Long-read multi-epigenome analysis

• Project/Area Number: 23K27162
• Project/Area Number (Other): 23H02469 (2023)
• Research Category: Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
• Allocation Type: Multi-year Fund (2024); Single-year Grants (2023)
• Section: 一般
• Review Section: Basic Section 43060:System genome science-related
• Research Institution: The University of Tokyo (2024); Kyushu University (2023)
• Principal Investigator: 三浦 史仁 東京大学, 大学院新領域創成科学研究科, 特任教授 (50447348)
• Project Period (FY): 2023-04-01 – 2026-03-31
• Project Status: Granted (Fiscal Year 2024)
• Budget Amount: ¥18,980,000 (Direct Cost: ¥14,600,000、Indirect Cost: ¥4,380,000); Fiscal Year 2025: ¥4,550,000 (Direct Cost: ¥3,500,000、Indirect Cost: ¥1,050,000); Fiscal Year 2024: ¥5,460,000 (Direct Cost: ¥4,200,000、Indirect Cost: ¥1,260,000); Fiscal Year 2023: ¥8,970,000 (Direct Cost: ¥6,900,000、Indirect Cost: ¥2,070,000)
• Keywords: エピゲノム / DNAメチル化 / ライブラリー調製 / 次世代シークエンサー / ロングリードシークエンサー

Outline of Research at the Start

本研究では、ロングリードで多重エピゲノム解析を実現するためにメチル化フットプリンティングによるエピゲノム情報のDNA上への記録技術を中心とした開発を行う。具体的には、①メチル基転移酵素（MTase）の拡充、②抗体様分子の生産法法の確立、③ロングリードでDNAメチル化を高感度に検出する技術の開発、④ホルマリン固定組織に対するMTase反応の最適化とDNA回収技術の確立、を行う。