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Development of the reconstituted folding/translation-coupled system to analyze relevant diseases

Research Project

Project/Area Number 23K23875
Project/Area Number (Other) 22H02612 (2022-2023)
Research Category

Grant-in-Aid for Scientific Research (B)

Allocation TypeMulti-year Fund (2024)
Single-year Grants (2022-2023)
Section一般
Review Section Basic Section 43060:System genome science-related
Research InstitutionUniversity of Hyogo

Principal Investigator

今高 寛晃  兵庫県立大学, 工学研究科, 教授 (50201942)

Project Period (FY) 2024-04-01 – 2026-03-31
Project Status Granted (Fiscal Year 2024)
Budget Amount *help
¥17,420,000 (Direct Cost: ¥13,400,000、Indirect Cost: ¥4,020,000)
Fiscal Year 2025: ¥3,380,000 (Direct Cost: ¥2,600,000、Indirect Cost: ¥780,000)
Fiscal Year 2024: ¥3,380,000 (Direct Cost: ¥2,600,000、Indirect Cost: ¥780,000)
Fiscal Year 2023: ¥5,070,000 (Direct Cost: ¥3,900,000、Indirect Cost: ¥1,170,000)
Fiscal Year 2022: ¥5,590,000 (Direct Cost: ¥4,300,000、Indirect Cost: ¥1,290,000)
Keywords翻訳 / タンパク質合成 / 再構成 / 小胞体 / フォールデイング / リポソーム / シャペロン / CFTR / フォールディング / 翻訳因子 / SRP / translation / reconstitution / protein folding / cell-free
Outline of Research at the Start

リボソームにより合成(翻訳)されタンパク質が立体構造を形成することをフォールディングと呼ぶ。このフォールディングが異常を来す病:フォールディング病が多く報告されている。本研究はまず試験管内で「タンパク質の翻訳・フォールディング」を精製因子のみで再現する「再構成型翻訳・フォールディングシステム」を確立する。そして、そのシステムを用いて代表的なフォールディング病「嚢胞性繊維症」や「セルピン病」の分子論的解析を行う。
タンパク質は生命の根幹であるため本研究で開発される「再構成型翻訳・フォールディングシステム」は関連病の解析のみならず、分子生物学研究の基本的なツールとして役立つことが期待される。

Outline of Annual Research Achievements

人工ER(endplasmic reticulum)構築を目指し、SRPリセプター (SRa-FLAG, SRb-FLAG), Sec61複合体 (Sec61a-FLAG, Sec61b, Sec61g)、 Sec62-FLAG/63-FLAGそしてシグナルペプチダーゼ複合体 (Signal peptidase:サブユニットa, c, b,g)をHeLa細胞抽出液由来試験管内翻訳システムで発現し、FLAGレジンで精製後、リポソームに組み込んだ。このリポソームと再構成SRPを組み合わせ、再構成型ヒト無細胞翻訳系(HumanPURE)に接続することにより、HumanPURE-ER連動システム構築を試みた。このシステムでは、SP (signal peptide)-EGFPあるいはEGFPを発現すると、SRPとSP配列存在下においてのみEGFPタンパクがリポソームに輸送された。そして上記のシステムにN-型糖鎖付加機能を持たせるため、糖鎖付加酵素複合体(STT3a:酵素本体, DC2, KCP2, OST4, TMEM258, RPN2, OST48, DAD1)を発現・精製した。活性確認として、この精製STT3a複合体はアスパラギン含有ペプチドに糖鎖を付加することが確認できた。現在、HumanPURE-ER連動システムにこの糖鎖付加酵素複合体を組み込んでいる。そして、試験管内翻訳系において機能性膜タンパク質を発現することを目標に、まずカリウムイオンチャネルであるKcsAをHeLa細胞抽出液由来試験管内翻訳システムで発現・精製した。このKcsAサンプルは、イオンチャネル機能測定器(Orbit-mini)を用いて、カリウムイオンチャネルとして機能していることが確認できた。現在、塩素イオンチャネルであるCFTRで同様の実験を行っている。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.

Reason

研究は概ね順調に進んでいる。人工ERを作成し、ヒト因子由来再構成型翻訳システム(HumanPURE)と連結し、HumanPURE-ER連動システムを開発することが本プロジェクトの大きな目標である。それに対し、2024年度までに、基本的に必要な因子を調達(精製)し、それらをリポソームに組み込むことにより、人工ERの構築を進めている。また、このシステムを用いた研究として、ER内folding不全の解析を始めている。目下CFTRの試験内合成と活性(イオンチャネル活性)測定に関する実験系が構築されつつある。以上により本科研費研究は計画通りに進んでいる、と考えられる。

Strategy for Future Research Activity

2025年度は最終年度であるため、HumanPURE-ER連動システムの完成と、そのシステムを用いたCFTRやアンチトリプシン機能検定を成功させる。特に、翻訳に連動したN-型糖鎖付加機能をHumanPURE-ER連動システムに組み込み、ER内での翻訳―folding連動システムを完成させ、将来に向けた技術革新の基礎を築く予定である。N-型糖鎖付加に関しては、例として、hCG-alfa, EPO, IL5,IL6(何れも糖鎖付加が起こることが知られている)を用いて実験系設置を進める。系がうまく働いていることを示すため、糖鎖切断酵素による確認、または糖修飾が起こるアミノ酸残基であるAsnをAspに変異させたタンパク質を発現させる。また、糖鎖付加機能と共に、シグナル配列切断機能も観察する。CFTRを試験管内で合成しリポソームに組み込む方法はSec61を組み込んだ時の方法を用いる。CFTRは大部分が細胞質側に存在し細胞質のシャペロンとの相互作用が重要と考えられるため、系にシャペロンを投入しながら翻訳する。

Report

(3 results)
  • 2024 Research-status Report
  • 2023 Annual Research Report
  • 2022 Annual Research Report
  • Research Products

    (34 results)

All 2025 2024 2023 2022

All Journal Article (7 results) (of which Int'l Joint Research: 1 results,  Peer Reviewed: 7 results,  Open Access: 6 results) Presentation (27 results) (of which Int'l Joint Research: 2 results,  Invited: 5 results)

  • [Journal Article] Sporogen-AO1 inhibits eukaryotic translation elongation2025

    • Author(s)
      Kodai Machida, Shotaro Noseda, Seraya Miki, Mayumi Yuasa-Sunagawa and Hiroaki Imataka
    • Journal Title

      J. Antibiotics

      Volume: 78 Issue: 5 Pages: 288-294

    • DOI

      10.1038/s41429-025-00817-8

    • Related Report
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  • [Journal Article] Dissecting the mechanism of NOP56 GGCCUG repeat-associated non-AUG translation using cell-free translation systems2025

    • Author(s)
      Hasumi Mayuka、Ito Hayato、Machida Kodai、Niwa Tatsuya、Taminato Tomoya、Nagai Yoshitaka、Imataka Hiroaki、Taguchi Hideki
    • Journal Title

      Journal of Biological Chemistry

      Volume: 301 Issue: 4 Pages: 108360-108360

    • DOI

      10.1016/j.jbc.2025.108360

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    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Polyamines enhance repeat-associated non-AUG translation from CCUG repeats by stabilizing the tertiary structure of RNA2025

    • Author(s)
      Oguro Akihiro、Uemura Takeshi、Machida Kodai、Kitajiri Kanta、Tajima Ayasa、Furuchi Takemitsu、Kawai Gota、Imataka Hiroaki
    • Journal Title

      Journal of Biological Chemistry

      Volume: 301 Issue: 3 Pages: 108251-108251

    • DOI

      10.1016/j.jbc.2025.108251

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    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] High-throughput screening for a SARS-CoV-2 frameshifting inhibitor using a cell-free protein synthesis system2024

    • Author(s)
      Machida Kodai、Tanaka Rin、Miki Seraya、Noseda Shotaro、Yuasa-Sunagawa Mayumi、Imataka Hiroaki
    • Journal Title

      BioTechniques

      Volume: 76 Issue: 4 Pages: 161-168

    • DOI

      10.2144/btn-2023-0102

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  • [Journal Article] Reconstitution of C9orf72 GGGGCC repeat-associated non-AUG translation with purified human translation factors.2023

    • Author(s)
      Ito H., Machida K., Ueyama M., Nagai Y., Imataka H., Taguchi H.
    • Journal Title

      Sci. Rep.

      Volume: 13(1) Issue: 1 Pages: 22826-22826

    • DOI

      10.1038/s41598-023-50188-z

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  • [Journal Article] Extracellular aaRSs drive autoimmune and inflammatory responses in rheumatoid arthritis via the release of cytokines and PAD42023

    • Author(s)
      Kimura A, Takagi T, Thamamongood T, Sakamoto S, Ito T, Seki I, Okamoto M, Aono H, Serada S, Naka T, Imataka H, Miyake K, Ueda T, Miyanokoshi M, Wakasugi K, Iwamoto N, Ohmagari N, Iguchi T, Nitta T, Takayanagi H, Yamashita H, Kaneko H, Tsuchiya H, Fujio K, Handa H, Suzuki H.
    • Journal Title

      Annals of the Rheumatic Diseases

      Volume: 82 Issue: 9 Pages: 1153-1161

    • DOI

      10.1136/ard-2023-224055

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    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Nascent peptide-induced translation discontinuation in eukaryotes impacts biased amino acid usage in proteomes2022

    • Author(s)
      Ito Yosuke、Chadani Yuhei、Niwa Tatsuya、Yamakawa Ayako、Machida Kodai、Imataka Hiroaki、Taguchi Hideki
    • Journal Title

      Nature Communications

      Volume: 13 Issue: 1 Pages: 7451-7451

    • DOI

      10.1038/s41467-022-35156-x

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  • [Presentation] 小胞体機能を模したプロテオリポソームの作製とその機能解析2025

    • Author(s)
      金光風香, 町田幸大, 今高寛晃
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  • [Presentation] リコンビナントSRP を利用した再構成型翻訳系の拡張2025

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      豊田紗綾, 町田幸大, 今高寛晃
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      第19 回無細胞生命科学研究会
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  • [Presentation] Sporogen-AO1 の真核細胞特異的翻訳翻訳阻害活性2025

    • Author(s)
      野瀬田奨太郎, 町田幸大, 今高寛晃
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      第19 回無細胞生命科学研究会
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  • [Presentation] 転写から翻訳へ2024

    • Author(s)
      今高寛晃
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      転写研究会
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  • [Presentation] In vitro translation systems for drug discovery and synthetic biology2024

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      今高寛晃
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    • Author(s)
      今高寛晃
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      第47回日本分子生物学会年会 MBSJ 2024 シンポジウム
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  • [Presentation] Insights into the role of eukaryotic translation initiation factor 3 (eIF3) on Hepatitis C virus IRES-mediated translation2024

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      Wakana Iwasaki, Kazuhiro Kashiwagi, Ayako Sakamoto, Madoka Nishimoto, Mari Takahashi, Kodai Machida, Hiroaki Imataka, Koshi Imami, Akinobu Matsumoto, Yuichi Shichino, Shintaro Iwasaki and Takuhiro Ito
    • Organizer
      第25回日本RNA学会
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  • [Presentation] Effect of polyamines on RAN translation from CCUG repeats2024

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      Akihiro Oguro, Takeshi Uemura, Kodai Machida, Ayasa Tajima, Gota Kawai, and Hiroaki Imataka
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      International Conference on the Biological Roles of Polyamines 2024 7th Yamada Symposium 2024
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  • [Presentation] In vitro arginylation of beta-actin and its functional analysis2024

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      金光風香、豊田紗綾、弓田眞子、砂川真弓、町田幸大、今高寛晃
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    • Author(s)
      豊田紗綾、金光風香、弓田眞子、砂川真弓、町田幸大、今高寛晃
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  • [Presentation] Analysis of a novel inhibitor against eukaryotes-specific translation2024

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      野瀨田奨太郎、町田幸大、今高寛晃
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  • [Presentation] Polyamines enhance RAN translation by stabilizing the tertiary structure of repeat RNA2024

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      小黒明広,植村武史,町田幸大,田島彩沙,河合剛太,今高寛晃
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  • [Presentation] ER連動型ヒト因子由来・再構成型翻訳システムの開発2024

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      砂川真弓, 金光風香, 豊田紗綾, 岡林瑞希, 村井優哉, 井上翼, 町田幸大, 今高寛晃
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  • [Presentation] C9orf72-GGGGCC リピートで生じるRepeat Associated Non-AUG(RAN)翻訳のヒト翻訳因子による再構成型翻訳系を用いた分子機構解析  伊藤隼人, 町田幸大, 蓮見眞由香, 上山盛夫, 永井義隆,2024

    • Author(s)
      伊藤隼人, 町田幸大, 蓮見眞由香, 上山盛夫, 永井義隆, 今高寛晃, 田口英樹
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      町田幸大、北尻寛太、今高寛晃
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  • [Presentation] ER連動型ヒト因子由来・再構成型翻訳システムの開発2023

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      砂川真弓, 井上翼, 岡林瑞希, 金光風香, 豊田紗綾, 町田幸大, 今高寛晃
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  • [Presentation] ポリアミンによるRAN翻訳の誘導効果の解析2023

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      小黒明広,植村武史,町田幸大,田島彩沙,河合剛太,今高寛晃
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  • [Presentation] In vitro reconstitution and elucidation of noncanonical translation2022

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      町田 幸大、辻本宗佑、砂川真弓、今高寛晃
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  • [Presentation] In vitro analysis of noncanonical Translation2022

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    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] ポリアミンがCAG リピート由来の非標準翻訳に与える影響2022

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      町田 幸大, 今高 寛晃
    • Organizer
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  • [Presentation] 2Aペプチド自己切断阻害剤のスクリーニング2022

    • Author(s)
      Miki Seiya三木世良哉、Machida Kodai(町田幸大)、Imataka Hiroaki(今高寛晃)
    • Organizer
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  • [Presentation] SARS-CoV2 特異的フレームシフト阻害剤のスクリーニング2022

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  • [Presentation] Reconstitution of c9orf72 (GGGGCC)-Repeat Associated Non-AUG translation with purified human translation factors2022

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      Hayato Ito, Kodai Machida, Morio Ueyama, Yoshitaka Nagai, Hiroaki Imataka, Hideki Taguchi
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  • [Presentation] 無細胞翻訳系を用いたSCA36に関わるリピート関連非AUG(RAN)翻訳の分子機構解析2022

    • Author(s)
      蓮見真由美 伊藤隼人 町田幸大 永井義隆 今高寛晃 田口英樹
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      第45回日本分子生物学会年会
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      2022 Annual Research Report

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Published: 2022-04-19   Modified: 2025-12-26  

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