Establishment and application of methods for dynamic structural selection of biomolecules

• Project/Area Number: 23K27291
• Project/Area Number (Other): 23H02600 (2023)
• Research Category: Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
• Allocation Type: Multi-year Fund (2024); Single-year Grants (2023)
• Section: 一般
• Review Section: Basic Section 47010:Pharmaceutical chemistry and drug development sciences-related; Basic Section 47050:Environmental and natural pharmaceutical resources-related; Sections That Are Subject to Joint Review: Basic Section47010:Pharmaceutical chemistry and drug development sciences-related , Basic Section47050:Environmental and natural pharmaceutical resources-related
• Research Institution: The University of Tokyo
• Principal Investigator: 大和田 智彦 東京大学, 大学院薬学系研究科(薬学部), 教授 (20177025)
• Co-Investigator(Kenkyū-buntansha): 槙田 紀子 東京大学, 医学部附属病院, 准教授 (60353455) ; 尾谷 優子 東京大学, 大学院薬学系研究科(薬学部), 准教授 (60451853)
• Project Period (FY): 2023-04-01 – 2028-03-31
• Project Status: Granted (Fiscal Year 2024)
• Budget Amount: ¥18,850,000 (Direct Cost: ¥14,500,000、Indirect Cost: ¥4,350,000); Fiscal Year 2027: ¥910,000 (Direct Cost: ¥700,000、Indirect Cost: ¥210,000); Fiscal Year 2026: ¥910,000 (Direct Cost: ¥700,000、Indirect Cost: ¥210,000); Fiscal Year 2025: ¥2,210,000 (Direct Cost: ¥1,700,000、Indirect Cost: ¥510,000); Fiscal Year 2024: ¥6,500,000 (Direct Cost: ¥5,000,000、Indirect Cost: ¥1,500,000); Fiscal Year 2023: ¥8,320,000 (Direct Cost: ¥6,400,000、Indirect Cost: ¥1,920,000)
• Keywords: 動的構造固定 / 分子動力学 / 動的構造選択 / 脂質酸 / コンホメーション / メデシナルケミストリー

Outline of Research at the Start

生体分子は回転可能な化学結合を多数もち、様々な構造（コンホメーション）をとり得るが、その中から標的タンパク質に依存して特異的に選 択された構造が生物活性構造であるという仮説を提案する。多数のコンホメーションを取るフレキシブルな生体分子を動的構造ライブラリーと 見なし、その中の特定のコンホメーションを構造固定化した分子を構築するための革新的構造化手法を確立する。