Research Project
Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
ヒトゲノムの多くはウイルス様配列によって占められている.本研究計画では,膨大な量のヒトゲノム短鎖配列から,内在性レトロウイルス(ERV)を含む多様なウイルス様配列を探索し,ウイルスゲノムの挿入からみた人類の多様性を明らかにする.これまで一般的に行われてきた配列相同性だけを用いた探索ではなく,機械学習を用いた新たなウイルス様配列探索手法を開発し利用する.人類の移住の歴史を明らかにする新たなマーカーの発見,特定のウイルスと地域集団とのかかわり,ウイルス様配列の挿入に関わる自然選択の検出などを行い,20万年前以降の人類とウイルスの歴史的なかかわりを明らかにする.