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Establishing Comprehensive Wildlife Population Monitoring: A Collaborative Framework of Camera Trapping, Deep Learning, and Statistical Modeling

Research Project

Project/Area Number 23K21775
Project/Area Number (Other) 21H03653 (2021-2023)
Research Category

Grant-in-Aid for Scientific Research (B)

Allocation TypeMulti-year Fund (2024)
Single-year Grants (2021-2023)
Section一般
Review Section Basic Section 64040:Social-ecological systems-related
Research InstitutionNihon University

Principal Investigator

NAKASHIMA Yoshihiro  日本大学, 生物資源科学部, 准教授 (80722420)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 飯島 勇人  国立研究開発法人森林研究・整備機構, 森林総合研究所, 主任研究員 等 (30526702)
上野 将敬  近畿大学, 総合社会学部, 准教授 (30737432)
相澤 宏旭  広島大学, 先進理工系科学研究科(工), 助教 (30910301)
東出 大志  石川県立大学, 生物資源環境学部, 講師 (60634871)
安藤 正規  岐阜大学, 応用生物科学部, 准教授 (80526880)
寺田 和憲  岐阜大学, 工学部, 教授 (30345798)
加藤 邦人  岐阜大学, 工学部, 教授 (70283281)
Project Period (FY) 2024-04-01 – 2025-03-31
Project Status Completed (Fiscal Year 2024)
Budget Amount *help
¥15,470,000 (Direct Cost: ¥11,900,000、Indirect Cost: ¥3,570,000)
Fiscal Year 2024: ¥1,560,000 (Direct Cost: ¥1,200,000、Indirect Cost: ¥360,000)
Fiscal Year 2023: ¥1,820,000 (Direct Cost: ¥1,400,000、Indirect Cost: ¥420,000)
Fiscal Year 2022: ¥2,210,000 (Direct Cost: ¥1,700,000、Indirect Cost: ¥510,000)
Fiscal Year 2021: ¥9,880,000 (Direct Cost: ¥7,600,000、Indirect Cost: ¥2,280,000)
Keywords自動撮影カメラ / 個体識別 / 空間明示型捕獲再捕獲法 / 深層学習 / メトリックラーニング / 密度・個体数推定 / 野生動物 / 個体判別 / 密度推定 / 野生動物管理 / 個体数推定
Outline of Research at the Start

本研究の目的を達成するために,サル,カモシカ,ツキノワグマ,シカに関して,①十分な質・量の学習データの取得と個体識別モデルの開発,②自動 識別に適した画像を取得するためのフィールド技法の確立,③種の特性に応じた統計モデルの構築を行う.深層学習による個体識別は,ディープ・メトリックラーニングを応用する.動物園で飼育されている個体の撮影と,野外での自動撮影カメラによる既知の個体の撮影を行い,学習データを取得する.また,この過程で個体識別に適した撮影手法を確立する.さらに,個体識別の不確実性を組み込んだ空間明示型捕獲再捕獲法を構築する.

Outline of Final Research Achievements

This study aimed to establish an efficient and highly accurate population density monitoring methodology for four species of medium to large mammals: sika deer, Japanese serow, Asiatic black bear, and Japanese macaque. Specifically, we integrated deep learning-based automatic individual identification technology for animal individuals captured by camera traps with statistical hierarchical models that appropriately incorporated uncertainty. For the construction of deep learning models, we conducted systematic photography of captive individuals to enhance the training dataset. Particularly for Asiatic black bears, where data were limited, we successfully completed photography of all individuals housed in bear parks and developed an individual identification model with accuracy equivalent to visual assessment. Furthermore, we established the fundamental framework of statistical hierarchical models for density estimation.

Academic Significance and Societal Importance of the Research Achievements

近年、中大型哺乳類の個体数が増加し、人間社会との深刻な軋轢を引き起こしている。この解決のためには、効率的で信頼度の高い個体数密度のモニタリングを実施し、状況に応じた適正な管理を実施する必要がある。本研究では、その基礎となる個体数密度推定手法を開発した。具体的には、自動撮影カメラで撮影された個体を自動的に識別する深層学習モデルと、その識別の不確実性を明示的に取り込んだ密度推定モデルを構築した。これらによって、効率的で信頼度の高い個体数密度推定の道を開くことができた。本研究は、深刻化する野生動物と人との軋轢を解消するための基盤となる技術の開発に貢献するものである。

Report

(5 results)
  • 2024 Annual Research Report   Final Research Report ( PDF )
  • 2023 Annual Research Report
  • 2022 Annual Research Report
  • 2021 Annual Research Report
  • Research Products

    (19 results)

All 2025 2024 2023 2022

All Journal Article (9 results) (of which Int'l Joint Research: 2 results,  Peer Reviewed: 9 results,  Open Access: 5 results) Presentation (10 results)

  • [Journal Article] Snapshot Japan 2023: the first camera trap dataset under a globally standardised protocol in Japan2025

    • Author(s)
      Fukasawa Keita、Morosawa Takahiro、Nakashima Yoshihiro、Takagi Shun、Yokoyama Takumasa、Ando Masaki、Iijima Hayato、Saito Masayuki、Kumada Nao、Tochigi Kahoko、Yoshioka Akira、Funatsu Satsuki、Koike Shinsuke、Uno Hiroyuki、Enomoto Takaaki、McShea William、Kays Roland
    • Journal Title

      Biodiversity Data Journal

      Volume: 13

    • DOI

      10.3897/bdj.13.e141168

    • Related Report
      2024 Annual Research Report
    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Modeling spatiotemporal variations in the density of unmarked populations using camera trap data: An application to free-roaming cats2025

    • Author(s)
      Nakashima Yoshihiro、Yajima Gota
    • Journal Title

      Biological Conservation

      Volume: 302 Pages: 110914-110914

    • DOI

      10.1016/j.biocon.2024.110914

    • Related Report
      2024 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] A statistical approach to assess interspecific consumptive competition and functional redundancy in ephemeral resource uses using camera traps2024

    • Author(s)
      Nakashima Yoshihiro、Hashizume Akane、Kanda Akane
    • Journal Title

      Ecology and Evolution

      Volume: 14 Issue: 7

    • DOI

      10.1002/ece3.70031

    • Related Report
      2024 Annual Research Report
    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Infection risk associated with carnivore carcasses may govern trophic interactions between maggots and insectivorous passerine birds2024

    • Author(s)
      Hashizume Akane、Koda Ryosuke、Nakashima Yoshihiro
    • Journal Title

      Biology Letters

      Volume: 20 Issue: 6 Pages: 20240069-20240069

    • DOI

      10.1098/rsbl.2024.0069

    • Related Report
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    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Proximity and preening in captive Humboldt penguins2024

    • Author(s)
      Kobayashi Yuka、Ueno Masataka
    • Journal Title

      Behavioural Processes

      Volume: 218 Pages: 105032-105032

    • DOI

      10.1016/j.beproc.2024.105032

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      2024 Annual Research Report 2023 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Behavioral responses of solicitors after failure to receive grooming in Macaca fuscata.2023

    • Author(s)
      Ueno Masataka、Yamada Kazunori、Nakamichi Masayuki
    • Journal Title

      American Journal of Primatology

      Volume: - Issue: 6

    • DOI

      10.1002/ajp.23491

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  • [Journal Article] Automatic individual recognition of Japanese macaques ( <i>Macaca fuscata</i> ) from sequential images2022

    • Author(s)
      Ueno Masataka、Kabata Ryosuke、Hayashi Hidetaka、Terada Kazunori、Yamada Kazunori
    • Journal Title

      Ethology

      Volume: 128 Issue: 5 Pages: 461-470

    • DOI

      10.1111/eth.13277

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      2022 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Double-observer approach with camera traps can correct imperfect detection and improve the accuracy of density estimation of unmarked animal populations2022

    • Author(s)
      Nakashima Yoshihiro、Hongo Shun、Mizuno Kaori、Yajima Gota、Dzefck Zeun’s C. B.
    • Journal Title

      Scientific Reports

      Volume: 12 Issue: 1 Pages: 2011-2011

    • DOI

      10.1038/s41598-022-05853-0

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      2022 Annual Research Report
    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Guidelines for evaluating density estimation models for unmarked populations - Santini et al. (2022)2022

    • Author(s)
      Nakashima Yoshihiro
    • Journal Title

      Basic and Applied Ecology

      Volume: 65 Pages: 109-110

    • DOI

      10.1016/j.baae.2022.11.003

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    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Presentation] 自動撮影カメラ画像のオープンデータベースの構築:進捗報告と将来の展望2024

    • Author(s)
      中島啓裕・深澤圭太・寺山佳奈・安川雅紀
    • Organizer
      日本哺乳類学会2024年度大会自由集会
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      本郷峻・バーチャル美少女ねむ・上野将敬・Liudmila Bredikhina・徳山奈帆子
    • Organizer
      第40回日本霊長類学会自由集会
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      神田有香音,矢島豪太,中島啓裕
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      矢島豪太,中島啓裕
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      第71回 日本生態学会大会
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  • [Presentation] 自動撮影カメラを用いた野生動物の密度の長期・広域モニタリング手法の確立2024

    • Author(s)
      中島啓裕
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      第71回 日本生態学会大会
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      羽部優衣,矢島豪太,中島啓裕
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      第71回 日本生態学会大会
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      松岡涼,中島啓裕, 宮下直
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      第71回 日本生態学会大会
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      安藤正規・相澤宏明
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      中島 啓裕,飯島 勇人,深澤 圭太,安藤 正規,相澤 宏旭
    • Organizer
      日本哺乳類学会2022年度大会
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    • Author(s)
      矢島豪太,中島啓裕
    • Organizer
      日本生態学会第70回全国大会
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      2022 Annual Research Report

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Published: 2021-04-28   Modified: 2026-01-16  

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