| Project/Area Number |
23K27156
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| Project/Area Number (Other) |
23H02463 (2023)
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| Research Category |
Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
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| Allocation Type | Multi-year Fund (2024)
Single-year Grants (2023) |
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| Section | 一般 |
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| Review Section |
Basic Section 43050:Genome biology-related
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| Research Institution | Japanese Foundation for Cancer Research |
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Principal Investigator |
大学 保一 公益財団法人がん研究会, がん研究所 がんゲノム動態プロジェクト, プロジェクトリーダー (80619875)
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| Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) |
野島 孝之 九州大学, 生体防御医学研究所, 准教授 (80431956)
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| Project Period (FY) |
2023-04-01 – 2026-03-31
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| Project Status |
Granted (Fiscal Year 2024)
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| Budget Amount *help |
¥18,720,000 (Direct Cost: ¥14,400,000、Indirect Cost: ¥4,320,000)
Fiscal Year 2025: ¥5,850,000 (Direct Cost: ¥4,500,000、Indirect Cost: ¥1,350,000)
Fiscal Year 2024: ¥5,980,000 (Direct Cost: ¥4,600,000、Indirect Cost: ¥1,380,000)
Fiscal Year 2023: ¥6,890,000 (Direct Cost: ¥5,300,000、Indirect Cost: ¥1,590,000)
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| Keywords | DNA複製 / DNAポリメラーゼ / 転写 / RNAポリメラーゼ / 転写/複製コンフリクト |
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| Outline of Research at the Start |
真核生物では、複製開始点が染色体上に多数存在し、周辺の遺伝子上では複製フォークと転写装置間の衝突・干渉（複製・転写コンフリクト）を完全に回避する事はできない。複製フォークとRNAポリメラーゼの相互干渉は、ゲノム不安定性の要素の１つとして着目されてきたが、現在までの知見からは、複製・転写コンフリクトが起きやすい領域がゲノム上にどのように分布するかは明らかになっておらず、該当領域を探索する解析方法も確立されていない。本研究では、その領域で複製・転写コンフリクトの生成・解消に関わる因子の解析を進めつつ、染色体不安定を誘引する複製・転写コンフリクトの特徴を明らかにする。
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| Outline of Annual Research Achievements |
本年度は、転写機構の変化に応じて、DNA複製機構が変化するかを検証するための実験系の構築を集中的に実施した。分担者（野島孝之准教授・九州大学）の研究によって、RNAポリメラーゼの制御因子であるNELF複合体の喪失は、転写への影響のみならず、細胞周期の進行にも強く影響を及ぼすことが示されている。このことから、 NELF複合体の機能喪失による転写制御不全は、転写によるＤＮＡ複製への干渉を増大させ、結果として、細胞周期の停止を引き起こすとの仮説を設定し、それを検証している。 NELF複合体の状態に応じて、複製フォークの開始・進行、DNAポリメラーゼの機能が、どのように変化するかを検証するために、NELFCD因子の迅速分解を誘導するシステムをPu-seq実験に使用する細胞株において作成した。現在までにPu-seq実験のデータをえる段階までに至ったはいないが、短期期間内に、この実験を完了できる見込みが立ったところである。
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| Current Status of Research Progress |
Current Status of Research Progress
2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.
Reason
研究者代表、分担者それぞれが現在、複製機構、転写機構のプロファイルを着実に進めている状況であり、今後、それらを統合した結果が予定通り得られると考えられる。
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| Strategy for Future Research Activity |
当初の計画通り進める予定であるが、DNA複製、転写機構のゲノムプロファイルを統合する情報科学的解析は今後、重点的に進める必要があると考える。
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