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Regulation of ion channel by lipid molecules and structural recognition of phosphoinositide

Research Project

Project/Area Number 23K24066
Project/Area Number (Other) 22H02804 (2022-2023)
Research Category

Grant-in-Aid for Scientific Research (B)

Allocation TypeMulti-year Fund (2024)
Single-year Grants (2022-2023)
Section一般
Review Section Basic Section 48020:Physiology-related
Research InstitutionOsaka University

Principal Investigator

岡村 康司  大阪大学, 大学院医学系研究科, 教授 (80201987)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 好岡 大輔  大阪大学, 大学院医学系研究科, 助教 (00883084)
米澤 康滋  近畿大学, 先端技術総合研究所, 教授 (40248753)
河合 喬文  大阪大学, 大学院医学系研究科, 助教 (70614915)
Project Period (FY) 2022-04-01 – 2025-03-31
Project Status Granted (Fiscal Year 2024)
Budget Amount *help
¥17,290,000 (Direct Cost: ¥13,300,000、Indirect Cost: ¥3,990,000)
Fiscal Year 2024: ¥5,850,000 (Direct Cost: ¥4,500,000、Indirect Cost: ¥1,350,000)
Fiscal Year 2023: ¥6,760,000 (Direct Cost: ¥5,200,000、Indirect Cost: ¥1,560,000)
Fiscal Year 2022: ¥4,680,000 (Direct Cost: ¥3,600,000、Indirect Cost: ¥1,080,000)
Keywordsイオンチャンネル / イノシトールリン脂質 / 電位センサー / ホスホイノシチド / 非天然アミノ酸 / 光分解性 / イオンチャネル / リン脂質
Outline of Research at the Start

継続課題のため、記入しない。

Outline of Annual Research Achievements

Ci-VSPについて活性中心領域の単一アミノ酸変異によって電位センサーから酵素活性への共役効率を増強できることを確認した。またcaged lysine実験系のコントロール実験を行うとともにGABA(A)Rについて変異実験と分子動力学計算によりPI(4,5)P2感受性に関わるアミノ酸部位の特定を試みた。
① Ci-VSPのK365がメチオニンに置換された変異体についてホスホイノシチドセンサーによる計測において、変異体ではPI(4,5)P2およびPI(3,4)P2に対する脱リン酸化活性のいずれも野生型に比して増強していた。K365M変異体はマラカイトグリーンアッセイにより野生型と比較して基質特異性の相違は見られず、共役効率が増強していると考えられた。ゼブラフィッシュVSPのアミノ酸変異体においても同様であった。
②HCKの取り込み効率をPLC-delta PH domain (K30TAG )EGFPの膜へのターゲットによる蛍光増加により確認しcaged lysineの分子ツールが機能することを確認した。
③神経細胞に発現するカリウムチャネルKCNQ3TのLys260をHCKに置換した分子が細胞膜に発現することを確認した。
④GABA(A)Rについて、VSPによるPI(4,5)P2枯渇のチャネル活性への影響を調べた。内向き電流計測では卵母細胞由来の内在性電流が重なり定量的評価が難しく、脱分極時の外向きGABA(A)R電流を指標にすること等により定量する手法を確立した。野生型GABA(A)RではVSPによるPI(4,5)P2 枯渇での電流量の変化が見られない一方M3-M4ループの塩基性アミノ酸の変異分子ではPI(4,5)P2枯渇により電流の減少が観察された。
⑤GABA(A)Rについて粗子化モデル分子動力学計算をおこないPI(4,5)P2が細胞内側塩基性アミノ酸に隣接する状況が観察された。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.

Reason

PLC-delta PH domain (K30TAG )EGFPおよびKCNQT K260TAGについて、HCKを導入し、タンパク質の発現を確認できたことから、caged lysine 法をイオンチャネルに適用する道筋が明確になった。

Strategy for Future Research Activity

今年度の成果によりcaged lysine 法をイオンチャネルに適用する道筋が明確になったので、今後はUV光を照射前後でのチャネル活性の変化を確認し、またVSPや複数種のイオンチャネルに適用することで、本手法の有効性を確認するとともに、UV波長や照射時間や分子の発現のための実験条件など、詳細な条件の検討を進めていく。

Report

(1 results)
  • 2022 Annual Research Report
  • Research Products

    (24 results)

All 2023 2022

All Journal Article (6 results) (of which Int'l Joint Research: 2 results,  Peer Reviewed: 5 results,  Open Access: 5 results) Presentation (18 results) (of which Int'l Joint Research: 4 results,  Invited: 1 results)

  • [Journal Article] What voltage-sensing phosphatases can reveal about the mechanisms of ion channel regulation by phosphoinositides2023

    • Author(s)
      Okamura Yasushi、Yoshioka Daisuke
    • Journal Title

      Biochemical Society Transactions

      Volume: 51 Issue: 2 Pages: 827-839

    • DOI

      10.1042/bst20221065

    • Related Report
      2022 Annual Research Report
    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Role of K364 next to the active site cysteine in voltage-dependent phosphatase activity of Ci-VSP2023

    • Author(s)
      Paixao Ian Costa、Mizutani Natsuki、Matsuda Makoto、Andriani Rizki Tsari、Kawai Takafumi、Nakagawa Atsushi、Okochi Yoshifumi、Okamura Yasushi
    • Journal Title

      Biophysical Journal

      Volume: - Issue: 11 Pages: 2267-2284

    • DOI

      10.1016/j.bpj.2023.01.022

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  • [Journal Article] Critical contributions of pre-S1 shoulder and distal TRP box in DAG-activated TRPC6 channel by PIP2 regulation2022

    • Author(s)
      Mori Masayuki X.、Okada Ryo、Sakaguchi Reiko、Hase Hideharu、Imai Yuko、Polat Onur K.、Itoh Satoru G.、Okumura Hisashi、Mori Yasuo、Okamura Yasushi、Inoue Ryuji
    • Journal Title

      Scientific Reports

      Volume: 12 Issue: 1 Pages: 1-13

    • DOI

      10.1038/s41598-022-14766-x

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    • Author(s)
      Kawai T、Narita H、Konno K、Akter S、Andriani RT、Iwasaki H、Nishikawa S、Yokoi N、Fukata Y、Fukata M、Wiriyasermkul P、Kongpracha P、Nagamori S、Takao K、Miyakawa T、Abe M、Sakimura K、Watanabe M、Nakagawa A、Okamura Y
    • Journal Title

      Biochemical Journal

      Volume: 479 Issue: 11 Pages: 1127-1145

    • DOI

      10.1042/bcj20220033

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    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
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    • Author(s)
      Mizutani Natsuki、Kawanabe Akira、Jinno Yuka、Narita Hirotaka、Yonezawa Tomoko、Nakagawa Atsushi、Okamura Yasushi
    • Journal Title

      Proceedings of the National Academy of Sciences

      Volume: 119 Issue: 26 Pages: 2200364119-2200364119

    • DOI

      10.1073/pnas.2200364119

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      2022 Annual Research Report
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    • Author(s)
      岡村 康司
    • Journal Title

      ノーベル賞の神経科学 Clinical Neuroscience

      Volume: vol.40 No.8 Pages: 964-968

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      Yoshifumi Okochi, Yuka Jinno, Yasushi Okamura
    • Organizer
      The 100th Anniversary Annual Meeting of The Physiological Society of Japan
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  • [Presentation] Regulation of voltage-sensing phosphatase (VSP) by its substrate, phosphoinositide PI(4,5)P22023

    • Author(s)
      Natsuki Mizutani, Yasushi Okamura
    • Organizer
      The 100th Anniversary Annual Meeting of The Physiological Society of Japan
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    • Author(s)
      Adisorn Ratanayotha, Atsuo Iida, Takafumi Kawai, Eiichi Hondo, Yasushi Okamura
    • Organizer
      The 100th Anniversary Annual Meeting of The Physiological Society of Japan
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      Daisuke Yoshioka, Yasushi Okamura
    • Organizer
      The 100th Anniversary Annual Meeting of The Physiological Society of Japan
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      Risa Mori-Kreiner, Takafumi Kawai, Naoyuki Miyashita, Yasushige Yonezawa, Yasushi Okamura
    • Organizer
      The 100th Anniversary Annual Meeting of The Physiological Society of Japan
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      2022 Annual Research Report
  • [Presentation] Inhibitory modulation of voltage- and pH-gated Slo3 potassium channel by zinc2023

    • Author(s)
      Rizki Tsari Andriani, Yasushi Okamura, Takafumi Kawai
    • Organizer
      The 100th Anniversary Annual Meeting of The Physiological Society of Japan
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      2022 Annual Research Report
  • [Presentation] The effect of Vitamin D3 on the sodium phosphate cotransporter family SLC342023

    • Author(s)
      Junxian Zhou, Yoshifumi Okochi, Yasushi Okamura
    • Organizer
      The 100th Anniversary Annual Meeting of The Physiological Society of Japan
    • Related Report
      2022 Annual Research Report
  • [Presentation] Is voltage-sensing phosphatase (VSP) regulated by phosphoinositide, PI(4,5)P2?: question revisited with Anap2023

    • Author(s)
      Natsuki Mizutani, Yasushi Okamura
    • Organizer
      67th Biophysical society Annual meeting
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    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] SINGLE MOLECULE IMAGING REVEALS A RELATIONSHIP BETWEEN PI(4,5)P2 BINDING SITES AND TRAFFICKING REGULATION OF VOLTAGE-GATEDPOTASSIUM CHANNELS2023

    • Author(s)
      Daisuke Yoshioka, Yasushi Okamura
    • Organizer
      67th Biophysical Society Annual Meeting
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    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] 色変更型Nav1.6-Flexマウスを用いたNav1.6タンパクのターンオーバーの解析2023

    • Author(s)
      大河内善史、好岡大輔、阿部学、﨑村建司、岡村康司
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      先端モデル動物支援プラットフォーム(AdAMS) 2022年度成果発表会
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  • [Presentation] GABAA 受容体の PI(4,5)P2 感受性に関する検証2022

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      森 梨沙、河合 喬文、岡村 康司
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      第114回近畿生理学談話会
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      大河内善史、神野有香、岡村康司
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      第114回近畿生理学談話会
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    • Author(s)
      RATANAYOTHA A,MATSUDA M,KIMURA Y,TAKENAGA F,MIZUNO T,HOSSAIN M I,HIGASHIJIMA S,KAWAI T,OGASAWARA M,OKAMURA Y.
    • Organizer
      日本動物学会第93回早稲田大会2022
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    • Author(s)
      水谷 夏希、川鍋 陽、神野 有香、成田 宏隆、米澤 智子、中川 敦史、岡村 康司
    • Organizer
      生理研研究会「構造情報を基盤とした膜機能分子の生理機能理解に向けて」
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      2022 Annual Research Report
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    • Author(s)
      好岡 大輔、岡村 康司
    • Organizer
      先端モデル動物支援プラットフォーム 若手支援技術講習会
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    • Author(s)
      周俊先、大河内善史、水谷夏希、瀬川博子、岡村康司
    • Organizer
      第16回トランスポーター研究会年会
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    • Author(s)
      Okamura Y
    • Organizer
      第11回国際ホヤ学会
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    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] Mechanism of Electrochemical Coupling in Voltage-Sensing Phosphatase, VSP2022

    • Author(s)
      Natsuki Mizutani, Yasushi Okamura
    • Organizer
      Ion Channels Gordon Research Seminar, Conference
    • Related Report
      2022 Annual Research Report
    • Int'l Joint Research

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Published: 2022-04-19   Modified: 2024-12-25  

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