Development of an ultra-deep proteome analysis system

• Project/Area Number: 23K27158
• Project/Area Number (Other): 23H02465 (2023)
• Research Category: Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
• Allocation Type: Multi-year Fund (2024); Single-year Grants (2023)
• Section: 一般
• Review Section: Basic Section 43050:Genome biology-related
• Research Institution: Kazusa DNA Research Institute
• Principal Investigator: 川島 祐介 公益財団法人かずさDNA研究所, ゲノム事業推進部, グループ長 (30588124)
• Co-Investigator(Kenkyū-buntansha): 紺野 亮 公益財団法人かずさDNA研究所, ゲノム事業推進部, 特任研究員 (00935736) ; 石川 将己 公益財団法人かずさDNA研究所, ゲノム事業推進部, 特任研究員 (10758684) ; 中島 大輔 公益財団法人かずさDNA研究所, ゲノム事業推進部, 研究員 (30370935)
• Project Period (FY): 2023-04-01 – 2026-03-31
• Project Status: Granted (Fiscal Year 2024)
• Budget Amount: ¥19,370,000 (Direct Cost: ¥14,900,000、Indirect Cost: ¥4,470,000); Fiscal Year 2025: ¥1,300,000 (Direct Cost: ¥1,000,000、Indirect Cost: ¥300,000); Fiscal Year 2024: ¥4,160,000 (Direct Cost: ¥3,200,000、Indirect Cost: ¥960,000); Fiscal Year 2023: ¥13,910,000 (Direct Cost: ¥10,700,000、Indirect Cost: ¥3,210,000)
• Keywords: プロテオミクス / LC-MS

Outline of Research at the Start

プロテオーム解析は分析技術の向上によって1回のLC-MS/MS測定(シングルショット)で1種類の哺乳類細胞から10,000を超えるタンパク質が解析可能となっている。しかしながら、ここまで分析深度が拡大しても細胞中のタンパク質の全貌を明らかにすることはできていない。未だに検出できてない超低発現タンパク質には様々な生命現象のマスターレギュレーターとなる転写因子が豊富に含まれており、見過ごすことができない。そこで、本研究では簡便に細胞中の発現タンパク質の全貌を明らかにするシングルショットプロテオーム解析システムを開発し、真に網羅的なプロテオーム解析（真プロテオーム解析）を実現することを目指す。