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Mechano-sensing and stress responses in yeast cooperated by TORC1 and TORC2

Research Project

Project/Area Number 23K23514
Project/Area Number (Other) 22H02247 (2022-2023)
Research Category

Grant-in-Aid for Scientific Research (B)

Allocation TypeMulti-year Fund (2024)
Single-year Grants (2022-2023)
Section一般
Review Section Basic Section 38020:Applied microbiology-related
Research InstitutionAoyama Gakuin University

Principal Investigator

阿部 文快  青山学院大学, 理工学部, 教授 (30360746)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 三岡 哲生  青山学院大学, 理工学部, 助教 (60754538)
Project Period (FY) 2022-04-01 – 2026-03-31
Project Status Granted (Fiscal Year 2024)
Budget Amount *help
¥17,420,000 (Direct Cost: ¥13,400,000、Indirect Cost: ¥4,020,000)
Fiscal Year 2025: ¥3,640,000 (Direct Cost: ¥2,800,000、Indirect Cost: ¥840,000)
Fiscal Year 2024: ¥3,510,000 (Direct Cost: ¥2,700,000、Indirect Cost: ¥810,000)
Fiscal Year 2023: ¥3,120,000 (Direct Cost: ¥2,400,000、Indirect Cost: ¥720,000)
Fiscal Year 2022: ¥7,150,000 (Direct Cost: ¥5,500,000、Indirect Cost: ¥1,650,000)
Keywords出芽酵母 / 高水圧 / メカノセンシング / TORC1 / TORC2 / CWI経路 / Wsc1 / アミノ酸センシング / TORC1-TORC2 / 高水圧ストレス適応 / Fps1 / グリセロール排出 / ストレス応答
Outline of Research at the Start

TORC1は栄養源に応答し増殖を制御する重要なキナーゼである。一方、TORC2は細胞膜のテンションを検知するセンサーとして注目されている。我々は、高水圧が酵母TORC1を活性化すること、またTORC2の下流因子が高圧増殖に重要なことを発見した。そこで、アミノ酸センシングとメカノセンシングの観点から、両者が協調して応答する機構を解明する。また、細胞内の未知アミノ酸センサーの同定に取り組み、候補タンパク質とTORC1上流因子との結合能を解析し、その栄養源センサーとしての役割を検証する。さらに、TORC2の下流にあるYpk1に焦点を当て、高圧ストレス下でのスフィンゴ脂質合成の制御に関する研究を行う。

Outline of Annual Research Achievements

生物は刻々と変化する外的環境―栄養状態、温度、pHや浸透圧など―を検知し、細胞内にシグナルを伝達する。圧力や重力といった力学的ストレスも細胞分化や筋肉の増強を促すが、それらのインプットを細胞内で処理するメカニズムの全容は未解明である。本研究では出芽酵母Saccharomyces cerevisiaeをモデルとし、TORC1とTORC2が協調するメカノセンシング機構の解明を目指す。Cell Wall Integrity(CWI)経路は酵母のストレス応答に重要なMAPK経路であり、細胞膜上のWsc1がストレスセンサーとしての役割を演じる。我々は、25 MPa(水深2,500 m相当)の高水圧ストレスがCWI経路を活性化し、下流のMAPKであるSlt2のリン酸化を亢進することを見出した。その結果、アクアグリセロポリンFps1によるグリセロール排出が促進されることがわかった。FPS1の欠損株を高圧下で培養後、透過型電子顕微鏡で観察したところ、細胞壁が破断した細胞が確認された。高水圧下では細胞内に水が過剰に流入するため、酵母はグリセロールを排出して細胞内浸透圧を低下させ、高水圧適応を果たしているものと結論づけた。水の過剰流入は細胞膜の張力を増大させる。それに伴い、細胞膜の陥入構造であるeisosomeに局在するSlm1が、高圧下でTORC2に移行することも見出された。これらの成果を国際誌に発表した(Mochizuki et al. Mol. Biol. Cell 34, 2023)。
一方、我々は高水圧がTORC1を活性化することを報告している(Uemura et al. J. Cell Sci. 133, 2020)。免疫共沈降と質量分析を行い、TORC1シグナル伝達経路の上流のSEACAT複合体に結合するタンパク質の同定を行った。その結果、複数の候補タンパク質が得られた。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.

Reason

今年度は、Wsc1をストレスセンサーとしたメカノセンシング機構により、高水圧シグナルが細胞内に伝達することを明らかにした。特にFps1によるグリセロール排出の重要性から、酵母は「高水圧」と「低浸透圧」という質的に異なる環境ストレスに対し、CWI経路を介して応答していることがわかった。CWI経路は古くから知られているMAPK経路だが、高水圧適応でも用いられる点が興味深い。一方、TORC2は細胞膜の張力を検知するセンサーと考えられている。興味深いことに、その下流にあるYpk1キナーゼのリン酸化が、高水圧により亢進することもわかってきた。Ypk1はスフィンゴ脂質合成やアクチンフィラメントの形成に重要な役割を果たしており、現在、圧力によるYpk1リン酸化亢進のメカニズムについて解析を行っている。Wsc1を圧力センサーとしたメカノセンシングが、TORC2による膜張力の検知機構と協調する可能性が高いことが明らかとなったことから、進捗状況としては概ね順調であると評価した。

また、SEACAT複合体と相互作用するタンパク質を同定することで、TORC1を制御する未知の細胞内アミノ酸センサーの同定を試みている。現在のところ、質量分析で確認された複数の候補タンパク質をHA標識し、FLAG標識したSEACAT構成因子Seh1, Sea2, Sea3およびSea4との間で免疫共沈降とウエスタンブロッティングを行い、結合に関する再検証を行っている。

Strategy for Future Research Activity

Wsc1が圧力変化を検知する真のメカノセンサーであるならば、その分子に何らかの構造変化が見出されるはずである。Wsc1は多量体形成することで活性化すると考えられているが、我々が共焦点レーザー顕微鏡で観察した限り、高圧負荷の有無にかかわらずWsc1-GFPは常に多量体化していた。また、多量体形成しない変異型Wsc1-NPF>AAAも、正常に圧力シグナルを伝達することがわかっている。よって、これまでの報告とは異なるモードでWsc1が高水圧に応答している可能性が考えられる。Wsc1分子単独のダイナミックな構造変化を解析する方策の一つとして、分子動力学シミュレーションを検討している。さらに、期待されるWsc1の構造変化が、高水圧負荷による水の過剰流入とそれに伴う膜張力の増大が引き金になっているのか、あるいは高水圧が直接的にWsc1の構造に影響を及ぼすのかを明らかにしなければばらない。そこで、ソルビトールを添加し、水の流入を阻止した条件下で高水圧を負荷し、CWI経路の各プロセスを解析する。また、細胞膜上にはWsc1の他に、Wsc2, Wsc3, Mid2およびMtl1というストレスセンサーが存在する。そこで、これらの多重欠損株の構築と解析を通じて、Wsc1以外のセンサータンパク質の寄与を明らかにする。
これまで我々が主たる実験条件としてきた圧力は、25 MPa(約250気圧)前後であり、運動時にヒトの股関節にかかる最大圧力(約18 MPa)に近い。一方、コロニーの内部や植物の葉の表面で酵母が増殖するときには、細胞同士や基質への接触によりわずかな圧力を異方的に受ける。こうした極めて低い圧力下でCWI経路やTORC1, TORC2がどのような応答性を示すのかについても今後検討を行う予定である。

Report

(2 results)
  • 2023 Annual Research Report
  • 2022 Annual Research Report
  • Research Products

    (13 results)

All 2024 2023 2022

All Journal Article (4 results) (of which Peer Reviewed: 2 results,  Open Access: 3 results) Presentation (8 results) (of which Invited: 2 results) Book (1 results)

  • [Journal Article] Mtc6/Ehg2 is a novel endoplasmic reticulum-resident glycoprotein essential for high-pressure tolerance2024

    • Author(s)
      Uemura Satoshi、Mochizuki Takahiro、Kato Yusuke、Mioka Tetsuo、Watanabe Riseko、Fuchita Mai、Yamada Mao、Noda Yoichi、Moriguchi Takashi、Abe Fumiyoshi
    • Journal Title

      The Journal of Biochemistry

      Volume: - Issue: 2 Pages: 1-12

    • DOI

      10.1093/jb/mvae035

    • Related Report
      2023 Annual Research Report
    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Activation of CWI pathway through high hydrostatic pressure, enhancing glycerol efflux via the aquaglyceroporin Fps1 in <i>Saccharomyces cerevisiae</i>2023

    • Author(s)
      Mochizuki Takahiro、Tanigawa Toshiki、Shindo Seiya、Suematsu Momoka、Oguchi Yuki、Mioka Tetsuo、Kato Yusuke、Fujiyama Mina、Hatano Eri、Yamaguchi Masashi、Chibana Hiroji、Abe Fumiyoshi
    • Journal Title

      Molecular Biology of the Cell

      Volume: 34 Issue: 9

    • DOI

      10.1091/mbc.e23-03-0086

    • Related Report
      2023 Annual Research Report
    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] The CWI pathway is activated through high hydrostatic pressure, enhancing glycerol efflux via the aquaglyceroporin Fps1 in<i>Saccharomyces cerevisiae</i>2022

    • Author(s)
      Mochizuki Takahiro、Tanigawa Toshiki、Shindo Seiya、Suematsu Momoka、Oguchi Yuki、Mioka Tetsuo、Kato Yusuke、Fujiyama Mina、Hatano Eri、Yamaguchi Masashi、Chibana Hiroji、Abe Fumiyoshi
    • Journal Title

      BIORXIV

      Volume: 516693 Pages: 516693-516693

    • DOI

      10.1101/2022.11.15.516693

    • Related Report
      2022 Annual Research Report
    • Open Access
  • [Journal Article] 出芽酵母の圧力生理学2022

    • Author(s)
      阿部文快
    • Journal Title

      高圧力の科学・技術事典

      Volume: none Pages: 414-415

    • Related Report
      2022 Annual Research Report
  • [Presentation] 出芽酵母TORC1の上流因子SEACATと相互作用するタンパク質の同定2024

    • Author(s)
      市川宙、芝田篤史、加藤祐介、三岡哲生、井野洋子、木村弥生、阿部文快
    • Organizer
      日本農芸化学会
    • Related Report
      2023 Annual Research Report
  • [Presentation] Mechanosensing and Cellular Responses to High Hydrostatic Pressure in Yeast2023

    • Author(s)
      阿部文快
    • Organizer
      生物物理学会
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      2023 Annual Research Report
    • Invited
  • [Presentation] 酵母のメカノセンシングと高水圧シグナル伝達2023

    • Author(s)
      阿部文快
    • Organizer
      高圧討論会
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      2023 Annual Research Report
    • Invited
  • [Presentation] 高水圧下における酵母の増殖に必要な機能未知遺伝子MTC4の解析2023

    • Author(s)
      吉田悠希,三岡哲生,安納千奈未,加藤祐介, 阿部文快
    • Organizer
      高圧討論会
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      2023 Annual Research Report
  • [Presentation] 高水圧下の酵母の生存戦略:栄養源取り込みを可能にする未知遺伝子群の解析2023

    • Author(s)
      加藤祐介, 三岡哲生, 阿部文快
    • Organizer
      高圧討論会
    • Related Report
      2023 Annual Research Report
  • [Presentation] アクアグリセロポリンFps1を介した高水圧環境への酵母の適応機構2022

    • Author(s)
      谷川 俊樹、望月 貴博、末松 桃花、新藤 聖也、加藤 祐介、三岡 哲生、小口 有希、阿部 文快
    • Organizer
      酵母遺伝学フォーラム
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      2022 Annual Research Report
  • [Presentation] 出芽酵母におけるLTPs類似構造を持つ巨大タンパク質Csf1の機能解析2022

    • Author(s)
      小笠原 朱音、三岡 哲生、伊村 咲希、武本 彩音、 加藤 祐介、阿部 文快
    • Organizer
      酵母遺伝学フォーラム
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      2022 Annual Research Report
  • [Presentation] 出芽酵母の高圧増殖に必須な機能未知タンパク質Ehg1は cortical ERでトリプトファン輸送体Tat2の安定化に寄与する2022

    • Author(s)
      加藤 祐介、三岡 哲生、阿部 文快
    • Organizer
      酵母遺伝学フォーラム
    • Related Report
      2022 Annual Research Report
  • [Book] 酵母のメカノセンシングと高水圧ストレス応答2023

    • Author(s)
      阿部文快
    • Total Pages
      504
    • Publisher
      NTS出版 極限環境微生物の先端科学と社会実装の最前線
    • Related Report
      2023 Annual Research Report

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Published: 2022-04-19   Modified: 2024-12-25  

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