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Structural basis for molecular assembly of photosynthetic light-harversting complexes

Research Project

Project/Area Number 23K27116
Project/Area Number (Other) 23H02423 (2023)
Research Category

Grant-in-Aid for Scientific Research (B)

Allocation TypeMulti-year Fund (2024)
Single-year Grants (2023)
Section一般
Review Section Basic Section 43020:Structural biochemistry-related
Research InstitutionShizuoka University

Principal Investigator

長尾 遼  静岡大学, 農学部, 准教授 (30633961)

Project Period (FY) 2023-04-01 – 2027-03-31
Project Status Granted (Fiscal Year 2024)
Budget Amount *help
¥19,110,000 (Direct Cost: ¥14,700,000、Indirect Cost: ¥4,410,000)
Fiscal Year 2026: ¥2,210,000 (Direct Cost: ¥1,700,000、Indirect Cost: ¥510,000)
Fiscal Year 2025: ¥2,730,000 (Direct Cost: ¥2,100,000、Indirect Cost: ¥630,000)
Fiscal Year 2024: ¥3,250,000 (Direct Cost: ¥2,500,000、Indirect Cost: ¥750,000)
Fiscal Year 2023: ¥10,920,000 (Direct Cost: ¥8,400,000、Indirect Cost: ¥2,520,000)
Keywords光合成 / 集光性色素タンパク質 / 光化学系I / 分子集合 / 光捕集 / 分子集合機構
Outline of Research at the Start

本研究は、光合成の光捕集機構に関与する集光性色素タンパク質(LHC)の分子集合機構の解明を目的とする。LHCの遺伝子数が少ないモデル生物を使用し、野生株やLHC欠損株からPSI-LHCを精製し、機能構造研究を実施する。遺伝子欠損させたLHCの代わりに他のLHCが結合するのか、もしくは何も結合しないのか、LHCの結合制御に関する分子基盤を得る。

Outline of Annual Research Achievements

本研究は、光合成の光捕集機構に関与する集光性色素タンパク質(LHC)の分子集合機構の解明を目的とする。LHCの遺伝子数が少ないモデル生物を使用し、野生株やLHC欠損株からPSI-LHCを精製し、機能構造研究を実施する。遺伝子欠損させたLHCの代わりに他のLHCが結合するのか、もしくは何も結合しないのか、LHCの結合制御に関する分子基盤を得る。
既に報告した論文(Nagao et al., 2023 Nature Communications)では、6個のLHCサブユニットのうち、3個が未同定のまま残っている。当該年度では、6個すべてのLHCサブユニットを同定するために、野生株からのPSI-LHC超複合体のクライオ電子顕微鏡による撮影を行った。精製条件やグリッド作成条件を検討したが、未同定サブユニットの同定には至らなかった。
当該年度では、4つのLHC遺伝子(isiA1, isiA2, isiA3, isiA5)のうち、isiA1とisiA2それぞれの遺伝子欠損株を分析した。isiA2において、mRNAレベルではisiA2の発現が確認されず、他の3つの遺伝子の発現は検出された。この株からPSI-LHCを精製し、クライオ電子顕微鏡による構造解析を実施したが、IsiAタンパク質は一切見られなかった。生化学分析からもIsiAタンパク質が確認できなかったため、isiA2遺伝子の欠損ではIsiAタンパク質の翻訳や分子集合に影響を与えているのかもしれない。
isiA1遺伝子の欠損株を分析した。この株からPSI-LHCを精製したところ、IsiA2, IsiA3が検出された。isiA5はisiA1とオペロンを形成しているため、isiA1欠損の影響を受けて発現が低下した。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.

Reason

isiA1, isiA2それぞれの遺伝子欠損株の分析まで進めた。予想と反し、isiA2欠損株からはPSI-LHCが精製されないと結論づけられた。一方、isiA1欠損株からはPSI-LHCが精製できたため、次年度以降にクライオ電子顕微鏡による構造解析の準備ができた。isiA5欠損株についても予備的な分析を進めているため、全体としては順調だと判断する。

Strategy for Future Research Activity

野生株からのPSI-LHC超複合体のクライオ電子顕微鏡による撮影および構造解析を実施する。2023年度にグリッド作成条件を検討したため、これを2024年度に試す。
isiA1遺伝子欠損株から精製したPSI-LHCの生化学分析およびクライオ電子顕微鏡撮影用のグリッド作成条件を検討する。
isiA5遺伝子の欠損株を分析する。細胞レベルでの光合成分析、特に蛍光分光測定を実施し、isiA由来の特徴的な蛍光ピークを確認する。さらに、この変異体からPSI-LHCの精製条件を確立する。

Report

(1 results)
  • 2023 Annual Research Report
  • Research Products

    (5 results)

All 2024 2023 Other

All Journal Article (1 results) (of which Peer Reviewed: 1 results,  Open Access: 1 results) Presentation (3 results) (of which Invited: 2 results) Remarks (1 results)

  • [Journal Article] The structure of PSI-LHCI from <i>Cyanidium caldarium</i> provides evolutionary insights into conservation and diversity of red-lineage LHCs2024

    • Author(s)
      Kato Koji、Hamaguchi Tasuku、Kumazawa Minoru、Nakajima Yoshiki、Ifuku Kentaro、Hirooka Shunsuke、Hirose Yuu、Miyagishima Shin-ya、Suzuki Takehiro、Kawakami Keisuke、Dohmae Naoshi、Yonekura Koji、Shen Jian-Ren、Nagao Ryo
    • Journal Title

      Proceedings of the National Academy of Sciences

      Volume: 121 Issue: 11 Pages: 1-9

    • DOI

      10.1073/pnas.2319658121

    • Related Report
      2023 Annual Research Report
    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Presentation] アナベナの isiA1 遺伝子欠損株の特性解析2024

    • Author(s)
      長尾遼、小川晴也、沈建仁、得平茂樹
    • Organizer
      第65回日本植物生理学会
    • Related Report
      2023 Annual Research Report
  • [Presentation] シアノバクテリアの光化学系タンパク質の多様な分子構造2023

    • Author(s)
      長尾遼
    • Organizer
      ラン藻ゲノム交流会2023
    • Related Report
      2023 Annual Research Report
    • Invited
  • [Presentation] 藻類の光化学系複合体の多様な分子構造2023

    • Author(s)
      長尾遼
    • Organizer
      第23回日本光生物学協会年会
    • Related Report
      2023 Annual Research Report
    • Invited
  • [Remarks] 研究室ホームページ

    • URL

      https://nagaolab.wixsite.com/website

    • Related Report
      2023 Annual Research Report

URL: 

Published: 2023-04-18   Modified: 2024-12-25  

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