Rintaro Iwata, Wada Takeshi
    • Journal Title

      RSC Adv.

      Volume: 11 Issue: 60 Pages: 38094-38107

    • DOI

      10.1039/d1ra06619f

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      Matsuda Hiromasa, Ito Hiroaki, Nukaga Yohei, Uehara Sho, Sato Kazuki, Hara Rintaro Iwata, Wada Takeshi
    • Journal Title

      Tetrahedron Lett.

      Volume: 87 Pages: 153526-153526

    • DOI

      10.1016/j.tetlet.2021.153526

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    • Publisher
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    • Publisher
      羊土社
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    • Inventor(s)
      和田猛、鶴﨑大樹、佐藤一樹、高橋大輔、鳥居高好
    • Industrial Property Rights Holder
      和田猛、鶴﨑大樹、佐藤一樹、高橋大輔、鳥居高好
    • Industrial Property Rights Type
      特許
    • Filing Date
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      特許
    • Filing Date
      2022
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    • Inventor(s)
      5.和田猛、佐藤一樹、髙橋裕平
    • Industrial Property Rights Holder
      5.和田猛、佐藤一樹、髙橋裕平
    • Industrial Property Rights Type
      特許
    • Industrial Property Number
      2021-092873
    • Filing Date
      2021
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URL: 

Published: 2021-04-28   Modified: 2024-08-08  

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