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Development of non-invasive imaging methods of Biological flow and concentration field for in vivo physiological immune system interference

Research Project

Project/Area Number 23K22665
Project/Area Number (Other) 22H01394 (2022-2023)
Research Category

Grant-in-Aid for Scientific Research (B)

Allocation TypeMulti-year Fund (2024)
Single-year Grants (2022-2023)
Section一般
Review Section Basic Section 19010:Fluid engineering-related
Research InstitutionTohoku University

Principal Investigator

菊地 謙次  東北大学, 工学研究科, 准教授 (00553801)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 石川 拓司  東北大学, 医工学研究科, 教授 (20313728)
Project Period (FY) 2022-04-01 – 2026-03-31
Project Status Granted (Fiscal Year 2024)
Budget Amount *help
¥17,680,000 (Direct Cost: ¥13,600,000、Indirect Cost: ¥4,080,000)
Fiscal Year 2025: ¥1,950,000 (Direct Cost: ¥1,500,000、Indirect Cost: ¥450,000)
Fiscal Year 2024: ¥1,950,000 (Direct Cost: ¥1,500,000、Indirect Cost: ¥450,000)
Fiscal Year 2023: ¥5,070,000 (Direct Cost: ¥3,900,000、Indirect Cost: ¥1,170,000)
Fiscal Year 2022: ¥8,710,000 (Direct Cost: ¥6,700,000、Indirect Cost: ¥2,010,000)
Keywords生体流体力学 / バイオイメージング / 生体流動計測 / 生体流体工学 / 生体医工学 / バイオメカニクス / バイオエンジニアリング / ゼブラフィッシュ稚魚 / X線マイクロCT / 生体流動イメージング / 非侵襲濃度場計測 / 生理的免疫系干渉 / 線虫 / クラミドモナス
Outline of Research at the Start

本研究では、ミリ秒・マイクロメートルスケールでの生体流動および生体物質同時計測実験系構築し、ヒトにおける疾患や病態、また治療方法の向上に関連する病原菌の感染、呼吸・消化器での自浄作用、皮膚伸展時の経皮吸収の課題について、生体内での輸送現象について統合的解明を推進する各課題の流動物質の輸送過程についてin vivoマルチモーダルイメージング技術を用いて実験的に可視化を行い、得られた実験結果より物質流動の数理モデル化を行い、最終的に生体内における物質輸送理論の構築へと拡張する。

Outline of Annual Research Achievements

本年度は、共焦点レーザー顕微鏡による高時空間生体流動および生体物質同時分解能計測手法をマイルストーンとして設定し、以下2点に重点を置き研究を予定していた。

① 超高速共焦点顕微鏡とラマン散乱顕微鏡を用いて、ヒト慢性腸疾患モデル生物の腸内における蛍光標識させた病原菌を経口マイクロインジェクションさせ腸内における時空間分布計測し、病原菌モデルの拡散について直接計測を行ってきた。本手法を用いた成果として、腸壁近傍における腸内細菌の溝構造における集積効果について、生体内計測およびマイク流体デバイスを用いた流動構造可視化と数理モデルを用いた物理化学的特性の解析を行い、BMC Biologyに投稿し、掲載された。また、モデル生物である線虫の腸における糖質吸収過程の可視化計測を実施し、腸壁の微細構造によるグルコース分子の集積を実計測し、同時に蛍光退色回復法を用いて、腸壁近傍における蛍光グルコース分子の拡散係数の計測に成功し、Biochemical and Biophysical Research Communicationsに投稿し、掲載許可を得ている。

② マイクロX線顕微鏡を用いた蚊腹部の消化管運動の経時変化計測不可視である生体内観察のためマイクロX線CTを応用し、高時空間分解能マイクロX線顕微鏡へと拡張し、ゼブラ
フィッシュ成魚における流動および運動の計測を想定し、実験環境や条件の整備を行ってきた。本学青葉山新キャンパスに設置される時勢大放射光施設における研究拡張を見据え、ミリ秒・細胞スケールでの生体流動および生体物質同時計測実験系構築を大型放射光施設SPring-8における予備実験を実施し、高時間分解法によるX線ライブイメージング法の開発を進めてきた。世界初のミリ秒・マイクロメートルスケールでの生体流動および生体物質同時計測実験系構築し、不可視生体材料に特化した計測手法の開発を進めた。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.

Reason

ゼブラフィッシュ稚魚の腸内のおける腸内細菌である大腸菌の遊泳のリアルタイム計測を共焦点レーザー光学系で実現し、大腸菌の運動計測を行い、腸壁の窪み形状における局在分布を計測し、またその分布形成について数理モデルを用いた解析を行った。このモデル構築は、本研究推進における基礎的な物理化学的モデルを包含し、次年度に推進する生体流動と吸収過程の数理モデル化について十分な基礎的知見が得られた。また、生体内における糖質吸収には細胞膜に分布するグルコーストランスポーターによる能動的なグルコース輸送が広く知られているが、その細胞膜近傍の腸壁特有のひだ構造におけるグルコースの捕縛現象の計測に成功し、能動輸送に必須なグルコース濃度の定常的・恒常的維持につながる傾向グルコース分子を用いたリアルタイム計測に成功している。生体流動によって助長される撹拌の定量化とともに、生体への吸収されうる分子の局所的捕縛の実計測を実施することにより、既存の生体分子の輸送・吸収現象の物理的理解に、更なる物理化学的モデルを導入する必要性を本研究より明らかにし、今後の研究遂行に有益な結果を得ている。
次年度以降に計測を予定しているマイクロX線CTによる細胞懸濁液の内部流動の可視化計測実験に成功し、国内大型放射光施設SPring-8における基礎実験を実施し、既存計測法をはるかに上回る高時空分解能の懸濁液内部の非破壊計測の可能性につながる基礎的知見を得ている。空間分解能が数10μmで、かつ時間分解能が数10ミリ秒の計測結果を得ており、次年度の実験計画の準備も順調に進展している。

Strategy for Future Research Activity

本研究では、生体内における流動場の計測と生体内における輸送および吸収を対象とした分子のマルチモーダル計測の実現を目指し、生体内リアルタイム計測とその対象物質の輸送及び吸収に関する数理モデルを構築するための、実データ取得のための実験計測系の実現を目指している。これまでに、共焦点レーザー顕微鏡をベースとして、流れ計測手法の開発と、蛍光分子が標識されたグルコース、および生体内における腸内細菌叢の個体標識として健康たんぱく質発現のための遺伝子導入法の開発に成功してきている。今後の生体内流動計測においては、これまでに開発してきた計測実験系を活用するとともに、得られた実験結果に基づく数理解析モデルとして、輸送および吸収を基盤とする生化学的モデルを導入した生体流動・吸収過程の解析モデルを構築し、これまで未解明であった生体内における代謝・分解・吸収過程における生体流動の貢献度について定量化を行っていく。
可視光を持ちいた生体内計測手法には、不透過性が主な原因となって、内部の不可視が基本的な問題となっている。問題解決には、多光子光学系や生体透明化など数多くの実験系の開発が進めれれているが、本来計測対象となる生体生理現象への影響は未知である。X線による生体内計測は、電離放射線の被爆が懸念されるが、細胞や生体分子への極力侵襲性を低減させた計測系を実現し、これまで不可視であった不透過物質内の構造計測の計測手法へと拡張し、また流動計測および時系列計測へとつながる基礎データの収集を進めていく。

Report

(2 results)
  • 2023 Annual Research Report
  • 2022 Annual Research Report
  • Research Products

    (21 results)

All 2024 2023 2022

All Journal Article (7 results) (of which Int'l Joint Research: 2 results,  Peer Reviewed: 7 results,  Open Access: 7 results) Presentation (14 results) (of which Int'l Joint Research: 9 results,  Invited: 2 results)

  • [Journal Article] Glucose stockpile in the intestinal apical brush border in C. elegans2024

    • Author(s)
      Saito Takumi、Kikuchi Kenji、Ishikawa Takuji
    • Journal Title

      Biochemical and Biophysical Research Communications

      Volume: 706 Pages: 149762-149762

    • DOI

      10.1016/j.bbrc.2024.149762

    • Related Report
      2023 Annual Research Report
    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Bacterial accumulation in intestinal folds induced by physical and biological factors.2024

    • Author(s)
      Jinyou Yang, Toma Isaka, Kenji Kikuchi, Keiko Numayama-Tsuruta, Takuji Ishikawa
    • Journal Title

      BMC Biology

      Volume: 22 Issue: 1 Pages: 76-76

    • DOI

      10.1186/s12915-024-01874-5

    • Related Report
      2023 Annual Research Report
    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Effectiveness of substantial shortening of the endotracheal tube for decreasing airway resistance and increasing tidal volume during pressure-controlled ventilation in pediatric patients: a prospective observational study2023

    • Author(s)
      Takahashi Kazuhiro、Toyama Hiroaki、Kubo Ryosuke、Yoshida Norifumi、Ejima Yutaka、Kikuchi Kenji、Ishikawa Takuji、Yamauchi Masanori
    • Journal Title

      Journal of Clinical Monitoring and Computing

      Volume: 37 Issue: 6 Pages: 1513-1519

    • DOI

      10.1007/s10877-023-01038-w

    • Related Report
      2023 Annual Research Report
    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Endotracheal tube, by the venturi effect, reduces the efficacy of increasing inlet pressure in improving pendelluft2023

    • Author(s)
      Takahashi Kazuhiro、Toyama Hiroaki、Ejima Yutaka、Yang Jinyou、Kikuchi Kenji、Ishikawa Takuji、Yamauchi Masanori
    • Journal Title

      PLOS ONE

      Volume: 18 Issue: 9 Pages: e0291319-e0291319

    • DOI

      10.1371/journal.pone.0291319

    • Related Report
      2023 Annual Research Report
    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] High shear flow prevents bundling of bacterial flagella and induces lateral migration away from a wall2023

    • Author(s)
      Yang Jinyou、Kikuchi Kenji、Ishikawa Takuji
    • Journal Title

      Communications Physics

      Volume: 6 Issue: 1 Pages: 354-354

    • DOI

      10.1038/s42005-023-01471-y

    • Related Report
      2023 Annual Research Report
    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Visualization of droplets and aerosols in simulated dental treatments to clarify the effectiveness of oral suction devices2023

    • Author(s)
      Watanabe Jun、Iwamatsu-kobayashi Yoko、Kikuchi Kenji、Kajita Tomonari、Morishima Hiromitsu、Yamauchi Kensuke、Yashiro Wataru、Nishimura Hidekazu、Kanetaka Hiroyasu、Egusa Hiroshi
    • Journal Title

      Journal of Prosthodontic Research

      Volume: 68 Issue: 1 Pages: 85-91

    • DOI

      10.2186/jpr.JPR_D_23_00013

    • ISSN
      1883-1958, 1883-9207
    • Related Report
      2022 Annual Research Report
    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Reciprocating intestinal flows enhance glucose uptake in C. elegans2022

    • Author(s)
      Yuki Suzuki, Kenji Kikuchi, Keiko Numayama-Tsuruta, Takuji Ishikawa
    • Journal Title

      Scientific reports

      Volume: 12 Issue: 1 Pages: 15310-15310

    • DOI

      10.1038/s41598-022-18968-1

    • Related Report
      2022 Annual Research Report
    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Presentation] Viscoelastic Analysis of Fermenting Puffing Dough2023

    • Author(s)
      Kenji Kikuchi, Kyosuke Kimura, Keiko Numayama-Tsuruta and Takuji Ishikawa
    • Organizer
      AP-Biomech 2023
    • Related Report
      2023 Annual Research Report
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Transdermal Transport through Intercellular Gaps of Liposomes in Suspensions2023

    • Author(s)
      Jiawei Huang, Kenji Kikuchi, Keiko Numayama-Tsuruta and Takuji Ishikawa
    • Organizer
      AP-Biomech 2023
    • Related Report
      2023 Annual Research Report
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Internal Flow of C. Elegans Body Promoted by Locomotion2023

    • Author(s)
      Yasuhiro Asoshina, Kenji Kikuchi and Takuji Ishikawa
    • Organizer
      AP-Biomech 2023
    • Related Report
      2023 Annual Research Report
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Flying Yeast: Aerosol Particles Released during the Fermentation2023

    • Author(s)
      Ryoji Onishi, Kenji Kikuchi and Takuji Ishikawa
    • Organizer
      AP-Biomech 2023
    • Related Report
      2023 Annual Research Report
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Stagnation Phenomenon of Motile E. Coli in a Folding Wall2023

    • Author(s)
      Toma Isaka, Kenji Kikuchi, Keiko Numayama-Tsuruta and Takuji Ishikawa
    • Organizer
      AP-Biomech 2023
    • Related Report
      2023 Annual Research Report
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Intestinal folds accumulate bacteria through physical and biological factors2023

    • Author(s)
      J. Yang, T. Isaka,K. Kikuchi, K. Numayama-Tsuruta,T. Ishikawa
    • Organizer
      76th Annual Meeting of the APS Division of Fluid Dynamics
    • Related Report
      2023 Annual Research Report
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Spherical choanocyte chamber of sponge achieves optimized pumping efficiency2023

    • Author(s)
      T. Ogawa, S. Koyama, T. Omori, K. Kikuchi, R. Goldstein, T. Ishikawa
    • Organizer
      76th Annual Meeting of the APS Division of Fluid Dynamics
    • Related Report
      2023 Annual Research Report
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] 流動・柔軟 性のある 臓器・組織への 振動デバイスを用いた 穿刺 精度向上技術の開発2023

    • Author(s)
      岩田佑次郎,菊地謙次,高瀬圭,石川拓司
    • Organizer
      第35回バイオエンジニアリング講演会
    • Related Report
      2023 Annual Research Report
  • [Presentation] 蛍光グルコースによる栄養伝達経路の追跡と薬効評価2023

    • Author(s)
      Huang Jiawei,Kikuchi Kenji
    • Organizer
      第51回可視化情報シンポジウム
    • Related Report
      2023 Annual Research Report
  • [Presentation] ゼブラフィッシュ腸蠕動に伴う腸内細菌分布の可視化計測2023

    • Author(s)
      菊永祐太,菊地謙次,沼山恵子,石川拓司
    • Organizer
      第51回可視化情報シンポジウム
    • Related Report
      2023 Annual Research Report
  • [Presentation] 空飛ぶ酵母:発酵過程で放出されるエアロゾル粒子2023

    • Author(s)
      大西亮慈,石川拓司,菊地謙次
    • Organizer
      第51回可視化情報シンポジウム
    • Related Report
      2023 Annual Research Report
  • [Presentation] 窪みを有する壁面近傍における大腸菌滞留性の解明2023

    • Author(s)
      井坂斗真,菊地謙次,沼山 恵子,石川 拓司
    • Organizer
      日本流体力学会年会2023
    • Related Report
      2023 Annual Research Report
  • [Presentation] Macro biological transports induced by micro-scale gas generation by fermenting yeast cells2022

    • Author(s)
      Kenji Kikuchi
    • Organizer
      33rd 2022 International Symposium on Micro-NanoMechatronics and Human Science (MHS 2022)
    • Related Report
      2022 Annual Research Report
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] Soft matter physics of yeast fermentation visualized by micro X-ray CT2022

    • Author(s)
      Kenji Kikuchi
    • Organizer
      Asia Oceania International Conference on Synchrotron Radiation Instruments 2022 (AO-SRI 2022)
    • Related Report
      2022 Annual Research Report
    • Int'l Joint Research / Invited

URL: 

Published: 2022-04-19   Modified: 2024-12-25  

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