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Development of practical techniques for Raman detection of human infectious virus

Research Project

Project/Area Number 23K21861
Project/Area Number (Other) 21H03845 (2021-2023)
Research Category

Grant-in-Aid for Scientific Research (B)

Allocation TypeMulti-year Fund (2024)
Single-year Grants (2021-2023)
Section一般
Review Section Basic Section 90130:Medical systems-related
Research InstitutionKwansei Gakuin University

Principal Investigator

佐藤 英俊  関西学院大学, 生命環境学部, 教授 (10300873)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 松吉 ひろ子  東海学園大学, 健康栄養学部, 准教授 (10448772)
大嶋 佑介  富山大学, 学術研究部工学系, 准教授 (10586639)
橋本 剛佑  関西学院大学, 生命環境学部, 助教 (30868831)
Project Period (FY) 2021-04-01 – 2025-03-31
Project Status Granted (Fiscal Year 2024)
Budget Amount *help
¥17,160,000 (Direct Cost: ¥13,200,000、Indirect Cost: ¥3,960,000)
Fiscal Year 2024: ¥1,690,000 (Direct Cost: ¥1,300,000、Indirect Cost: ¥390,000)
Fiscal Year 2023: ¥5,330,000 (Direct Cost: ¥4,100,000、Indirect Cost: ¥1,230,000)
Fiscal Year 2022: ¥4,810,000 (Direct Cost: ¥3,700,000、Indirect Cost: ¥1,110,000)
Fiscal Year 2021: ¥5,330,000 (Direct Cost: ¥4,100,000、Indirect Cost: ¥1,230,000)
Keywordsラマン分光学 / ウイルス検出 / 生細胞分析 / 多変量解析 / ヒト感染性ウイルス / ラマン分光法 / リアルタイム分析 / ラマン分光分析 / ウイルス / 非破壊分析 / 環境測定
Outline of Research at the Start

研究代表者は,ウイルス侵入に対する培養ヒト細胞の反応をラマン分光分析でモニターし,ウイルスの感染をわずか3時間で検出する技術を開発した。ラマン分光法は非破壊無標識で生きた1細胞を連続的に計測することができ,細胞内で生じる分子組成変化を多変量解析によって高感度に検出できる。本研究では同技術を基に環境中のヒト感染性ウイルスをリアルタイムで検出・同定する手法を開発する。種の同定はラマンスペクトル分析に加え検出用細胞の多様化で実現する。空気中のウイルスを水中に捕捉し濃縮する装置を試作する。ウイルス捕捉液に含まれる細菌,胞子はフィルターで除去し,長期間の連続検出が可能な検出用細胞培養条件を確立する。

Outline of Annual Research Achievements

環境中のヒト感染性ウイルスを,連続的にモニターし,ウイルスの存在を3時間以内に検出する技術の開発が,本研究の目的である。従来の研究では,特定の細胞を用いてモデルウイルスの感染を3時間以内に検出する原理実証に成功していた。本研究では,より実用的な技術へと開発を進めるため,細胞やウイルスの種類を増やし,安定的な解析モデルを作り,試作機の開発を行う。本年度はウイルス種の違いによる反応性の違いについて研究した他,環境中のウイルスを収集する装置の試作を行った。
従来アデノウイルスを用いてきたが,レンチウイルスおよびセンダイウイルスに関して,感染時の細胞の変化を分析した。レンチウイルスは感染3時間目で,細胞核内の分子組成に変化が生じ,その変化は24時間まで続くことが示唆された。GFPの発現量は非常に小さいが,24時間目には計測が可能なレベルまで上昇した。従って,ラマン分光分析で得られた感染3時間目の分子組成変化が,発現したGFPによって引き起こされた可能性は低いことが示された。一方,センダイウイルスでも感染12時間後には,蛍光分析により細胞内のGFP濃度が観測可能なレベルまで増加した。しかし,細胞核でのラマン分光分析では,核内の分子組成に,ノイズレベルを超えるような顕著な違いは見られなかった。
環境ウイルス収集装置の開発に関しては,試作機の性能評価を行い装置の改良を目指した。ウイルス回収効率を推定するために,直径1マイクロメートル程度の蛍光ビーズをボックス内にスプレーし,収集された蛍光ビーズの数を計測した結果,試作機での収集効率は約5%であることが分かった。この数値は期待値よりもかなり低いため,今後ボックス内での微小粒子の保持時間を高める方法を開発する必要があることが分かった。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.

Reason

安定的な解析モデルの開発を目指し,多変量解析技術の改良を行った。ウイルスが細胞に与える変化は非常に小さく,培養条件や装置の不安定さが与えるスペクトルの変化に比較してもかなり小さい。研究代表者等は,非感染および感染細胞とデータを厳密に制御して,細胞の変化を敏感に捉える技術をすでに開発している。しかし,従来の技術では,複数の独立した実験で得られたデータを比較することは困難であることが分かってきた。異なる実験において,スペクトルに含まれるホワイトノイズは当然異なる。従来技術では,非感染および感染細胞のデータ間で,含まれるホワイトノイズをできる限り共通化することで,分析性能を改善してきた。本年度は,ノイズを積極的に除去する技術の開発を目指し,バックグラウンドを複数にパターン化して分離し,人工的でノイズの含まれないバックグラウンドパターンの組み合わせによってバックグラウンド補正を行う方法の開発を行った。しかし,現時点では十分な分析性能を得るには至っていない。一方,開発過程に置いて新しい分析手法の発想を得た。実用化の可能性について研究を進めていく予定である。

Strategy for Future Research Activity

研究の進展はほぼ予定通りであるが,博士研究員の雇用により研究の進捗は加速されたが,本年度は特に,従来技術では解決が難しい問題点も明らかになってきた。センダイウイルスのように,感染しても細胞が反応しないウイルスがあることが発見された。研究代表者等は,ウイルス感染細胞が感染後2-3時間で分子組成を変化させることから,細胞のウイルスに対する「免疫」のような反応,すなわち細胞自身が侵入を検知して,細胞内に今ある分子を活用してウイルス侵入に対抗する反応を検出していると予想していた。しかし,この結果は予想に反している。センダイウイルスはインフルエンザのモデルとしても使われ,本研究で検出したいターゲットウイルスのひとつである。遺伝子が核内移行せずに細胞質でウイルス粒子が複製されるセンダイウイルスの検出ができないのは,細胞の感度が悪い可能性も否めない。反応の大きな培養細胞を探し出す必要がある。
ウイルス収集装置の試作改良については,ウイルス粒子を模したビーズが,収集箱内に吸着したり,ポンプを繋ぐゴムチューブに堆積することが認められた。アクリル製の箱の内部では静電気が生じて埃を呼び寄せていると考えられる。今後静電気に対する対策を施すことが必須となっており,界面活性剤の塗布などの対策を進めていく予定である。

Report

(2 results)
  • 2022 Annual Research Report
  • 2021 Annual Research Report
  • Research Products

    (7 results)

All 2022 2021

All Journal Article (3 results) (of which Int'l Joint Research: 1 results,  Peer Reviewed: 3 results,  Open Access: 2 results) Presentation (4 results) (of which Int'l Joint Research: 4 results)

  • [Journal Article] Attenuated Total Reflection Far-Ultraviolet (ATR-FUV) Spectroscopy is a Sensitive Tool for Investigation of Protein Adsorption2022

    • Author(s)
      Hashimoto Kosuke、Morisawa Yusuke、Tortora Mariagrazia、Rossi Barbara、Ozaki Yukihiro、Sato Hidetoshi
    • Journal Title

      Applied Spectroscopy

      Volume: - Issue: 7 Pages: 793-800

    • DOI

      10.1177/00037028211070835

    • Related Report
      2022 Annual Research Report
    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Raman study on lipid droplets in hepatic co-cultured with fatty acid.2021

    • Author(s)
      P. N. Paramitha, R. Zakaria, A. Maryani, Y. Kusaka, B. B. Andriana, K. Hashimoto, H. Nakazawa, S. Kato, H. Sato
    • Journal Title

      Int. J. Sci.

      Volume: 22 Issue: 14 Pages: 7378-7378

    • DOI

      10.3390/ijms22147378

    • Related Report
      2021 Annual Research Report
    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Coherent Anti-Stokes Raman Scattering Spectroscopy Using a Double-Wavelength-Emission Electronically Tuned Ti:Sapphire Laser2021

    • Author(s)
      Hirai Nao、Maeda Yasuhiro、Hashimoto Kosuke、Andriana Bibin B.、Matsuyoshi Hiroko、Sato Hidetoshi
    • Journal Title

      Applied Spectroscopy

      Volume: 75 Issue: 8 Pages: 988-993

    • DOI

      10.1177/00037028211020313

    • Related Report
      2021 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Presentation] Raman Study on Early Reaction in Live Cell Infected with Virus2022

    • Author(s)
      M. Imai, K. Tamami, K. Iwasaki, K. Hashimoto, H. Sato
    • Organizer
      SCIX2022
    • Related Report
      2022 Annual Research Report
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Raman Study on The Toxicity of Amyloid-β to Live Neurons2022

    • Author(s)
      M. Moriyama, S. Sato, K. Hashimoto, H. Sato
    • Organizer
      SCIX2022
    • Related Report
      2022 Annual Research Report
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Analysis of Infection Steps of Virus with Culturing Cell by Raman Spectroscopy to Detect Viruses2022

    • Author(s)
      K. Iwasaki, K. Takami, M. Imai, K. Hashimoto, H. Sato
    • Organizer
      SCIX2022
    • Related Report
      2022 Annual Research Report
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Raman Endoscope for Diagnosis of Eosionphil Esophagitis2022

    • Author(s)
      H. Sato, R. Zakaria, T. Watanabe, S. Ishihara, k. Iwasaki, B. B. Andriana, K. Hashimoto, T. Yamamoto, N. Oshima
    • Organizer
      SCIX2022
    • Related Report
      2022 Annual Research Report
    • Int'l Joint Research

URL: 

Published: 2021-04-28   Modified: 2024-12-25  

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