シングルセル解析を用いたマウス胎仔皮膚再生メカニズムの解明

• Project/Area Number: 23K24511
• Project/Area Number (Other): 22H03252 (2022-2023)
• Research Category: Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
• Allocation Type: Multi-year Fund (2024); Single-year Grants (2022-2023)
• Section: 一般
• Review Section: Basic Section 56070:Plastic and reconstructive surgery-related
• Research Institution: Keio University
• Principal Investigator: 貴志 和生 慶應義塾大学, 医学部(信濃町), 教授 (40224919)
• Co-Investigator(Kenkyū-buntansha): 岡部 圭介 慶應義塾大学, 医学部(信濃町), 講師 (50445350) ; 荒牧 典子 慶應義塾大学, 医学部(信濃町), 講師 (80365311)
• Project Period (FY): 2022-04-01 – 2025-03-31
• Project Status: Granted (Fiscal Year 2024)
• Budget Amount: ¥17,550,000 (Direct Cost: ¥13,500,000、Indirect Cost: ¥4,050,000); Fiscal Year 2024: ¥5,070,000 (Direct Cost: ¥3,900,000、Indirect Cost: ¥1,170,000); Fiscal Year 2023: ¥5,460,000 (Direct Cost: ¥4,200,000、Indirect Cost: ¥1,260,000); Fiscal Year 2022: ¥7,020,000 (Direct Cost: ¥5,400,000、Indirect Cost: ¥1,620,000)
• Keywords: 胎仔 / 再生 / シングルセル / 皮膚再生 / シングルセル解析 / 皮膚 / single cell

Outline of Research at the Start

Single cell解析を行い、皮膚の完全再生に働く細胞の組み合わせとその膜表面マーカー、真皮のリモデリングを起こさせ、真皮を再生させる細胞とそのマーカーの絞り込みを行う。

Outline of Annual Research Achievements

E13, E15, E17の創傷作成後24時間、48時間の創傷部辺縁皮膚ならび対側の正常皮膚を顕微鏡下に採取し、Chromium　10X Genomicsを用いて、Single cell解析を行い、皮膚の完全再生に働く細胞の組み合わせとその膜表面マーカー、真皮のリモデリングを起こさせ、真皮を再生させる細胞とそのマーカーの絞り込みを行った。ICR妊娠マウスを購入し、妊娠13日15日ならびに17日のマウスを全身麻酔下に開腹し、顕微鏡下に子宮を切開し胎仔手術を行い、胎仔側胸部に約2㎜の皮膚全層切開創を作成し、創部を回収後にコラゲナーゼ、ディスパーゼを含んだ混合試薬で組織を消化し、フィルターをかけ、創傷部周辺の細胞を回収する。回収した細胞の生存率、デブリの有無を確認した後に、Chromium　10X Genomicsを用いて、数千個の細胞に関してsingle cell transcriptome 3’遺伝子発現プロファイルとこれを用いたマルチオミックスを行った。Chromium controller装置を使用して、10xバーコードを付加したライブラリーの構築を行い、数千個のそれぞれの細胞から転写プロファイリングを実地し、類似のプロファイルを持つ細胞種をクラスターで特定し、それぞれの再生過程で発現している細胞種とその発現遺伝子の差異について解析を行った。

Current Status of Research Progress

2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.

Reason

計画書の通りに良好に結果が出ている。

Strategy for Future Research Activity

計画書に則って、研究を遂行する。