DNA sequencing with methylation based on a single nucleotide measurement using surface-enhanced Raman spectroscopy

• Project/Area Number: 23K26516
• Project/Area Number (Other): 23H01823 (2023)
• Research Category: Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
• Allocation Type: Multi-year Fund (2024); Single-year Grants (2023)
• Section: 一般
• Review Section: Basic Section 28050:Nano/micro-systems-related
• Research Institution: Kobe University
• Principal Investigator: 菅野 公二 神戸大学, 工学研究科, 教授 (20372568)
• Project Period (FY): 2023-04-01 – 2026-03-31
• Project Status: Granted (Fiscal Year 2024)
• Budget Amount: ¥18,720,000 (Direct Cost: ¥14,400,000、Indirect Cost: ¥4,320,000); Fiscal Year 2025: ¥5,850,000 (Direct Cost: ¥4,500,000、Indirect Cost: ¥1,350,000); Fiscal Year 2024: ¥5,980,000 (Direct Cost: ¥4,600,000、Indirect Cost: ¥1,380,000); Fiscal Year 2023: ¥6,890,000 (Direct Cost: ¥5,300,000、Indirect Cost: ¥1,590,000)
• Keywords: 表面増強ラマン分光 / DNAメチル化 / 1分子計測 / DNAシーケンシング / 金ナノ粒子

Outline of Research at the Start

DNA塩基のメチル化によりがん抑制物質の生成が阻害されることが知られており，その検出によりがんのリスク把握が可能となる。本研究では，高い分子識別能力を有する表面増強ラマン分光（SERS：surface-enhanced Raman spectroscopy）を用いたメチル化解析が可能なDNAシーケンシング技術の基盤技術構築と実現可能性検証を行う。非標識かつ直接的なDNAシーケンシング，さらにメチル化など塩基の異常修飾による遺伝子発現を解析するための基盤技術を構築する。本研究課題により，DNA塩基のメチル化検出によるがん予防医療など，新しい医療技術創出に寄与する。