検出誤差に対して頑健な環境DNAメタバーコーディングの進展

• Project/Area Number: 23K26933
• Project/Area Number (Other): 23H02240 (2023)
• Research Category: Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
• Allocation Type: Multi-year Fund (2024); Single-year Grants (2023)
• Section: 一般
• Review Section: Basic Section 39060:Conservation of biological resources-related; Basic Section 39070:Landscape science-related; Sections That Are Subject to Joint Review: Basic Section39060:Conservation of biological resources-related , Basic Section39070:Landscape science-related
• Research Institution: National Institute for Environmental Studies
• Principal Investigator: 深谷 肇一 国立研究開発法人国立環境研究所, 生物多様性領域, 主任研究員 (30708798)
• Co-Investigator(Kenkyū-buntansha): 鈴木 健大 国立研究開発法人理化学研究所, バイオリソース研究センター, 開発研究員 (00748999) ; 今藤 夏子 国立研究開発法人国立環境研究所, 生物多様性領域, 室長 (10414369) ; 角谷 拓 国立研究開発法人国立環境研究所, 生物多様性領域, 室長 (40451843) ; 松崎 慎一郎 国立研究開発法人国立環境研究所, 生物多様性領域, 室長 (40548773) ; 辻 冴月 京都大学, 情報学研究科, 助教 (80867656)
• Project Period (FY): 2023-04-01 – 2027-03-31
• Project Status: Granted (Fiscal Year 2024)
• Budget Amount: ¥18,590,000 (Direct Cost: ¥14,300,000、Indirect Cost: ¥4,290,000); Fiscal Year 2026: ¥4,550,000 (Direct Cost: ¥3,500,000、Indirect Cost: ¥1,050,000); Fiscal Year 2025: ¥4,550,000 (Direct Cost: ¥3,500,000、Indirect Cost: ¥1,050,000); Fiscal Year 2024: ¥4,550,000 (Direct Cost: ¥3,500,000、Indirect Cost: ¥1,050,000); Fiscal Year 2023: ¥4,940,000 (Direct Cost: ¥3,800,000、Indirect Cost: ¥1,140,000)
• Keywords: 環境DNAメタバーコーディング / サイト占有モデル / 群集動態 / 遺伝的多様性

Outline of Research at the Start

環境DNAメタバーコーディングの実践では手法に固有の検出誤差に対処することが求められる。この問題に対して近年、偽陰性誤差を補正する新たな統計モデルとそれに基づくデータ解析法が提案された。本研究では、方法論と応用の2つの側面からこの解析手法を発展させる。具体的には、時系列データと偽陽性誤差のモデル化に取り組むことで既存の方法を高度化し、群集安定性解析と遺伝的多様性評価の問題に応用する。提案手法をRパッケージとして実装・公開することで検出誤差に対して頑健な環境DNAメタバーコーディング手法の普及に貢献する。