Exploiting the mechanisms of ectomycorrhizal formation by using natural variation in Cenococcum geophilum

• Project/Area Number: 23K23646
• Project/Area Number (Other): 22H02381 (2022-2023)
• Research Category: Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
• Allocation Type: Multi-year Fund (2024); Single-year Grants (2022-2023)
• Section: 一般
• Review Section: Basic Section 40010:Forest science-related
• Research Institution: The University of Tokyo
• Principal Investigator: 練 春蘭 東京大学, 大学院農学生命科学研究科(農学部), 教授 (40376695)
• Co-Investigator(Kenkyū-buntansha): 松下 範久 東京大学, 大学院農学生命科学研究科(農学部), 准教授 (00282567) ; 津釜 大侑 東京大学, 大学院農学生命科学研究科(農学部), 准教授 (10726061) ; 李 超鋒 東京大学, 大学院農学生命科学研究科(農学部), 特任研究員 (30866687)
• Project Period (FY): 2022-04-01 – 2025-03-31
• Project Status: Granted (Fiscal Year 2024)
• Budget Amount: ¥17,290,000 (Direct Cost: ¥13,300,000、Indirect Cost: ¥3,990,000); Fiscal Year 2024: ¥4,680,000 (Direct Cost: ¥3,600,000、Indirect Cost: ¥1,080,000); Fiscal Year 2023: ¥6,760,000 (Direct Cost: ¥5,200,000、Indirect Cost: ¥1,560,000); Fiscal Year 2022: ¥5,850,000 (Direct Cost: ¥4,500,000、Indirect Cost: ¥1,350,000)
• Keywords: mycorrhizal formation / Cenococcum geophilum / GWAS / natural variation / ectomycorrhizal fungus

Outline of Research at the Start

本研究では、異なる宿主と生育環境から収集した大規模なCenococcum geophilum菌株コレクションを用い、アカマツ（針葉樹）とシラカンバ（広葉樹）への感染率の差異を苗木への接種実験により評価する。次に、ゲノムワイド関連解析（GWAS）と比較トランスクリプトーム解析を行い、菌根形成に関与する遺伝子を順遺伝学的解析で網羅的に探索する。さらに、検出された標的遺伝子の機能を逆遺伝学的解析で検証する。