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The novel roles of nuclear bodies formed by nucleoporin fusion proteins

Research Project

Project/Area Number 23K27373
Project/Area Number (Other) 23H02682 (2023)
Research Category

Grant-in-Aid for Scientific Research (B)

Allocation TypeMulti-year Fund (2024)
Single-year Grants (2023)
Section一般
Review Section Basic Section 48040:Medical biochemistry-related
Research InstitutionOsaka University (2024)
National Institutes of Biomedical Innovation, Health and Nutrition (2023)

Principal Investigator

岡 正啓  大阪大学, 微生物病研究所, 講師 (40432504)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 足立 淳  国立研究開発法人医薬基盤・健康・栄養研究所, 医薬基盤研究所 創薬デザイン研究センター, 副センター長 (20437255)
中戸 隆一郎  東京大学, 定量生命科学研究所, 准教授 (60583044)
Project Period (FY) 2024-04-01 – 2026-03-31
Project Status Granted (Fiscal Year 2024)
Budget Amount *help
¥18,850,000 (Direct Cost: ¥14,500,000、Indirect Cost: ¥4,350,000)
Fiscal Year 2025: ¥5,460,000 (Direct Cost: ¥4,200,000、Indirect Cost: ¥1,260,000)
Fiscal Year 2024: ¥6,370,000 (Direct Cost: ¥4,900,000、Indirect Cost: ¥1,470,000)
Fiscal Year 2023: ¥7,020,000 (Direct Cost: ¥5,400,000、Indirect Cost: ¥1,620,000)
Keywordsヌクレオポリン融合遺伝子 / 白血病 / 液液相分離 / 融合遺伝子 / 相分離 / ゲノム高次構造 / 急性白血病 / HOX遺伝子
Outline of Research at the Start

核膜孔構成因子(ヌクレオポリン)と転写因子の融合産物は、下流の遺伝子を活性化して急性骨髄性白血病を引き起こすが、そのメカニズムは分かっていない。本研究ではヌクレオポリン融合産物が特異的ゲノム領域上に形成する相分離構造体をヌクレオポリンと転写因子の2つの機能の融合体として捉え、そのユニークな役割(機能分子の濃縮、高次ゲノム構造の再編成)から病態の分子メカニズムを明らかにする。

Outline of Annual Research Achievements

核膜孔複合体の構成因子である約30種類ヌクレオポリンのうち、NUP98やNUP214の遺伝子は染色体転座により転写因子やクロマチン制御因子を含む様々なパートナーと融合遺伝子を形成する。これらの融合遺伝子からは新しい機能を持つ融合タンパク質が生成され、その発現が病態に寄与することが分かっている。近年、ヌクレオポリン融合タンパク質が有するフェニルアラニンとグリシンのリピート配列(FGリピート)を介した液液相分離(Liquid-liquid phase separation (LLPS))が、下流遺伝子の活性化に重要であることが示唆されている。しかしながら液液相分離がどのようにして標的遺伝子の選択的な活性化に結びつくのかについて、液液相分離と遺伝子活性化を繋ぐ分子メカニズムは依然として不明な点が多く残っている。本研究は、ヌクレオポリン融合タンパク質が有する相分離依存的な生理機能を明らかにして、白血病が発症する分子メカニズムを理解することを目的とする。本年度はヌクレオポリン融合タンパク質のパートナー分子部分に着目し、下流遺伝子活性化に影響を及ぼす様々な変異を加えた変異型融合タンパク質の安定発現細胞株を作成し、それらの結合因子を網羅的に調べるためにプロテオーム解析を行った。その結果、下流遺伝子の活性化能と相関して結合する複数の因子が見出された。したがってパートナー分子部分と相互作用する分子が遺伝子活性化を促進している可能性が見出された。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.

Reason

ヌクレオポリン融合タンパク質の機能は、パートナー分子部分の機能に大きく依存していることが明らかになった。またパートナー分子部分と相互作用する因子が、下流遺伝子の活性化能に寄与している可能性が示された。

Strategy for Future Research Activity

ヌクレオポリン融合タンパク質の新規結合因子についてはノックダウンやノックアウトによる絞り込みを行う。その後、分子相互作用のメカニズムや生理的意義の詳細を明らかにする。

Report

(2 results)
  • 2024 Research-status Report
  • 2023 Annual Research Report
  • Research Products

    (19 results)

All 2024 2023

All Journal Article (8 results) (of which Int'l Joint Research: 2 results,  Peer Reviewed: 8 results,  Open Access: 8 results) Presentation (11 results) (of which Int'l Joint Research: 1 results,  Invited: 1 results)

  • [Journal Article] PTBP1 protects Y RNA from cleavage leading to its apoptosis-specific degradation.2024

    • Author(s)
      Takeshi Kamakura Kazuaki Kameda Masahiko Manabe Kan Torii Yuki Sugiura Seiko Ito Shunya Nakayama Takanobu Shimizu Etsuko Nagashima Kosuke Kamiya Masahiro Oka Masafumi Tanaka Motoyuki Otsuka Masato Ohtsuka Ai Kotani
    • Journal Title

      Cell death discovery

      Volume: 10 Issue: 1 Pages: 322-322

    • DOI

      10.1038/s41420-024-02080-6

    • Related Report
      2024 Research-status Report
    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Tridecylcyclohexane in incomplete Freund's adjuvant is a critical component in inducing experimental autoimmune diseases.2024

    • Author(s)
      Norifumi Iijima , Tomoya Hayashi , Masaaki Niino , Yoichi Miyamoto , Masahiro Oka , Ken J Ishii
    • Journal Title

      European journal of immunology

      Volume: 54

    • DOI

      10.1002/eji.202350957

    • Related Report
      2024 Research-status Report
    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Importin-7-dependent nuclear translocation of the Flavivirus core protein is required for infectious virus production.2024

    • Author(s)
      Yumi Itoh Yoichi Miyamoto Makoto Tokunaga Tatsuya Suzuki Akira Takada Akinori Ninomiya Tomomi Hishinuma Mami Matsuda Yoshihiro Yoneda Masahiro Oka Ryosuke Suzuki Yoshiharu Matsuura Toru Okamoto
    • Journal Title

      PLoS pathogens

      Volume: 20 Issue: 8 Pages: e1012409-e1012409

    • DOI

      10.1371/journal.ppat.1012409

    • Related Report
      2024 Research-status Report
    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Importin α4 deficiency induces psychiatric disorder-related behavioral deficits and neuroinflammation in mice2024

    • Author(s)
      Sakurai Koki、Morita Makiko、Aomine Yoshiatsu、Matsumoto Mitsunobu、Moriyama Tetsuji、Kasahara Emiko、Sekiyama Atsuo、Otani Mayumi、Oshima Rieko、Loveland Kate L.、Yamada Masami、Yoneda Yoshihiro、Oka Masahiro、Hikida Takatoshi、Miyamoto Yoichi
    • Journal Title

      Translational Psychiatry

      Volume: 14 Issue: 1 Pages: 426-426

    • DOI

      10.1038/s41398-024-03138-w

    • Related Report
      2024 Research-status Report
    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] miR-147-3p in pathogenic CD4 T cells controls chemokine receptor expression for the development of experimental autoimmune diseases2024

    • Author(s)
      Norifumi Iijima, Masaya Yamaguchi, Tomoya Hayashi, Yuxiang Rui, Yuta Ohira, Yoichi Miyamoto, Masaaki Niino, Tatsusada Okuno, Osamu Suzuki, Masahiro Oka, Ken J. Ishii
    • Journal Title

      Journal of Autoimmunity

      Volume: 19 Pages: 103319-103319

    • DOI

      10.1016/j.jaut.2024.103319

    • Related Report
      2024 Research-status Report
    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] A Kpna1-deficient psychotropic drug-induced schizophrenia model mouse for studying gene?environment interactions2024

    • Author(s)
      Nomiya Hirotaka、Sakurai Koki、Miyamoto Yoichi、Oka Masahiro、Yoneda Yoshihiro、Hikida Takatoshi、Yamada Masami
    • Journal Title

      Scientific Reports

      Volume: 14 Issue: 1 Pages: 3376-3376

    • DOI

      10.1038/s41598-024-53237-3

    • Related Report
      2023 Annual Research Report
    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Phase-separated nuclear bodies of nucleoporin fusions promote condensation of MLL1/CRM1 and rearrangement of 3D genome structure2023

    • Author(s)
      Oka Masahiro、Otani Mayumi、Miyamoto Yoichi、Oshima Rieko、Adachi Jun、Tomonaga Takeshi、Asally Munehiro、Nagaoka Yuya、Tanaka Kaori、Toyoda Atsushi、Ichikawa Kazuki、Morishita Shinichi、Isono Kyoichi、Koseki Haruhiko、Nakato Ryuichiro、Ohkawa Yasuyuki、Yoneda Yoshihiro
    • Journal Title

      Cell Reports

      Volume: 42 Issue: 8 Pages: 112884-112884

    • DOI

      10.1016/j.celrep.2023.112884

    • Related Report
      2023 Annual Research Report
    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] ACAGT‐007a, an anti‐cancer compound that modulates ERK MAPK signaling, induces nuclear enrichment of phosphorylated ERK in T3M4 pancreatic cancer cells2023

    • Author(s)
      Khandakar Golam Iftakhar、Miyamoto Yoichi、Satoh Ryosuke、Kishimoto Kenta、Xie Mingzuo、Shih Mengyu、Takasaki Teruaki、Tanabe Genzoh、Oka Masahiro、Sugiura Reiko
    • Journal Title

      Genes to Cells

      Volume: - Issue: 6 Pages: 457-465

    • DOI

      10.1111/gtc.13026

    • Related Report
      2023 Annual Research Report
    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Presentation] Development of a novel inhibitor against mutant NPM12024

    • Author(s)
      岡正啓、加藤明良、笠原勇矢、赤塚美樹、小路弘行、幸谷愛
    • Organizer
      第83回日本癌学会学術総会
    • Related Report
      2024 Research-status Report
  • [Presentation] 変異型NPM1を標的とした新規CRM1阻害剤の開発2024

    • Author(s)
      岡正啓、加藤明良、笠原勇矢、赤塚美樹、小路弘行、幸谷愛
    • Organizer
      第29回造血器腫瘍研究会
    • Related Report
      2024 Research-status Report
  • [Presentation] 微小核における核輸送分子Importin-α1の新機能とがんにおける病態的意義2024

    • Author(s)
      宮本洋一, 吉村成弘, 岡正啓, 斉藤寿仁, 片桐豊雅
    • Organizer
      第83回日本癌学会学術総会
    • Related Report
      2024 Research-status Report
  • [Presentation] ヌクレオポリン融合遺伝子産物の新たな機能2024

    • Author(s)
      岡正啓
    • Organizer
      第28回 造血器腫瘍研究会
    • Related Report
      2023 Annual Research Report
  • [Presentation] The roles of phase-separated nuclear bodies of nucleoporin-fusions2023

    • Author(s)
      Masahiro Oka
    • Organizer
      鶴岡コンフェレンス
    • Related Report
      2023 Annual Research Report
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] ヌクレオポリン融合遺伝子産物が形成する相分離構造体の機能2023

    • Author(s)
      岡正啓
    • Organizer
      第96回日本生化学会
    • Related Report
      2023 Annual Research Report
  • [Presentation] 核輸送分子Importin α1が微小核に局在する生理的意義の解明2023

    • Author(s)
      宮本洋一、木佐貫玲央、大背戸里詠子、斉藤寿仁、岡正啓
    • Organizer
      第96回日本生化学会
    • Related Report
      2023 Annual Research Report
  • [Presentation] KPNA1遺伝子欠損マウスを用いた向精神薬誘発統合失調症モデルにおける遺伝要因と環境要因の相互作用 (G x E)の解析2023

    • Author(s)
      野宮廣貴, 櫻井航輝, 疋田貴俊, 宮本洋一, 岡正啓, 山田雅己
    • Organizer
      第75回日本細胞生物学会大会
    • Related Report
      2023 Annual Research Report
  • [Presentation] 核移行因子importin α5/KPNA1は神経細胞において核小体の形態の制御に関与する2023

    • Author(s)
      久冨理, 水野克俊, 宮本洋一, 岡正啓, 山田雅己
    • Organizer
      第75回日本細胞生物学会大会
    • Related Report
      2023 Annual Research Report
  • [Presentation] 核輸送分子Importin-αの多機能性と微小核機能2023

    • Author(s)
      宮本洋一、木佐貫玲央、斉藤寿仁、岡正啓
    • Organizer
      第46回日本分子生物学会
    • Related Report
      2023 Annual Research Report
  • [Presentation] アルコール関連行動異常を引き起こす核-細胞質間輸送メカニズム2023

    • Author(s)
      青峰良淳、櫻井航輝、マクファーソントム、小澤貴明、宮本洋一、米田悦啓、岡正啓、疋田貴俊
    • Organizer
      第46回日本分子生物学会
    • Related Report
      2023 Annual Research Report

URL: 

Published: 2023-04-18   Modified: 2025-12-26  

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