| Project/Area Number |
23K23969
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| Project/Area Number (Other) |
22H02706 (2022-2023)
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| Research Category |
Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
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| Allocation Type | Multi-year Fund (2024)
Single-year Grants (2022-2023) |
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| Section | 一般 |
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| Review Section |
Basic Section 45040:Ecology and environment-related
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| Research Institution | The Museum of Nature and Human Activities, Hyogo |
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Principal Investigator |
京極 大助 兵庫県立人と自然の博物館, 兵庫県立人と自然の博物館, 研究員 (00771875)
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| Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) |
高橋 鉄美 兵庫県立大学, 自然・環境科学研究所, 教授 (70432359)
藤井 壮太 東京大学, 大学院農学生命科学研究科(農学部), 准教授 (90716713)
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| Project Period (FY) |
2022-04-01 – 2026-03-31
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| Project Status |
Granted (Fiscal Year 2024)
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| Budget Amount *help |
¥16,900,000 (Direct Cost: ¥13,000,000、Indirect Cost: ¥3,900,000)
Fiscal Year 2025: ¥3,120,000 (Direct Cost: ¥2,400,000、Indirect Cost: ¥720,000)
Fiscal Year 2024: ¥3,640,000 (Direct Cost: ¥2,800,000、Indirect Cost: ¥840,000)
Fiscal Year 2023: ¥1,950,000 (Direct Cost: ¥1,500,000、Indirect Cost: ¥450,000)
Fiscal Year 2022: ¥8,190,000 (Direct Cost: ¥6,300,000、Indirect Cost: ¥1,890,000)
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| Keywords | 性選択 / 性的対立 / GWAS / 花粉 / 花寿命 |
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| Outline of Research at the Start |
受粉した花は、受粉されなかった花よりも早く枯れる。枯死のような花の“行動”はその花自身の形質だと思われがちだが、受粉した花粉の形質が花の行動に影響しているという証拠がある。また理論的には、受粉した先の花を枯死させるような性質をもった花粉が進化しうる。本研究では、受粉先の花の枯死を早める因子を花粉が持っているという作業仮説のもと、シロイヌナズナを材料にこの花粉側因子の同定および進化史を含むその特徴の解明を目指す。具体的には花粉側因子の遺伝子を特定し、その性質を明らかにするとともに、その遺伝子の適応上の意義についても検討を行う。
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| Outline of Annual Research Achievements |
シロイヌナズナ約220アクセッションの花粉を標準系統（Sha）のめしべに受粉し、乳頭細胞が枯死するまでの時間を計測することで、ゲノムワイド関連解析用の表現型データを取得した。現在までにおおむね700程度のサンプルサイズを得ている（枯死の開始と終了など複数形質を測定しているため、サンプルサイズは形質ごとに多少異なる）。公開されているリシーケンスデータを処理するパイプラインを構築し、得られた表現型と相関するSNPを探索した。遺伝子発現情報も参考に、いくつかの候補遺伝子を選定した。また、今後用いるためのバイオインフォマティクス解析用のパイプライン構築がほぼ完了した。
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| Current Status of Research Progress |
Current Status of Research Progress
2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.
Reason
初年度は半導体不足による実験機器の納品遅れに加え、飼育施設の不具合などのトラブルもあったが、２年度目に必要な表現型データの取得を終え、ゲノムワイド関連解析を実施できた。またこれと並行してバイオインフォマティクス解析のパイプラインもほぼ構築できた。
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| Strategy for Future Research Activity |
いくつかの解析の不具合が明らかになったため、早急に再度の解析を行う。絞り込んだ候補遺伝子のノックアウトにより、花粉の表現型に影響している遺伝子の特定を進める。これと並行して、候補遺伝子の集団遺伝解析により、選択の痕跡を探すことで、逆遺伝学的アプローチでも関連する遺伝子の探索を行う。
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