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Three-dimensional cell secretion measurement using probe-type artificial cell membrane systems

Research Project

Project/Area Number 23K26515
Project/Area Number (Other) 23H01822 (2023)
Research Category

Grant-in-Aid for Scientific Research (B)

Allocation TypeMulti-year Fund (2024)
Single-year Grants (2023)
Section一般
Review Section Basic Section 28050:Nano/micro-systems-related
Research InstitutionNagaoka University of Technology

Principal Investigator

庄司 観  長岡技術科学大学, 工学研究科, 准教授 (80788258)

Project Period (FY) 2023-04-01 – 2027-03-31
Project Status Granted (Fiscal Year 2024)
Budget Amount *help
¥18,850,000 (Direct Cost: ¥14,500,000、Indirect Cost: ¥4,350,000)
Fiscal Year 2026: ¥2,860,000 (Direct Cost: ¥2,200,000、Indirect Cost: ¥660,000)
Fiscal Year 2025: ¥3,250,000 (Direct Cost: ¥2,500,000、Indirect Cost: ¥750,000)
Fiscal Year 2024: ¥4,810,000 (Direct Cost: ¥3,700,000、Indirect Cost: ¥1,110,000)
Fiscal Year 2023: ¥7,930,000 (Direct Cost: ¥6,100,000、Indirect Cost: ¥1,830,000)
Keywords人工細胞膜 / ナノポア / 走査型プローブ顕微鏡 / DNAナノ構造体 / 細胞分泌 / 走査型イオンコンダクタンス顕微鏡 / ナノポアセンシング / ナノピペット
Outline of Research at the Start

細胞分泌物質は、細胞間情報伝達機能を有し、細胞のふるまいを決める重要な要素である。そのため、細胞分泌物質のリアルタイム計測技術は、細胞生物学、創薬化学の分野におけるゲームチェンジングテクノロジーとなり得る。しかしながら、従来手法では、蛍光標識の必要性や時間経過による感度低下などの課題が存在した。そこで本研究では、非標識・高空間分解能・高感度な細胞分泌物質計測システムの構築を目指し、プローブ型人工細胞膜システムを用いた“走査型プローブ顕微鏡”を開発する。

Outline of Annual Research Achievements

本研究では、細胞分泌物質の三次元マッピングを目指し、人工細胞膜を用いたナノポアセンサとガラスナノピペットを用いた走査型イオンコンダクタンス顕微鏡を組み合わせた走査型プローブ顕微鏡の開発を目指している。本走査型プローブ顕微鏡は、2本のガラスピペットが束になったダブルバレルピペットを用いて、片側のバレルのみに人工細胞膜を形成したダブルバレル型ナノポアプローブを使用する。本年度は、上記ダブルバレル型ナノポアプローブの開発およびナノポアプローブ位置制御システムの構築を実施した。
1. ダブルバレル型ナノポアプローブの開発:ダブルバレルプローブの両側のバレルにアガロースゲルを充填し、脂質溶液と水溶液が層となった浴溶液にプローブを挿入することで両方のバレルに人工細胞膜を形成した。その後、片側のバレルのみにパルス電圧を印加することで人工細胞膜を破壊し、ダブルバレル型ナノポアプローブを構築した。また、ナノポアプローブを用いてアプローチカーブの取得実験およびポア形成膜タンパク質を再構築した人工細胞膜による分子検出実験を実施し、ダブルバレル型ナノポアプローブの性能評価を実施した。その結果、シングルバレルのピペットを使用した実験と同様のアプローチカーブおよび分子検出性能を確認することができ、ダブルバレル型ナノポアプローブを用いた走査型プローブ顕微鏡開発の可能性が示された。
2. ナノポアプローブ位置制御システムの構築:本走査型プローブ顕微鏡では、人工細胞膜へのポア形成膜タンパク質再構築や人工細胞膜の割れを自動的に検出しプローブ位置を制御する必要がある。そこで、ピペットを流れるイオン電流値から上記状態を認識しプローブのz位置を制御するプログラムをLabViewで構築した。その結果、膜割れやポア数の増加を認識人工細胞膜を自動的に再形成することに成功した。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.

Reason

本年度は、ダブルバレルピペットの片側にのみ人工細胞膜を形成したダブルバレル型ナノポアプローブの開発に成功し、アプローチカーブ取得実験および分子検出実験を通して本プローブの性能評価を実施した。さらに、人工細胞膜の割れやポア形成膜タンパク質の再構築数を検出してプローブのz位置を制御するプローブ位置制御プログラムの構築に成功している。以上の結果は、本研究の目標である人工細胞膜を用いたナノポアセンサとガラスナノピペットを用いた走査型イオンコンダクタンス顕微鏡を組み合わせた走査型プローブ顕微鏡の開発の可能性を示唆する結果であり、当初の予定通りの成果を挙げている。

Strategy for Future Research Activity

本年度は、ダブルバレル型ナノポアプローブの開発に成功したので、来年度は本プローブを用いた走査型プローブ顕微鏡の構築を試みる。標準試料の表面形状測定とマイクロ流体デバイスにより構築した分子濃度勾配の計測を実施し、本走査型プローブ顕微鏡による化学物質の3次元イメージングのデモンストレーションを実施する。さらに、選択的な分子検出の実現を目指し、アプタマーとDNAナノポア構造体を組み合わせた分子応答型DNAナノポアの開発を試みる。本ナノポアの分子応答性評価およびダブルバレルピペットを用いたDNAナノポアのイオン電流計測実験を通して、走査型プローブ顕微鏡への応用可能性を検証する。

Report

(1 results)
  • 2023 Annual Research Report
  • Research Products

    (16 results)

All 2024 2023 Other

All Journal Article (4 results) (of which Peer Reviewed: 4 results,  Open Access: 3 results) Presentation (11 results) (of which Int'l Joint Research: 6 results,  Invited: 3 results) Remarks (1 results)

  • [Journal Article] Highly Efficient Membrane Insertion of Synthetic DNA Nanochannels2024

    • Author(s)
      AKAI Hiromu、KOIWA Hiroki、IZAWA Yukihiro、SHOJI Kan
    • Journal Title

      Seibutsu Butsuri

      Volume: 64 Issue: 1 Pages: 28-31

    • DOI

      10.2142/biophys.64.28

    • ISSN
      0582-4052, 1347-4219
    • Related Report
      2023 Annual Research Report
    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] The potential of nanopore technologies toward empowering biophysical research: Brief history, basic principle and applications2024

    • Author(s)
      Yamazaki Hirohito、Peng Zugui、Kawano Ryuji、Shoji Kan
    • Journal Title

      Biophysics and Physicobiology

      Volume: 21 Issue: 1 Pages: n/a

    • DOI

      10.2142/biophysico.bppb-v21.0003

    • ISSN
      2189-4779
    • Related Report
      2023 Annual Research Report
    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Control of Osmotic-Engine-Driven Liposomes Using Biological Nanopores2023

    • Author(s)
      Shibuya Hinata、Okada Shun、Shoji Kan
    • Journal Title

      Journal of Robotics and Mechatronics

      Volume: 35 Issue: 5 Pages: 1213-1218

    • DOI

      10.20965/jrm.2023.p1213

    • ISSN
      0915-3942, 1883-8049
    • Year and Date
      2023-10-20
    • Related Report
      2023 Annual Research Report
    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] DNA Nanopore-Tethered Gold Needle Electrodes for Channel Current Recording2023

    • Author(s)
      Ikarashi Shogo、Akai Hiromu、Koiwa Hiroki、Izawa Yukihiro、Takahashi Jun、Mabuchi Takuya、Shoji Kan
    • Journal Title

      ACS Nano

      Volume: 17 Issue: 11 Pages: 10598-10607

    • DOI

      10.1021/acsnano.3c01565

    • Related Report
      2023 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Presentation] DNA構造体を用いたナノポアセンサの開発2024

    • Author(s)
      庄司観
    • Organizer
      2023年度 次世代半導体・センサ科学研究所シンポジウム
    • Related Report
      2023 Annual Research Report
    • Invited
  • [Presentation] Nanopore Sensors Using Probe-Type Lipid Bilayer2023

    • Author(s)
      Kan Shoji
    • Organizer
      36th International Microprocesses and Nanotechnology Conference
    • Related Report
      2023 Annual Research Report
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] Biosensors Using Artificial Cell Membranes2023

    • Author(s)
      Kan Shoji
    • Organizer
      8th STI-Gigaku
    • Related Report
      2023 Annual Research Report
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] Aptamer-Modified DNA Nanopore Sensor for Biomolecular Measurements2023

    • Author(s)
      Hiromu Akai, Kan Shoji
    • Organizer
      34th 2023 International Symposium on Micro-NanoMechatronics and Human Science
    • Related Report
      2023 Annual Research Report
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Automated Lipid Bilayer Formation by Capacitance Feedback Control2023

    • Author(s)
      Hiroto Ishizuka, Kan Shoji
    • Organizer
      34th 2023 International Symposium on Micro-NanoMechatronics and Human Science
    • Related Report
      2023 Annual Research Report
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] TARGETED INSERTION OF DNA NANOPORE INTO GIANT LIPOSOMES2023

    • Author(s)
      Hiroki Koiwa, Shinichiro M. Nomura, Satoshi Murata, Kan Shoji,
    • Organizer
      The 27th International Conference on Miniaturized Systems for Chemistry and Life Sciences
    • Related Report
      2023 Annual Research Report
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] DEVELOPMENT OF ELECTROCHEMICAL DNA SENSOR WITH NANOPORE-BASED DNA EXTRACTION FUNCTION2023

    • Author(s)
      Haruki Tanabe, Kan Shoji
    • Organizer
      The 27th International Conference on Miniaturized Systems for Chemistry and Life Sciences
    • Related Report
      2023 Annual Research Report
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Scanning Ion Conductance Microscopy Using Biological Nanopore Probes2023

    • Author(s)
      Kan Shoji
    • Organizer
      第61回生物物理学会年会
    • Related Report
      2023 Annual Research Report
  • [Presentation] DNAナノポアを用いた細胞分泌計測を目指して2023

    • Author(s)
      赤井大夢,平野太一,馬渕拓哉,庄司観
    • Organizer
      第9回サイボウニクス研究会
    • Related Report
      2023 Annual Research Report
  • [Presentation] 分子応答型DNAナノポアの電圧依存性に関する検証2023

    • Author(s)
      赤井大夢,庄司観
    • Organizer
      Cheminas48
    • Related Report
      2023 Annual Research Report
  • [Presentation] 自動膜形成システムを用いたハイスループットナノポアセンシング2023

    • Author(s)
      石塚洋渡,庄司観
    • Organizer
      Cheminas48
    • Related Report
      2023 Annual Research Report
  • [Remarks] DNAナノポアの高効率膜挿入手法の開発

    • URL

      https://www.nagaokaut.ac.jp/shincyaku/202305/30.html

    • Related Report
      2023 Annual Research Report

URL: 

Published: 2023-04-18   Modified: 2024-12-25  

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