The role of liquid-liquid phase separation in the mechanism of small RNA amplification

• Project/Area Number: 23K27105
• Project/Area Number (Other): 23H02412 (2023)
• Research Category: Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
• Allocation Type: Multi-year Fund (2024); Single-year Grants (2023)
• Section: 一般
• Review Section: Basic Section 43010:Molecular biology-related
• Research Institution: Rikkyo University
• Principal Investigator: 岩川 弘宙 立教大学, 理学部, 准教授 (60710415)
• Co-Investigator(Kenkyū-buntansha): 吉川 学 国立研究開発法人農業・食品産業技術総合研究機構, 生物機能利用研究部門, 上級研究員 (80391564)
• Project Period (FY): 2023-04-01 – 2026-03-31
• Project Status: Granted (Fiscal Year 2024)
• Budget Amount: ¥18,850,000 (Direct Cost: ¥14,500,000、Indirect Cost: ¥4,350,000); Fiscal Year 2025: ¥5,460,000 (Direct Cost: ¥4,200,000、Indirect Cost: ¥1,260,000); Fiscal Year 2024: ¥6,370,000 (Direct Cost: ¥4,900,000、Indirect Cost: ¥1,470,000); Fiscal Year 2023: ¥7,020,000 (Direct Cost: ¥5,400,000、Indirect Cost: ¥1,620,000)
• Keywords: RNAサイレンシング / siRNA / 相分離 / miRNA / 液-液相分離

Outline of Research at the Start

植物には小分子RNAの標的RNAから、大量の二次的なsiRNAを生み出す小分子RNA増幅機構が存在する。この機構は植物の発生制御やウイルス免疫など、様々な生物学的プロセスで重要な役割を果たす。二次的siRNAは、SGS3と呼ばれるRNA結合タンパク質が相分離することで作り出す「siRNAボディ」で生み出される。しかしながらこの反応場がどのような役割を果たすのかは不明である。本研究では、siRNAボディの役割を遺伝学と生物情報科学、そして独自の生化学を組み合わせたアプローチで解き明かす。