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微生物鉄腐食を加速する可溶性レドックス分子のデータ駆動型研究

Research Project

Project/Area Number 23K23532
Project/Area Number (Other) 22H02265 (2022-2023)
Research Category

Grant-in-Aid for Scientific Research (B)

Allocation TypeMulti-year Fund (2024)
Single-year Grants (2022-2023)
Section一般
Review Section Basic Section 38030:Applied biochemistry-related
Research InstitutionNational Institute for Materials Science

Principal Investigator

岡本 章玄  国立研究開発法人物質・材料研究機構, 高分子・バイオ材料研究センター, グループリーダー (70710325)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 今村 岳  国立研究開発法人物質・材料研究機構, 高分子・バイオ材料研究センター, 主任研究員 (60715754)
Deng Xiao  国立研究開発法人物質・材料研究機構, 高分子・バイオ材料研究センター, 主任研究員 (90903740)
Project Period (FY) 2022-04-01 – 2025-03-31
Project Status Granted (Fiscal Year 2024)
Budget Amount *help
¥17,420,000 (Direct Cost: ¥13,400,000、Indirect Cost: ¥4,020,000)
Fiscal Year 2024: ¥4,160,000 (Direct Cost: ¥3,200,000、Indirect Cost: ¥960,000)
Fiscal Year 2023: ¥6,760,000 (Direct Cost: ¥5,200,000、Indirect Cost: ¥1,560,000)
Fiscal Year 2022: ¥6,500,000 (Direct Cost: ¥5,000,000、Indirect Cost: ¥1,500,000)
Keywords微生物鉄腐食 / 加速試験 / レドックス分子 / 細胞外電子移動 / 硫酸還元菌 / ベイズ最適化 / 硫酸還元細菌 / レドックスミディエーター / ハイスループット電気化学測定
Outline of Research at the Start

本研究では、バイオ鉄腐食の速度論的理解・制御を通して、バイオ腐食細菌の加速試験開発へとつなげる。申請者らが独自に開発したハイスループット電気化学測定系にデータ駆動科学(ベイズ最適化)の手法を組み合わせることで、硫酸還元菌によ るEEUを大幅加速する電子ミディエーターの分子構造を網羅的に探索・特定する。さらに、EEUや腐食が加速される機構を解明、その普遍性を環境中細菌群集等を用いて検証、バイオ鉄腐食の制御を目指す。

Outline of Annual Research Achievements

硫酸還元菌は、鉄パイプライン等の嫌気環境で鉄腐食を引き起こし、甚大な経済損失と事故を引き起こしている。暗所や視認困難な場所で起きる嫌気バイオ腐食を防ぐためには現場の採水試料を用いた加速試験法の開発が鍵となる。申請者らはこれまでに、電気化学と分子生物学手法を用いて硫酸還元菌が固体から電子を直接引き抜く「Extracellular Electron Uptake (EEU)」が鉄腐食速度と高い相関性を示すことを明らかにした。本研究では、EEUに基づくバイオ鉄腐食の速度論的理解・制御を通して、バイオ腐食細菌の加速試験開発へとつなげる。申請者らが独自に開発したハイスループット電気化学測定系にデータ駆動科学(ベイズ最適化)の手法を組み合わせることで、硫酸還元菌によるEEUを大幅加速する電子ミディエーターの分子構造を網羅的に探索・特定する。本年度は、保有分子のデータを取得し、ベイズ最適化を適用することで、電流値を大幅に加速する小分子を購入可能な分子群から特定するパイプラインを構築した。モデル細菌において、電流値を大幅に増大する分子群を比較したところ、レドックス電位のみならず膜透過性が重要な鍵であることが初めて見出された。また、このパイプラインを用いてSRBのEEU速度に影響を与える小分子を特定する実験を進めている。最も高い特性を示した分子に対して、今後、鉄腐食速度を確認し、有意な加速が可能か検証する。今年度、2報の論文を投稿しており、現在2報の論文を準備中である。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.

Reason

計画していた方法論の確立は、モデル細菌を使ってうまく進んでいる。さらに、SRBを用いた検討も進めており、問題なく研究が進んでいる。

Strategy for Future Research Activity

当初計画した通り、SRBによる鉄腐食速度を大幅に加速される小分子の探索・特定を行い、その分子を用いた腐食機構の研究、並びに細菌叢への影響を確認する。

Report

(2 results)
  • 2023 Annual Research Report
  • 2022 Annual Research Report
  • Research Products

    (16 results)

All 2024 2023 2022 Other

All Int'l Joint Research (1 results) Journal Article (13 results) (of which Int'l Joint Research: 6 results,  Peer Reviewed: 7 results,  Open Access: 4 results) Presentation (1 results) (of which Invited: 1 results) Remarks (1 results)

  • [Int'l Joint Research] Southeast University/Kaohsiung Medical University(中国)

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      Volume: 12 Issue: 2 Pages: 257-257

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      Volume: 466 Pages: 142936-142936

    • DOI

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      Environmental Science and Technology

      Volume: 57 Issue: 19 Pages: 7421-7430

    • DOI

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      Electrochimica Acta

      Volume: 464 Pages: 142860-142860

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      Deng Xiao、Luo Dan、Okamoto Akihiro
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      Volume: 421 Pages: 140504-140504

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      Microorganisms

      Volume: 10 Issue: 2 Pages: 270-270

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      Miran Waheed、Long Xizi、Huang Wenyuan、Okamoto Akihiro
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      Long Xizi、Li Wei-Peng、Okamoto Akihiro
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      Volume: 148 Pages: 108252-108252

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    • Author(s)
      Long Xizi、Zhang Hongrui、Cao Xian、Wang Hui、Shimokawa Kohei、Chi Huimei、Zhang Chengming、Okamoto Akihiro、Li Xianning
    • Journal Title

      Separation and Purification Technology

      Volume: 303 Pages: 122144-122144

    • DOI

      10.1016/j.seppur.2022.122144

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      岡本章玄
    • Organizer
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    • Invited
  • [Remarks] 電気化学ナノバイオグループ

    • URL

      https://www.nims.go.jp/group/ebio-nano/

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Published: 2022-04-19   Modified: 2024-12-25  

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