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Exploring the supersaturation-dependent protein science

Research Project

Project/Area Number 23K23848
Project/Area Number (Other) 22H02584 (2022-2023)
Research Category

Grant-in-Aid for Scientific Research (B)

Allocation TypeMulti-year Fund (2024)
Single-year Grants (2022-2023)
Section一般
Review Section Basic Section 43040:Biophysics-related
Research InstitutionOsaka University

Principal Investigator

後藤 祐児  大阪大学, 大学院工学研究科, 特任研究員 (40153770)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 山本 卓  新潟大学, 医歯学総合病院, 准教授 (70444156)
山口 圭一  大阪大学, 大学院工学研究科, 特任准教授(常勤) (90432187)
Project Period (FY) 2022-04-01 – 2026-03-31
Project Status Granted (Fiscal Year 2024)
Budget Amount *help
¥17,420,000 (Direct Cost: ¥13,400,000、Indirect Cost: ¥4,020,000)
Fiscal Year 2025: ¥3,380,000 (Direct Cost: ¥2,600,000、Indirect Cost: ¥780,000)
Fiscal Year 2024: ¥3,770,000 (Direct Cost: ¥2,900,000、Indirect Cost: ¥870,000)
Fiscal Year 2023: ¥3,770,000 (Direct Cost: ¥2,900,000、Indirect Cost: ¥870,000)
Fiscal Year 2022: ¥6,500,000 (Direct Cost: ¥5,000,000、Indirect Cost: ¥1,500,000)
Keywords蛋白質 / 生体分子 / 老化 / 蛋白質凝集 / アミロイド線維 / 過飽和 / 溶解度 / フォールディング / 脳神経変性疾患 / 凝集 / 変性 / 相転移
Outline of Research at the Start

代表者は蛋白質フォールディングとミスフォールディング(アミロイド線維形成)の研究を行い、水に溶けた蛋白質の基本的性質である『溶解度』と『過飽和』が、これらを包括的に理解するために重要であることを示した。つまり、フォールディングは過飽和条件下で成り立つものであり、過飽和が解消すると、フォールディングとアミロイド線維形成が結合した統一原理が成り立つ。
本研究では、透析アミロイドーシスをはじめとするアミロイド病の発症機構が、『溶解度』と『過飽和』によって理解できることを示す。さらに溶解度と過飽和が様々な生命現象において重要な役割を果たしていることを実証し、『過飽和蛋白質科学』を開拓する。

Outline of Annual Research Achievements

蛋白質の構造物性の基盤は『アンフィンゼンのドグマ』であり、蛋白質がフォールディングして形成する機能的構造はアミノ酸配列によって決まる熱力学的最安定状態とみなす。他方、高齢化に伴う疾患の多くにおいては、蛋白質がミスフォールディングして形成するアミロイド線維が関わる。今日のアミロイド研究ではアミロイドの原子構造解析が大きく進展したことにより、アミロイドーシスの発症機構も構造に基づいて議論されることが多い。他方、アミロイド形成を左右する極めて重要な概念である過飽和についてはあまり注目されていない。本研究では『溶解度』や『過飽和』といった溶質の基本的特性に基づき、生体におけるアミロイド線維形成の実体を明らかにし、その制御を目指す。
今年度は『溶解度』と『過飽和』の役割に関する総合的な検討を行い、溶解度や過飽和に基づいてアミロイド線維形成を理解することの重要性を国内外に提唱した。次に、昨年度までに透析アミロイドーシスに関わるβ2ミクログロブリンの研究から、血液中の血清アルブミン濃度の減少がアミロイドーシス発症の新たなリスク因子(プロテオミクス因子)であることを明らかにしたが、今年度はプロテオミクスの視点から、生体内因子の役割を検証した。また、アミロイド線維形成に対する液液相分離の効果に関する研究を進め、溶質の枯渇効果の役割を示すと共に、従来から進めているアミロイド凝集誘導検出装置HANABIの研究開発を加速した。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.

Reason

①過飽和と溶解度の重要性:過飽和は溶質の結晶生成の必須条件であり、アミロイド線維も過飽和を経て形成する。一旦、アミロイド形成が開始すると、それを止めること(消火)は困難であり、アミロイドーシスの対策としては、核形成を抑止すること(防火)が重要である。そこで、「消火は防火に如かずアミロイド」というコンセプトが重要であることを、論文発表や学会発表を通じて国内外に提唱した。
②アミロイド線維の形成とプロテオスタシス:既に血液中の血清アルブミン濃度の減少が透析アミロイドーシスの新たな危険因子であることを前年度までに明らかにした。このことの一般性を検証するために、抗体L鎖が原因となって発症するALアミロイドーシスの発症機構をプロテオスタシスの観点から検討した。
③液液相分離:ポリエチレングリコール・デキストランが形成するドロップレットは、アミロイド線維の形成を促進するだけでなく、抑制する場合のあることを明らかにした。
④HANABIの開発:HANABIの研究開発を進め、超音波に依存したアミロイド形成反応をさらに同期化させることができた。

Strategy for Future Research Activity

「溶解度」と「過飽和」に依存した「晶析」は、アミロイド線維だけではなく、機能性アミロイド、尿路結石や痛風などの結石症、アクチンやミオシンの重合など、生体や生命現象に関わるさまざまな場面、プロテオスタシスの維持において重要な役割を担っている。今後は特に、「生体における過飽和解消のトリガー」に注目して研究を展開し、「過飽和生命科学の開拓」を進めたい。

Report

(2 results)
  • 2023 Annual Research Report
  • 2022 Annual Research Report
  • Research Products

    (22 results)

All 2024 2023 2022 Other

All Int'l Joint Research (5 results) Journal Article (10 results) (of which Int'l Joint Research: 4 results,  Peer Reviewed: 10 results,  Open Access: 9 results) Presentation (5 results) (of which Int'l Joint Research: 3 results,  Invited: 5 results) Book (1 results) Remarks (1 results)

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    • Author(s)
      Goto Yuji、Nakajima Kichitaro、Yamamoto Suguru、Yamaguchi Keiichi
    • Journal Title

      Journal of Molecular Biology

      Volume: - Issue: 14 Pages: 168475-168475

    • DOI

      10.1016/j.jmb.2024.168475

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    • Author(s)
      Yamamoto Suguru、Yamamoto Keiko、Hirao Yoshitoshi、Yamaguchi Keiichi、Nakajima Kichitaro、Sato Mami、Kawachi Miho、Domon Mio、Goto Kei、Omori Kentaro、Iino Noriaki、Shimada Hisaki、Aoyagi Ryuzi、Ei Isei、Goto Shin、Goto Yuji、Gejyo Fumitake、Yamamoto Tadashi、Narita Ichiei
    • Journal Title

      Amyloid

      Volume: - Issue: 2 Pages: 1-11

    • DOI

      10.1080/13506129.2024.2315148

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    • Author(s)
      Nakajima Kichitaro、Ota Tomoki、Toda Hajime、Yamaguchi Keiichi、Goto Yuji、Ogi Hirotsugu
    • Journal Title

      ACS Chemical Neuroscience

      Volume: 15 Issue: 8 Pages: 1643-1651

    • DOI

      10.1021/acschemneuro.4c00071

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      Choong Chi-Jing、Aguirre Cesar、Kakuda Keita、Beck Goichi、Nakanishi Hiroki、Kimura Yasuyoshi、Shimma Shuichi、Nabekura Kei、Hideshima Makoto、Doi Junko、Yamaguchi Keiichi、et al.
    • Journal Title

      Acta Neuropathologica

      Volume: 145 Issue: 5 Pages: 573-595

    • DOI

      10.1007/s00401-023-02555-3

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  • [Journal Article] Ultrastiff Amyloid-Fibril Network of α-Synuclein Formed by Surface Seeding Reaction Confirmed by Multichannel Electrodeless Quartz-Crystal-Microbalance Biosensor2023

    • Author(s)
      Zhou Lianjie、Hajiri Touko、Nakajima Kichitaro、Aguirre Cesar、Ikenaka Kensuke、Mochizuki Hideki、Yamaguchi Keiichi、Goto Yuji、Ogi Hirotsugu
    • Journal Title

      ACS Sensors

      Volume: 8 Issue: 7 Pages: 2598-2608

    • DOI

      10.1021/acssensors.3c00331

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    • Author(s)
      Yamaguchi Keiichi、Nakajima Kichitaro、Goto Yuji
    • Journal Title

      Biophysics and Physicobiology

      Volume: 20 Issue: 1 Pages: n/a

    • DOI

      10.2142/biophysico.bppb-v20.0013

    • ISSN
      2189-4779
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    • Author(s)
      Nakajima Kichitaro、Yamaguchi Keiichi、Noji Masahiro、Aguirre Cesar、Ikenaka Kensuke、Mochizuki Hideki、Zhou Lianjie、Ogi Hirotsugu、Ito Toru、Narita Ichiei、Gejyo Fumitake、Naiki Hironobu、Yamamoto Suguru、Goto Yuji
    • Journal Title

      Nature Communications

      Volume: 13 Issue: 1 Pages: 5689-5689

    • DOI

      10.1038/s41467-022-33247-3

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  • [Journal Article] BeStSel: webserver for secondary structure and fold prediction for protein CD spectroscopy2022

    • Author(s)
      Micsonai Andras、Moussong Eva、Wien Frank、Boros Eszter、Vadszi Henrietta、Murvai Nikoletta、Lee Young-Ho、Molnar Tamas、Rafragiers Matthieu、Goto Yuji、Tantos Agnes、Kardos Jozsef
    • Journal Title

      Nucleic Acids Research

      Volume: 50 Issue: W1 Pages: W90-W98

    • DOI

      10.1093/nar/gkac345

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  • [Journal Article] Competitive inhibition of the classical complement pathway using exogenous single-chain C1q recognition proteins2022

    • Author(s)
      Vadaszi Henrietta、Kiss Bence、Micsonai Andras、Schlosser Gitta、Szaniszla Tamas、Kovacs Reka 、Gyorffy Balazs A.、Kakesi Katalin A.、Goto Yuji、Uzonyi Barbara、Liliom Karoly、Kardos Jozsef
    • Journal Title

      Journal of Biological Chemistry

      Volume: 298 Issue: 7 Pages: 102113-102113

    • DOI

      10.1016/j.jbc.2022.102113

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    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Supersaturation-Dependent Formation of Amyloid Fibrils2022

    • Author(s)
      Goto Yuji、Noji Masahiro、Nakajima Kichitaro、Yamaguchi Keiichi
    • Journal Title

      Molecules

      Volume: 27 Issue: 14 Pages: 4588-4588

    • DOI

      10.3390/molecules27144588

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  • [Presentation] 蛋白質フォールディングとアミロイド形成の統合2023

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      Yuji GOTO
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      Proteostasis & Disease Symposium 2022
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  • [Book] 生体分子環境の化学2023

    • Author(s)
      日本化学会
    • Total Pages
      208
    • Publisher
      化学同人
    • ISBN
      9784759814057
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  • [Remarks] 大阪大学・工学研究科・マイクロソノケミストリー共同研究講座・後藤グループ

    • URL

      https://supersaturation.sakura.ne.jp/

    • Related Report
      2023 Annual Research Report 2022 Annual Research Report

URL: 

Published: 2022-04-19   Modified: 2024-12-25  

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