• Search Research Projects
  • Search Researchers
  • How to Use
  1. Back to previous page

糖脂質による新生タンパク質鎖保護と膜輸送の機構解明

Research Project

Project/Area Number 23K23480
Project/Area Number (Other) 22H02213 (2022-2023)
Research Category

Grant-in-Aid for Scientific Research (B)

Allocation TypeMulti-year Fund (2024)
Single-year Grants (2022-2023)
Section一般
Review Section Basic Section 37020:Chemistry and chemical methodology of biomolecules-related
Research InstitutionSuntory Foundation for Life Sciences

Principal Investigator

島本 啓子  公益財団法人サントリー生命科学財団, 生物有機科学研究所・構造生命科学研究部, 特任研究員 (70235638)

Project Period (FY) 2022-04-01 – 2025-03-31
Project Status Granted (Fiscal Year 2024)
Budget Amount *help
¥17,680,000 (Direct Cost: ¥13,600,000、Indirect Cost: ¥4,080,000)
Fiscal Year 2024: ¥4,160,000 (Direct Cost: ¥3,200,000、Indirect Cost: ¥960,000)
Fiscal Year 2023: ¥4,160,000 (Direct Cost: ¥3,200,000、Indirect Cost: ¥960,000)
Fiscal Year 2022: ¥9,360,000 (Direct Cost: ¥7,200,000、Indirect Cost: ¥2,160,000)
Keywords糖脂質 / 膜タンパク質 / 生体膜 / 膜輸送 / 相互作用解析 / 膜挿入 / 膜透過 / 膜脂質 / 新生タンパク質鎖 / リボソーム
Outline of Research at the Start

我々は大腸菌内膜において、膜タンパク質膜挿入に関わる糖脂質MPIaseを同定した。これまでに (1) MPIaseの糖鎖部が膜タンパク質の膜貫通 領域と相互作用し凝集を抑制する (2) ピロリン酸部が膜タンパク質の塩基性アミノ酸を膜近傍まで引き寄せる (3) 脂質部は膜内部の流動性を 上げてタンパク質-膜の疎水性相互作用の確率を上げる という機構を提唱してきた。本研究では、MPIaseとリボゾーム-新生タンパク質鎖との 相互作用解析から、新生鎖の保護と膜輸送という糖脂質の新たな役割を解明する。

Outline of Annual Research Achievements

MPIase は、大腸菌の内膜における膜タンパク質の統合に関与する糖脂質である。我々は、天然MPIaseの微量性と不均一性を克服するために、系統的なMPIaseのアナログ合成を進めてきた。膜上でのMPIaseの挙動を明らかにするために、蛍光基を有するアナログ合成に取り組んだ。蛍光基をつける位置、リンカー長、リンカーの種類、蛍光基の種類について検討した。この蛍光類縁体を用いた顕微鏡観察についての議論も進めている。また、MPIaseの基質タンパク質についての情報を得るため、表面プラズモン共鳴(SPR)の基盤に膜を固定し、アナライトとしてタンパク質を流す系の構築を検討した。一方、大腸菌外膜・内膜の各々から得られる糖脂質の構造解析を行った。糖鎖部のMALDI-MS解析について、化学修飾やマトリックス等の条件を検討し、長鎖でも感度良く情報が得られるようになった。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.

Reason

活性をもつ蛍光アナログの合成やSPRの解析系の構築等が進み、新たな現象の観測を進める準備が整いつつある。

Strategy for Future Research Activity

糖脂質の構造の活性要因を明らかにすることができたので、今後は糖脂質の膜上での挙動やタンパク質側の多様性を検証する段階に入る。蛍光アナログを用いた膜上挙動の観察の準備を進める。これまでは最も単純な系としてトランスロコン非依存的膜挿入を対象としてきたが、今後はMPIaseは分泌タンパク質の膜透過にも関わるので、多様な基質タンパク質との相互作用を調べると同時に、リボゾームやトランスロコン等のタンパク質合成装置・膜挿入装置の側と相互作用をする可能性にも注目する。

Report

(2 results)
  • 2023 Annual Research Report
  • 2022 Annual Research Report
  • Research Products

    (20 results)

All 2024 2023 2022

All Journal Article (8 results) (of which Peer Reviewed: 8 results,  Open Access: 8 results) Presentation (12 results) (of which Int'l Joint Research: 3 results,  Invited: 3 results)

  • [Journal Article] Structures, functions, and syntheses of glycero-glycophospholipids2024

    • Author(s)
      Osawa Tsukiho、Fujikawa Kohki、Shimamoto Keiko
    • Journal Title

      Frontiers in Chemistry

      Volume: 12

    • DOI

      10.3389/fchem.2024.1353688

    • Related Report
      2023 Annual Research Report
    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Roles of a Glycolipid MPIase in Sec-Independent Membrane Protein Insertion2024

    • Author(s)
      Nomura Kaoru、Mori Shoko、Shimamoto Keiko
    • Journal Title

      Membranes

      Volume: 14 Issue: 2 Pages: 48-48

    • DOI

      10.3390/membranes14020048

    • Related Report
      2023 Annual Research Report
    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Bacterial Glycolipid Acting on Protein Transport Across Membranes2024

    • Author(s)
      Mori Shoko、Shionyu Masafumi、Shimamoto Keiko、Nomura Kaoru
    • Journal Title

      ChemBioChem

      Volume: - Issue: 10

    • DOI

      10.1002/cbic.202300808

    • Related Report
      2023 Annual Research Report
    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Evaluation of Drug Responses to Human β2AR Using Native Mass Spectrometry2023

    • Author(s)
      Tajiri Michiko、Imai Shunsuke、Konuma Tsuyoshi、Shimamoto Keiko、Shimada Ichio、Akashi Satoko
    • Journal Title

      ACS Omega

      Volume: 8 Issue: 27 Pages: 24544-24551

    • DOI

      10.1021/acsomega.3c02737

    • Related Report
      2023 Annual Research Report
    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Structural Requirements of a Glycolipid MPIase for Membrane Protein Integration2023

    • Author(s)
      Kohki Fujikawa, Youjung Han, Tsukiho Osawa, Shoko Mori, Kaoru Nomura, Maki Muramoto, Ken-ichi Nishiyama, Keiko Shimamoto
    • Journal Title

      Chemistry A European Journal

      Volume: - Issue: 30

    • DOI

      10.1002/chem.202300437

    • Related Report
      2022 Annual Research Report
    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Role of a bacterial glycolipid in Sec-independent membrane protein insertion2022

    • Author(s)
      Nomura K, Mori S, Fujikawa K, Osawa T, Tsuda S, Yoshizawa-Kumagaye K, Masuda S, Nishio H, Yoshiya T, Yoda T, Shionyu M, Shirai T, Nishiyama KI, Shimamoto K.
    • Journal Title

      Sci Rep.

      Volume: 12 Issue: 1 Pages: 12231-12231

    • DOI

      10.1038/s41598-022-16304-1

    • Related Report
      2022 Annual Research Report
    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Interaction between glycolipid MPIase and proteinaceous factors during protein integration into the cytoplasmic membrane of E. coli2022

    • Author(s)
      Nishikawa Hanako、Sawasato Katsuhiro、Mori Shoko、Fujikawa Kohki、Nomura Kaoru、Shimamoto Keiko、Nishiyama Ken-Ichi
    • Journal Title

      Frontiers in Molecular Biosciences

      Volume: 9 Pages: 986602-986602

    • DOI

      10.3389/fmolb.2022.986602

    • Related Report
      2022 Annual Research Report
    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] A bacterial glycolipid essential for membrane protein integration2022

    • Author(s)
      Fujikawa Kohki、Mori Shoko、Nishiyama Ken-ichi、Shimamoto Keiko
    • Journal Title

      Advances in Carbohydrate Chemistry and Biochemistry

      Volume: 81 Pages: 95-129

    • DOI

      10.1016/bs.accb.2022.09.005

    • ISBN
      9780323985888
    • Related Report
      2022 Annual Research Report
    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Presentation] Importance of the pyrophosphate group and the C6 position of GlcNAc of the glycolipid MPIase essential for the membrane protein integration in Escherichia coli.2023

    • Author(s)
      大澤、藤川、島本
    • Organizer
      The 15th International Kyoto Conference on New Aspects of Organic Chemistry (IKCOC-15)
    • Related Report
      2023 Annual Research Report
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] 大腸菌膜タンパク質膜挿入に必須の糖脂質MPIaseの類縁体合成2023

    • Author(s)
      大澤、藤川、Han、西山、島本
    • Organizer
      第17回年会 日本ケミカルバイオロジー学会
    • Related Report
      2023 Annual Research Report
  • [Presentation] 糖脂質MPIaseが司る大腸菌膜タンパク質膜挿入機構の解明2023

    • Author(s)
      藤川、Han、大澤、森、野村、西山、島本
    • Organizer
      第17回年会 日本ケミカルバイオロジー学会
    • Related Report
      2023 Annual Research Report
  • [Presentation] Intermolecular Interactions between Membrane Proteins and Glycolipids Essential for Membrane Protein Integration2023

    • Author(s)
      森、野村、藤川、大澤、西山、島本
    • Organizer
      第61回日本生物物理学会年会
    • Related Report
      2023 Annual Research Report
  • [Presentation] 大腸菌膜タンパク質膜挿入に必須な糖脂質MPIaseのGlcNAc6位の重要性の解析2023

    • Author(s)
      大澤†、藤川、韓、西山、島本
    • Organizer
      日本化学会第103春季年会
    • Related Report
      2022 Annual Research Report
  • [Presentation] Bacterial Glycolipid Essential for Membrane Protein Integration2022

    • Author(s)
      Keiko Shimamoto
    • Organizer
      Asian Carbohydrate Chemistry and Glycobiology Webinar
    • Related Report
      2022 Annual Research Report
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] Bacterial Glycolipid Essential for Membrane Protein Integration2022

    • Author(s)
      Keiko Shimamoto
    • Organizer
      Acadimia Sinica (Taiwan)-Osaka University Bilateral Symposium
    • Related Report
      2022 Annual Research Report
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] 糖脂質なのにMPIase? 糖脂質の不思議な機能2022

    • Author(s)
      島本啓子
    • Organizer
      第55回天然物化学談話会
    • Related Report
      2022 Annual Research Report
    • Invited
  • [Presentation] Sec非依存性膜蛋白質膜挿入における大腸菌由来糖脂質MPIaseの役割解明2022

    • Author(s)
      野村†、森、藤川、大澤、津田、熊谷、増田、西尾、吉矢、西山、島本
    • Organizer
      日本膜学会第44年会
    • Related Report
      2022 Annual Research Report
  • [Presentation] 大腸菌膜タンパク質膜挿入に必須な糖脂質MPIaseの構造活性相関研究2022

    • Author(s)
      藤川†、韓、大澤、森、野村、西山、島本
    • Organizer
      第41回日本糖質学会年会
    • Related Report
      2022 Annual Research Report
  • [Presentation] 膜タンパク質膜挿入に関わる糖脂質MPIaseと基質タンパク質の相互作用解析2022

    • Author(s)
      森†、野村、藤川、大澤、西山、島本
    • Organizer
      第41回日本糖質学会年会
    • Related Report
      2022 Annual Research Report
  • [Presentation] Sec非依存性膜蛋白質膜挿入における大腸菌由来糖脂質MPIaseの作用機構の解明2022

    • Author(s)
      野村†、森、大澤、藤川、西山、島本
    • Organizer
      第61回NMR討論会
    • Related Report
      2022 Annual Research Report

URL: 

Published: 2022-04-19   Modified: 2024-12-25  

Information User Guide FAQ News Terms of Use Attribution of KAKENHI

Powered by NII kakenhi