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Cellular survival strategy through ATR-dependent DNA replication stress tolerance

Research Project

Project/Area Number 23K24999
Project/Area Number (Other) 22H03745 (2022-2023)
Research Category

Grant-in-Aid for Scientific Research (B)

Allocation TypeMulti-year Fund (2024)
Single-year Grants (2022-2023)
Section一般
Review Section Basic Section 63020:Radiation influence-related
Research InstitutionNational Cancer Center Japan

Principal Investigator

塩谷 文章  国立研究開発法人国立がん研究センター, 研究所, ユニット長 (10627665)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 白石 友一  国立研究開発法人国立がん研究センター, 研究所, 分野長 (70516880)
Project Period (FY) 2022-04-01 – 2026-03-31
Project Status Granted (Fiscal Year 2024)
Budget Amount *help
¥17,420,000 (Direct Cost: ¥13,400,000、Indirect Cost: ¥4,020,000)
Fiscal Year 2025: ¥3,380,000 (Direct Cost: ¥2,600,000、Indirect Cost: ¥780,000)
Fiscal Year 2024: ¥3,380,000 (Direct Cost: ¥2,600,000、Indirect Cost: ¥780,000)
Fiscal Year 2023: ¥5,070,000 (Direct Cost: ¥3,900,000、Indirect Cost: ¥1,170,000)
Fiscal Year 2022: ¥5,590,000 (Direct Cost: ¥4,300,000、Indirect Cost: ¥1,290,000)
KeywordsDNA複製ストレス耐性 / DNA複製ストレス / ATR / ゲノム不安定性 / クロマチン / がん
Outline of Research at the Start

正常な細胞でがん遺伝子が活性化すると、DNA複製ストレスが生じ、DNA複製の進行を妨げることで、ほとんどの細胞は、発がんバリアの発動により死滅する。これと並行して選択されて生き残る細胞が生成される。しかし、正常細胞がこの細胞死を逃れて生き残りゲノムの不安定性を獲得し、がんを発症するメカニズムはまだ解明されていない。本研究ではKRASG12V誘発性の慢性的なDNA複製ストレスの要因としてヘテロクロマチン化に注目し、ATR-PrimPol依存的な再プライミングを中心としたDNA複製ストレス耐性機構を明らかにし、DNA複製ストレスに応答する細胞の生存戦略の解明をめざす。

Outline of Annual Research Achievements

がんドライバー変異に起因する高度なDNA複製ストレスが、ゲノム不安定化を促進し、がんの発生を加速することが示唆されている。正常細胞では過剰なDNA複製ストレスに対して、細胞老化や細胞死を誘導し、発がんバリア機構が発動するが、同時に選択的圧力の下で生き残る「がんの起源細胞」を生み出すことである。今年度は変異型KRASG12V発現肺線がんモデルにおいて得られた、ATR発現上昇が細胞の形質転換を促進するモデルを用いてKRASG12V発現によるゲノム動態解析からDNA複製ストレスの原因を検証した。KRASG12V発現に伴うヘテロクロマチン領域のマーカー(H3K27me3)を免疫染色法によって解析したところ、その上昇が認められ、かつその上昇は転写阻害剤(DRB)によって抑制されることを見出した。また、RNA発現解析を行い、転写抑制剤によって変動するRNA種を同定したところ、H3K27me3のChIP-seqシグナルが高い遺伝子群に発現の変動が認められた。このことは元来ヘテロクロマチン化され、転写が抑制されている遺伝子群がKRASG12Vによって発現が促進され、これを抑制するためにH3K27me3によるヘテロクロマチン化のフィードバックが生じる領域がDNA複製ストレスを引き起こす障害要因となることが示唆された。次にATR-PrimPolによるDNA複製ストレス耐性制御機構を明らかにするため、PrimPolのリン酸化解析を行なったところ、KRASG12Vの発現下でPrimPolのSer255のリン酸化を同定した。さらにPrimPolによる再プライミング活性はATR阻害剤及びChk1阻害剤によって抑制されたことから、DNA複製ストレス下におけるATR-Chk1経路に依存的にPrimPolが活性化することを見出した。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.

Reason

R5年度はコロナ禍の影響による研究の遅れの大部分を取り戻し、予定していたDNA複製ストレスの原因や複製ストレス耐性機構に関するPrimPol制御機構に関する実験を進めることができた。現在DNA複製ストレス耐性機構によるゲノム不安定性誘発解析を進めており、当初の予定通り研究を遂行しうる。

Strategy for Future Research Activity

申請者は変異型KRASG12V発現肺線がんモデルにおいて得られたクローンがATRを高発現すること、またATR-PrimPol依存的にDNA複製ストレス耐性機構がKRASG12V形質転換を促進するモデルを有している。本年度はKRASG12V発現によって誘導されるATRの発現亢進メカニズムについて、mRNA・タンパク質安定性、miRNAの関与について検証する。また、KRASG12V発現条件下において転写依存的なヘテロクロマチン領域がDNA複製ストレスの原因であることを見出していることから、DNA複製ストレス発生領域とPrimPol依存的な再プライミング領域の相関、さらにはこれらの領域がゲノム異常の発生領域となりうるかどうかを検証する。ヘテロクロマチン領域のマーカーとしてH3K27me3、PrimPol依存的複製の結果生じるssDNAを再プライミング領域マーカーとし、Proximity ligation assayを行う。また、KRASによって形質転換したクローンの全ゲノム解析を行い、SNV、SV、CNV、変異遺伝子等の解析を行い、形質転換後のゲノム不安定性について解析する。昨年度のRNA発現解析結果を用い、転写抑制剤によって変動するRNA転写領域(ヘテロクロマチン領域)とゲノム異常発生領域との相関解析を行う。さらに昨年度同定されたpPrimPol(Ser255)に対するウサギモノクロナール抗体の作成を試みる。

Report

(2 results)
  • 2023 Annual Research Report
  • 2022 Annual Research Report
  • Research Products

    (18 results)

All 2024 2023 2022 Other

All Int'l Joint Research (2 results) Journal Article (5 results) (of which Int'l Joint Research: 1 results,  Peer Reviewed: 5 results,  Open Access: 4 results) Presentation (10 results) (of which Int'l Joint Research: 3 results,  Invited: 2 results) Remarks (1 results)

  • [Int'l Joint Research] Harvard Medical School/MGH Cancer Center/Duke University(米国)

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    • Author(s)
      Uchida Chiharu、Niida Hiroyuki、Sakai Satoshi、Iijima Kenta、Kitagawa Kyoko、Ohhata Tatsuya、Shiotani Bunsyo、Kitagawa Masatoshi
    • Journal Title

      Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Molecular Cell Research

      Volume: 1870 Issue: 6 Pages: 119484-119484

    • DOI

      10.1016/j.bbamcr.2023.119484

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    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Emerging strategies for cancer therapy by ATR inhibitors2023

    • Author(s)
      Kimiyoshi Yano, Bunsyo, Shiotani
    • Journal Title

      Cancer Science

      Volume: - Issue: 7 Pages: 2709-2721

    • DOI

      10.1111/cas.15845

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  • [Journal Article] An ATR-PrimPol pathway confers tolerance to oncogenic KRAS-induced and heterochromatin-associated replication stress2023

    • Author(s)
      Igarashi Taichi、Mazevet Marianne、Yasuhara Takaaki、Yano Kimiyoshi、Mochizuki Akifumi、Nishino Makoto、Yoshida Tatsuya、Yoshida Yukihiro、Takamatsu Nobuhiko、Yoshimi Akihide、Shiraishi Kouya、Horinouchi Hidehito、Kohno Takashi、Hamamoto Ryuji、Adachi Jun、Zou Lee、Shiotani Bunsyo
    • Journal Title

      Nature Communications

      Volume: 14 Issue: 1 Pages: 4991-4991

    • DOI

      10.1038/s41467-023-40578-2

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    • Author(s)
      2.Uchida C, Niida H, Sakai S, Iijina K, Kitagawa K, Ohhata T, Shiotani B, and Kitagawa M
    • Journal Title

      Biochim Biophys Acta Mol Cell Res

      Volume: -

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      Yano K, and Shiotani B
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      Cancer Science

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      Taichi Igarashi,Takaaki Yasuhara, Kimiyoshi Yano, Lee Zou and Bunsyo Shiotani
    • Organizer
      The International Ataxia-Telangiectasia Workshop 2023
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      Igarashi T, Yasuhara T, Yano K, Zou L, and Shiotani, B
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      The International Ataxia-Telangiectasia Workshop 2023
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      2022 Annual Research Report
  • [Presentation] ATR-PrimPol経路によるKRAS誘導性DNA複製ストレス耐性機構はがん悪性化に関与する2022

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      五十嵐 太一, 矢野 公義, 塩谷 文章
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      第45回日本分子生物学会年会
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      2022 Annual Research Report
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      Shiotani B
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      第81回日本癌学会学術総会
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      2022 Annual Research Report
  • [Presentation] An ATR-PrimPol pathway confers Tolerance to oncogenic KRAS-induced Replication Stress2022

    • Author(s)
      Shiotani B
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      Gordon Research Conference-Genomic Instability, DNA Repair and Human Diseases
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    • Int'l Joint Research
  • [Remarks] 正常細胞でのがん遺伝子活性化によるゲノム異常獲得機構を解明

    • URL

      https://www.ncc.go.jp/jp/information/pr_release/2023/0907/index.html

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URL: 

Published: 2022-04-19   Modified: 2024-12-25  

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