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Boundary between non-living and living matter revealed by measuring the fluidity of "living" cell membranes

Research Project

Project/Area Number 23K25834
Project/Area Number (Other) 23H01137 (2023)
Research Category

Grant-in-Aid for Scientific Research (B)

Allocation TypeMulti-year Fund (2024)
Single-year Grants (2023)
Section一般
Review Section Basic Section 13040:Biophysics, chemical physics and soft matter physics-related
Research InstitutionTohoku University

Principal Investigator

佐久間 由香  東北大学, 理学研究科, 講師 (40630801)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 山本 一徳  北海道大学, 遺伝子病制御研究所, 特任助教 (00801937)
Project Period (FY) 2023-04-01 – 2027-03-31
Project Status Granted (Fiscal Year 2024)
Budget Amount *help
¥18,720,000 (Direct Cost: ¥14,400,000、Indirect Cost: ¥4,320,000)
Fiscal Year 2026: ¥3,770,000 (Direct Cost: ¥2,900,000、Indirect Cost: ¥870,000)
Fiscal Year 2025: ¥2,860,000 (Direct Cost: ¥2,200,000、Indirect Cost: ¥660,000)
Fiscal Year 2024: ¥5,850,000 (Direct Cost: ¥4,500,000、Indirect Cost: ¥1,350,000)
Fiscal Year 2023: ¥6,240,000 (Direct Cost: ¥4,800,000、Indirect Cost: ¥1,440,000)
Keywords膜流動性 / 膜粘度 / ベシクル / 初期胚 / 細胞膜 / 脂質膜粘度
Outline of Research at the Start

細胞膜における膜流動性は生体機能の発現を制御する重要な因子であり、これまでに脂質のみから成るモデル細胞膜を用いた研究がなされてきた。一方、生きた細胞膜は糖鎖などによる表面修飾や脂質分布の非対称性,膜内外での溶液粘度の非対称性など複雑な構造を持つ。さらに、細胞骨格から力学的揺動を受けた非平衡状態にあり、細胞の生死による流動特性の違いが予想される。本研究では、モデル細胞膜の構造を実際の細胞膜に近づけて膜粘度を測定し、複雑な膜構造が流動性に及ぼす影響を調べる。また「生きている」状態での細胞膜の流動性を評価し、非平衡状態が流動性に及ぼす影響を明らかにすることで、「生きている」膜とは何かを明らかにする。

Outline of Annual Research Achievements

細胞膜における膜流動性は、生体機能の発現を制御する重要な因子であり、これまでに脂質のみから成るモデル細胞膜を用いて盛んに研究されてきた。一方、生きた細胞膜は糖鎖などによる膜表面の修飾や脂質分布の非対称性,膜内外での溶液粘度の非対称性など複雑な構造を持つ。さらに、細胞骨格から力学的揺動を受けた非平衡状態にあり、細胞の生死によってその流動特性に大きな違いがあることが予想される。本研究では「生きている細胞膜と無生物であるモデル細胞膜の流動性は何が違うのか」を明らかにするため、モデル細胞膜に糖鎖に見立てた高分子をグラフトし、膜粘度への影響を調べた。その結果、膜にグラフトする高分子濃度が高くなると膜粘度は高分子をグラフトしない膜の8倍程度まで大きくなることがわかった。さらに、グラフトした高分子同士の相互作用が膜粘度上昇に寄与していることを理論的な観点から明らかにした. この成果は専門誌Biophysical Journalに発表した [Sakuma et al., Biophys. J. (2024]]. また、生きている細胞膜と細胞骨格の相互作用について実験的に明らかにし、細胞骨格の状態がの膜流動性に大きく影響することを明らかにした。さらに、モデル細胞膜と細胞膜のギャップをつなぐために細胞から細胞表層のみを単離したGiant Plasma Membrane Vesicle (GPMV)の作製技術を習得した。これによって、今後は細胞, GPMV, モデル細胞膜のそれぞれの膜粘度測定をすることで、その差異から生物と無生物の違いについて膜流動性の観点から明らかにする足掛かりができた。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.

Reason

当初予定していた、モデル細胞膜と生きた状態の細胞膜双方の膜粘度測定が順調に進んでいるため。さらに、本年度の成果から本研究最大の問いである「生きている細胞膜と無生物であるモデル細胞膜の流動性は何が違うのか」を明らかにするには細胞膜から単離したGiant Plasma Membrane Vesicle (GPMV)の膜粘度測定も必要だと判断した。GPMVを得る技術を習得し、膜粘度測定にも着手することができたため本研究は概ね順調に進捗していると判断した。

Strategy for Future Research Activity

細胞を用いたトップダウンの立場からは、前年度から引き続き、線虫C. elegans初期胚の細胞膜粘度測定実験を行う。細胞では、外部からの流れを当てて細胞膜の流動を生じさせるのに細胞骨格であるアクチン繊維の形成阻害をすることが必要であることが分かったため、細胞膜との関連が考えられる細胞表層のアクトミオシンネットワークの構造を、共焦点レーザー顕微鏡を用いて観察する。また、未受精卵と受精卵の比較に適したモデルである、カタユウレイボヤ卵を用いた細胞膜粘度測定実験に着手する。モデル細胞膜を用いたボトムアップの立場からは、高分子溶液などの高粘性溶液をモデル細胞膜内部に封入し、水などの粘性の低い溶液中にトランスファーすることで膜内外の溶液の非対称性を実現し、細胞内外の溶液の粘度の非対称性が膜粘度に及ぼす影響を調べる。また、細胞から単離したGiant Plasma Membrane Vesicleの膜粘度を測定し、モデル細胞膜および生きている細胞膜の膜粘度と比較することで、生きている細胞膜とモデル細胞膜を繋ぎ、それぞれの流動性の違いとその要因を明らかにする。

Report

(1 results)
  • 2023 Annual Research Report
  • Research Products

    (16 results)

All 2024 2023 Other

All Journal Article (6 results) (of which Int'l Joint Research: 3 results,  Peer Reviewed: 6 results,  Open Access: 2 results) Presentation (8 results) (of which Int'l Joint Research: 5 results,  Invited: 2 results) Remarks (2 results)

  • [Journal Article] Effects of grafted polymers on the lipid membrane fluidity2024

    • Author(s)
      Sakuma Yuka、Kayamori Nana、Tanaka Julia、Haga Kenya、Imai Masayuki、Kawakatsu Toshihiro
    • Journal Title

      Biophysical Journal

      Volume: 123 Issue: 4 Pages: 489-501

    • DOI

      10.1016/j.bpj.2024.01.014

    • Related Report
      2023 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Translocation of a daughter vesicle in a model system of self-reproducing vesicles2024

    • Author(s)
      Klawtanong Manit、Sakuma Yuka、Imai Masayuki、Kawakatsu Toshihiro、Khunpetch Petch
    • Journal Title

      Physics of Fluids

      Volume: 36 Issue: 2 Pages: 0271121-9

    • DOI

      10.1063/5.0186977

    • Related Report
      2023 Annual Research Report
    • Peer Reviewed / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Switching from weak to strong cortical attachment of microtubules accounts for the transition from nuclear centration to spindle elongation in metazoans2024

    • Author(s)
      Tada Shohei、Yamazaki Yoshitaka、Yamamoto Kazunori、Fujii Ken、Yamada Takahiro G.、Hiroi Noriko F.、Kimura Akatsuki、Funahashi Akira
    • Journal Title

      Heliyon

      Volume: 10 Issue: 3 Pages: e25494-e25494

    • DOI

      10.1016/j.heliyon.2024.e25494

    • Related Report
      2023 Annual Research Report
    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Morphology of vesicle triplets: shape transformation at weak and strong adhesion limits2023

    • Author(s)
      Chiba Toshikaze、Sakuma Yuka、Imai Masayuki、Ziherl Primoz
    • Journal Title

      Soft Matter

      Volume: 19 Issue: 23 Pages: 4286-4296

    • DOI

      10.1039/d3sm00308f

    • Related Report
      2023 Annual Research Report
    • Peer Reviewed / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Synthesising a minimal cell with artificial metabolic pathways2023

    • Author(s)
      Kurisu Minoru、Katayama Ryosuke、Sakuma Yuka、Kawakatsu Toshihiro、Walde Peter、Imai Masayuki
    • Journal Title

      Communications Chemistry

      Volume: 6 Issue: 1 Pages: 56-56

    • DOI

      10.1038/s42004-023-00856-y

    • Related Report
      2023 Annual Research Report
    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Cell polarity: Adapting the PAR cascade to diverse cellular contexts.2023

    • Author(s)
      Yamamoto K, Motegi F.
    • Journal Title

      Current Biology

      Volume: 33 Issue: 20 Pages: R1047-R1049

    • DOI

      10.1016/j.cub.2023.08.083

    • Related Report
      2023 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Presentation] Effect of polymer chains grafted to the lipid GUV on the membrane fluidity2023

    • Author(s)
      Yuka Sakuma
    • Organizer
      Advanced core-to-core network for the physics of self-organizing active matter kick off meeting
    • Related Report
      2023 Annual Research Report
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] Membrane viscosity of polymer-grafted GUVs: Toward understanding the cell membrane fluidity2023

    • Author(s)
      Yuka Sakuma
    • Organizer
      9th International Discussion Meeting on Relaxations in Complex Systems
    • Related Report
      2023 Annual Research Report
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] Effect of polymer chains grafted to the lipid GUV on the membrane fluidity2023

    • Author(s)
      Yuka Sakuma
    • Organizer
      The 7th International Soft Matter Conference
    • Related Report
      2023 Annual Research Report
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Effect of grafted polymer chains on the membrane fluidity2023

    • Author(s)
      Yuka Sakuma
    • Organizer
      Statphys28
    • Related Report
      2023 Annual Research Report
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Membrane visocsity of ternary vesicles in a wide composition-temperature space2023

    • Author(s)
      Juria Tanaka, Kenya Haga, Masayuki Imai, and Yuka Sakuma
    • Organizer
      The 7th International Soft Matter Conference
    • Related Report
      2023 Annual Research Report
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Effect of polymer chains grafted on the phase-separated ternary GUVs on the membrane fluidity2023

    • Author(s)
      佐久間由香
    • Organizer
      日本生物物理学会第61回年会
    • Related Report
      2023 Annual Research Report
  • [Presentation] Viscosity landscape of phase-separated ternary vesicles in composition-temperature space2023

    • Author(s)
      田中珠梨亜, 芳賀健也, 今井正幸, 佐久間由香
    • Organizer
      日本生物物理学会第61回年会
    • Related Report
      2023 Annual Research Report
  • [Presentation] Combination of force measurement and inference decipher non-linear involvement of E-cad shaping early C. elegans embryos2023

    • Author(s)
      Kazunori Yamamoto, Charras Guillaume
    • Organizer
      日本生物物理学会第61回年会
    • Related Report
      2023 Annual Research Report
  • [Remarks] Researchmap

    • URL

      https://researchmap.jp/7000002153

    • Related Report
      2023 Annual Research Report
  • [Remarks] 東北大学 ソフトマター・生物物理研究室

    • URL

      https://www.bio.phys.tohoku.ac.jp/

    • Related Report
      2023 Annual Research Report

URL: 

Published: 2023-04-18   Modified: 2024-12-25  

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