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Construction of a therapeutic platform for pulmonary MAC disease through identification of the essential genes covering genetic diversity of clinical MAC strains

Research Project

Project/Area Number 23K24374
Project/Area Number (Other) 22H03115 (2022-2023)
Research Category

Grant-in-Aid for Scientific Research (B)

Allocation TypeMulti-year Fund (2024)
Single-year Grants (2022-2023)
Section一般
Review Section Basic Section 54030:Infectious disease medicine-related
Research InstitutionNiigata University

Principal Investigator

立石 善隆  新潟大学, 医歯学系, 准教授 (30433296)

Project Period (FY) 2022-04-01 – 2025-03-31
Project Status Granted (Fiscal Year 2024)
Budget Amount *help
¥17,550,000 (Direct Cost: ¥13,500,000、Indirect Cost: ¥4,050,000)
Fiscal Year 2024: ¥5,070,000 (Direct Cost: ¥3,900,000、Indirect Cost: ¥1,170,000)
Fiscal Year 2023: ¥4,810,000 (Direct Cost: ¥3,700,000、Indirect Cost: ¥1,110,000)
Fiscal Year 2022: ¥7,670,000 (Direct Cost: ¥5,900,000、Indirect Cost: ¥1,770,000)
Keywords非結核性抗酸菌 / 肺MAC症 / 生存必須遺伝子 / 遺伝学的多様性
Outline of Research at the Start

肺MAC症病原体は結核菌と異なり遺伝学的多様性が著しいことから、単一菌株を使った薬剤スクリーニングで新規治療標的を見出すのは困難である。本研究では、トランスポゾンシーケンシング(TnSeq)により、臨床菌株間で共通の生存必須遺伝子を同定することにより、遺伝学的多様性を克服した肺MAC症病原菌に対する新規治療基盤を構築する。

Outline of Annual Research Achievements

昨年度、Mycobacterium intracellulare臨床菌株とATCC標準株との間で遺伝子必須性を比較したところ、臨床菌株において、糖新生系遺伝子および7型分泌装置遺伝子群の遺伝子必須性が増加し、輸送系遺伝子や二成分制御系遺伝子、解糖系の遺伝子必須性が減少していることを見出した。すなわち、M. intracellulare臨床菌株において、ATCC13950における低酸素バイオフィルム形成必須遺伝子の遺伝子必須性が高まり、低酸素下での増殖に有利となることを見出した。今年度は、生体内感染において、バイオフィルム形成必須遺伝子の必須性が高まっているかを検討した。高病原性菌株Mycobacterium intracellulare M.i.198と中等度病原性菌株M. intracellulare M.i.27のTn変異ライブラリーを作製し、6週齢メスC57BL/6マウスに経気管投与で感染させた。Tn変異株作製、ゲノムDNA抽出、TnSeqのためのDNAライブラリー調整は既報の通り実施した(Tateishi Y. Sci Rep. 2020)双方の菌株に共通の生体内生存必須遺伝子を206遺伝子検出した。共通の生存必須遺伝子のうち、イソクエン酸リアーゼ、二成分制御系蛋白PknG、プロテアソームサブユニットを含めた41遺伝子が、M. intracellulare標準株ATCC13950の試験管内低酸素バイオフィルム形成必須遺伝子(計175遺伝子)と共通していた。生体内生存必須遺伝子には、低酸素バイオフィルム形成必須遺伝子と共通しているものがあった。バイオフィルム形成マーカーとなる生存必須遺伝子を見出し、生体内でのバイオフィルム形成を検出できる実験系の確立を目指す。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.

Reason

臨床菌株とATCC標準株との間での遺伝子必須性の相違を見出し、機能解析による証明も行った。これらの遺伝子必須性の相違をin vivoで検討すべく、マウス感染実験に進めていることから、計画通りの進捗であると判断する。

Strategy for Future Research Activity

これまでの成果を論文としてまとめる作業に入る。肺MAC症の薬剤標的となりうる遺伝子に対して、創薬への発展が可能かどうか、情報収集等を行う。また、バイオフィルム形成マーカーとなる生存必須遺伝子を見出し、生体内でのバイオフィルム形成を検出できる実験系の確立を目指す。

Report

(2 results)
  • 2023 Annual Research Report
  • 2022 Annual Research Report
  • Research Products

    (16 results)

All 2024 2023 2022

All Journal Article (9 results) (of which Int'l Joint Research: 5 results,  Peer Reviewed: 9 results,  Open Access: 9 results) Presentation (7 results) (of which Invited: 1 results)

  • [Journal Article] Genetic engineering employing MPB70 and its promoter enables efficient secretion and expression of foreign antigen in bacillus Calmette Gu?rin (BCG) Tokyo2024

    • Author(s)
      Takeishi Atsuki、Shaban Amina K.、Kakihana Taichi、(22 persos)、Matsumoto Sohkichi
    • Journal Title

      Microbiology and Immunology

      Volume: 68 Issue: 4 Pages: 130-147

    • DOI

      10.1111/1348-0421.13116

    • Related Report
      2023 Annual Research Report
    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Dynamic action of an intrinsically disordered protein in DNA compaction that induces mycobacterial dormancy2023

    • Author(s)
      Nishiyama Akihito、Shimizu Masahiro、Narita Tomoyuki、Kodera Noriyuki、Ozeki Yuriko、Yokoyama Akira、Mayanagi Kouta、Yamaguchi Takehiro、Hakamata Mariko、Shaban Amina?Kaboso、Tateishi Yoshitaka、Ito Kosuke、Matsumoto Sohkichi
    • Journal Title

      Nucleic Acids Research

      Volume: 52 Issue: 2 Pages: 816-830

    • DOI

      10.1093/nar/gkad1149

    • Related Report
      2023 Annual Research Report
    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Mycobacterial DNA-binding protein 1 is critical for BCG survival in stressful environments and simultaneously regulates gene expression2023

    • Author(s)
      Shaban Amina K.、Gebretsadik Gebremichal、Hakamata Mariko、Takihara Hayato、Inouchi Erina、Nishiyama Akihito、Ozeki Yuriko、Tateishi Yoshitaka、Nishiuchi Yukiko、Yamaguchi Takehiro、Ohara Naoya、Okuda Shujiro、Matsumoto Sohkichi
    • Journal Title

      Scientific Reports

      Volume: 13 Issue: 1 Pages: 14157-14157

    • DOI

      10.1038/s41598-023-40941-9

    • Related Report
      2023 Annual Research Report
    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Antibodies against native proteins of Mycobacterium tuberculosis?can detect pulmonary tuberculosis patients2023

    • Author(s)
      Dewi Desak Nyoman Surya Suameitria、Mertaniasih Ni Made、Soedarsono、Hagino Kimika、Yamazaki Tomoya、Ozeki Yuriko、Artama Wayan Tunas、Kobayashi Haruka、Inouchi Erina、Yoshida Yutaka、Ishikawa Satoshi、Shaban Amina Kaboso、Tateishi Yoshitaka、Nishiyama Akihito、Ato Manabu、Matsumoto Sohkichi
    • Journal Title

      Scientific Reports

      Volume: 13 Issue: 1 Pages: 12685-12685

    • DOI

      10.1038/s41598-023-39436-4

    • Related Report
      2023 Annual Research Report
    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Virulence of Mycobacterium intracellulare clinical strains in a mouse model of lung infection - role of neutrophilic inflammation in disease severity.2023

    • Author(s)
      Tateishi Y, Ozeki Y, Nishiyama A, Miki M, Maekura R, Kida H, Matsumoto S
    • Journal Title

      BMC Microbiol

      Volume: 23 Issue: 1 Pages: 94-94

    • DOI

      10.1186/s12866-023-02831-y

    • Related Report
      2023 Annual Research Report 2022 Annual Research Report
    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Lysocin E Targeting Menaquinone in the Membrane of Mycobacterium tuberculosis Is a Promising Lead Compound for Antituberculosis Drugs2022

    • Author(s)
      Geberetsadik G, Inaizumi A, Nishiyama A, Yamaguchi T, Hamamoto H, Panthee S, Tamaru A, Hayatsu M, Mizutani Y, Kaboso SA, Hakamata M, Ilinov A, Ozeki Y, Tateishi Y, Sekimizu K, Matsumoto S.
    • Journal Title

      Antimicrob Agents Chemother

      Volume: 66 Issue: 9

    • DOI

      10.1128/aac.00171-22

    • Related Report
      2022 Annual Research Report
    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Long-Term Prognosis and Antimycobacterial Glycolipid Antibody as Biomarker in Mycobacterium avium-intracellulare Complex Pulmonary Disease.2022

    • Author(s)
      Maekura R, Miki K, Tateishi Y, Matsumoto S, Kitada S, Miki M, Kida H.
    • Journal Title

      Microbiol Spectr

      Volume: 10 Issue: 3

    • DOI

      10.1128/spectrum.00530-22

    • Related Report
      2022 Annual Research Report
    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Monitoring IgG against Mycobacterium tuberculosis proteins in an Asian elephant cured of tuberculosis that developed from long-term latency.2022

    • Author(s)
      Ishikawa S, Ozeki Y, Suga S, Mukai Y, Kobayashi H, Inouchi E, Kaboso SA, Gebretsadik G, Dewi DNSS, Nishiyama A, Tateishi Y, Takihara H, Okuda S, Yoshida S, Misawa N, Matsumoto S.
    • Journal Title

      Sci Rep

      Volume: 12 Issue: 1 Pages: 4310-4310

    • DOI

      10.1038/s41598-022-08228-7

    • Related Report
      2022 Annual Research Report
    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Identification and functional analysis of a new type of Z,E-mixed prenyl reductase from mycobacteria2022

    • Author(s)
      Abe, T., Hakamata, M., Nishiyama, A., Tateishi, Y., Matsumoto, S., Hemmi, H., Ueda, D., and Sato, T.
    • Journal Title

      The FEBS journal

      Volume: - Issue: 16 Pages: 4981-4997

    • DOI

      10.1111/febs.16412

    • Related Report
      2022 Annual Research Report
    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Presentation] Virulence of Mycobacterium intracellulare clinical strains in a mouse model of lung infection ─Role of neutrophilic inflammation in disease severity2023

    • Author(s)
      Yoshitaka Tatesihi, Mari Miki, Ryoji Maekura, Hiroshi Kida, Sohkichi Matsumoto
    • Organizer
      第63回日本呼吸器学会学術総会
    • Related Report
      2023 Annual Research Report
  • [Presentation] バイオフィルム2023

    • Author(s)
      立石 善隆、松本 壮吉
    • Organizer
      第98回日本結核・非結核性抗酸菌症学会学術講演会
    • Related Report
      2023 Annual Research Report
    • Invited
  • [Presentation] 機能ゲノム解析によるMycobacterium intracellulareの低酸素適応機構の解明2023

    • Author(s)
      立石 善隆、尾関 百合子、西山 晃史、松本 壮吉
    • Organizer
      第60回 日本細菌学会中部支部総会
    • Related Report
      2023 Annual Research Report
  • [Presentation] 生存必須遺伝子プロファイルからみた非結核性抗酸菌の生体内感染と低酸素バイオフィルム形成との共通性2023

    • Author(s)
      立石 善隆、 松本 壮吉
    • Organizer
      第37回 日本バイオフィルム学会学術集会
    • Related Report
      2023 Annual Research Report
  • [Presentation] 生存必須遺伝子プロファイルからみたMycobacterium intracellulare臨床菌株の低酸素適応2023

    • Author(s)
      立石 善隆, 尾関 百合子, 西山 晃史, 松本 壮吉
    • Organizer
      第96回日本細菌学会総会
    • Related Report
      2022 Annual Research Report
  • [Presentation] 非結核性抗酸菌Mycobacterium intracellulare臨床菌株の実験的病原性および薬剤治療効果の検討2022

    • Author(s)
      立石 善隆, 尾関 百合子, 西山 晃史, 松本 壮吉
    • Organizer
      第59回日本細菌学会中部支部総会
    • Related Report
      2022 Annual Research Report
  • [Presentation] 非結核性抗酸菌臨床菌株におけるゲノムワイドな遺伝子必須性の相違と低酸素バイオフィルム形成との関係2022

    • Author(s)
      立石 善隆, 松本 壮吉
    • Organizer
      第35回日本バイフォルム学
    • Related Report
      2022 Annual Research Report

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Published: 2022-04-19   Modified: 2024-12-25  

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