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空間的マルチオミクス解析による軟部肉腫の腫瘍微小環境の解明と代謝標的治療法の探索

Research Project

Project/Area Number 23K27385
Project/Area Number (Other) 23H02694 (2023)
Research Category

Grant-in-Aid for Scientific Research (B)

Allocation TypeMulti-year Fund (2024)
Single-year Grants (2023)
Section一般
Review Section Basic Section 49020:Human pathology-related
Research InstitutionKyushu University

Principal Investigator

小田 義直  九州大学, 医学研究院, 教授 (70291515)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 孝橋 賢一  大阪公立大学, 大学院医学研究科, 教授 (10529879)
岩崎 健  九州大学, 大学病院, 准教授 (40766185)
谷口 緑  九州大学, 医学研究院, 助教 (40965240)
山本 猛雄  九州大学, 医学研究院, 助教 (50911616)
橋迫 美貴子  九州大学, 大学病院, 助教 (70774678)
Project Period (FY) 2023-04-01 – 2027-03-31
Project Status Granted (Fiscal Year 2024)
Budget Amount *help
¥18,720,000 (Direct Cost: ¥14,400,000、Indirect Cost: ¥4,320,000)
Fiscal Year 2026: ¥4,030,000 (Direct Cost: ¥3,100,000、Indirect Cost: ¥930,000)
Fiscal Year 2025: ¥4,940,000 (Direct Cost: ¥3,800,000、Indirect Cost: ¥1,140,000)
Fiscal Year 2024: ¥4,160,000 (Direct Cost: ¥3,200,000、Indirect Cost: ¥960,000)
Fiscal Year 2023: ¥5,590,000 (Direct Cost: ¥4,300,000、Indirect Cost: ¥1,290,000)
Keywords空間的プロテオーム / 腫瘍微小環境 / 骨軟部腫瘍 / 腫瘍免疫 / 腫瘍代謝 / マルチオミクス / エビジェネティクス / 希少癌
Outline of Research at the Start

骨軟部腫瘍の多くは、分化傾向に基づく診断分類が行われるが、病理診断困難例が多く予後不良である。申請者はこれまでに骨軟部肉腫における分子治療薬の標的となる癌シグナル経路の異常亢進と、これに誘導される複数の免疫チェックポイント分子の異常発現を明らかにした。しかし、軟部肉腫の腫瘍微小環境における物質代謝状態は未解明である。
本研究では網羅的代謝物解析と複数の細胞特異的マーカーを高分解能で同時計測可能な次世代蛋白定量解析法を組み合わせ、空間的不均一性を1細胞レベルで網羅的に評価可能な「プロテオーム・メタボローム比較解析」を行い、新規診断バイオマーカーや新規治療標的となる代謝プロファイルを解明する。

Outline of Annual Research Achievements

2023年度は、未分化多形肉腫、平滑筋肉腫、隆起性皮膚線維肉腫、軟骨肉腫、粘液型脂肪肉腫を解析した。
未分化多形肉腫においては、腫瘍免疫微小環境を中心に探索を行い、Tertiary lymphoid structure (TLS)の局在および成熟度とCD8陽性疲弊T細胞、形質細胞と病態との関係性について解析した。その結果、いくつかの予後不良因子を見出し、またTLSと免疫チェックポイント発現の関連性について見出した(2024年癌学会発表予定)。
平滑筋肉腫においては、RNA代謝を中心に解析を行った。平滑筋肉腫の細胞株を用いてRNAメチル化酵素のいくつかをsiRNAを用いてKnowck downを行ったところいくつかの分子で腫瘍増殖能の抑制が起きた。RNAの発現解析を行うと、細胞周期関連の遺伝子の発現抑制が起こった。
隆起性皮膚線維肉腫(DFSP)においては、線維肉腫成分(FS)を有するDFSPのDFSP成分とFS成分とで、免疫チェックポイント分子、T細胞浸潤、組織球浸潤の局在を解析を行い、それぞれの成分において微小環境の差異があることを見出した。
軟骨肉腫においては、DNAのメチル化代謝について解析を行い、5hmCが高い腫瘍においては予後不良であること、この発現制御には、TET2が関係していること、RNAの網羅的発現解析において脱分化成分を有する軟骨肉腫の非脱分化成分と脱分化成分を有さない軟骨肉腫は、遺伝子発現パターンが異なることを見出した。
粘液型脂肪肉腫については、核形態の異型度について腎癌の悪性度指標に用いられているFurhrmanグレードを用いて評価したところ、高核異型度グレード群が予後不良となり、生検検体を用いた悪性度評価が可能であることを見出した。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.

Reason

当初の予定通り、解析が進んでいるため。

Strategy for Future Research Activity

研究計画に沿って進めていく。

Report

(1 results)
  • 2023 Annual Research Report
  • Research Products

    (20 results)

All 2024 2023 2022

All Journal Article (10 results) (of which Peer Reviewed: 8 results,  Open Access: 4 results) Presentation (9 results) (of which Int'l Joint Research: 2 results) Book (1 results)

  • [Journal Article] Viable tumor cell density after neoadjuvant chemotherapy assessed using deep learning model reflects the prognosis of osteosarcoma2024

    • Author(s)
      Kawaguchi Kengo、Miyama Kazuki、Endo Makoto、Bise Ryoma、Kohashi Kenichi、Hirose Takeshi、Nabeshima Akira、Fujiwara Toshifumi、Matsumoto Yoshihiro、Oda Yoshinao、Nakashima Yasuharu
    • Journal Title

      npj Precision Oncology

      Volume: 8 Issue: 1 Pages: 16-16

    • DOI

      10.1038/s41698-024-00515-y

    • Related Report
      2023 Annual Research Report
    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Histological and immunohistochemical prognostic factors of primary angiosarcoma2023

    • Author(s)
      Ichiki Toshio、Yamada Yuichi、Ito Takamichi、Nakahara Takeshi、Nakashima Yasuharu、Nakamura Masafumi、Yoshizumi Tomoharu、Shiose Akira、Akashi Koichi、Oda Yoshinao
    • Journal Title

      Virchows Archiv

      Volume: 483 Issue: 1 Pages: 59-69

    • DOI

      10.1007/s00428-023-03572-z

    • Related Report
      2023 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Prognostic value of nuclear morphometry in myxoid liposarcoma2023

    • Author(s)
      Kawaguchi Kengo、Kohashi Kenichi、Iwasaki Takeshi、Yamamoto Takeo、Ishihara Shin、Toda Yu、Yamamoto Hidetaka、Nakashima Yasuharu、Oda Yoshinao
    • Journal Title

      Cancer Science

      Volume: - Issue: 5 Pages: 2178-2188

    • DOI

      10.1111/cas.15729

    • Related Report
      2023 Annual Research Report
    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Diagnostic utility of ERG immunostaining in dermatofibroma2023

    • Author(s)
      Yamada Yuichi、Ichiki Toshio、Susuki Yosuke、Yamada-Nozaki Yui、Tateishi Yuki、Furue Masutaka、Oda Yoshinao
    • Journal Title

      Journal of Clinical Pathology

      Volume: 76 Issue: 8 Pages: 536-540

    • DOI

      10.1136/jclinpath-2022-208158

    • Related Report
      2023 Annual Research Report
  • [Journal Article] Klotho Overexpression Is Frequently Associated With Upstream Rearrangements in Fusion-Negative Phosphaturic Mesenchymal Tumors of Bone and Sinonasal Tract2023

    • Author(s)
      Lee Jen-Chieh、Hsieh Tsung-Han、Kao Yu-Chien、TSong Hsiang-Lin、Oda Yoshinao、Chih-Hsueh Chen Paul、Pan Chin-Chen、Sittampalam Kesavan、Petersson Fredrik、Konishi Eiichi、Chiu Wei-Yih、Chen Cheng-Fong、Carpenter Thomas O.、Lu Tzu-Pin、Chang Ching-Di、Huang Shih-Chiang、Folpe Andrew L.
    • Journal Title

      Modern Pathology

      Volume: 36 Issue: 12 Pages: 100336-100336

    • DOI

      10.1016/j.modpat.2023.100336

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      2023 Annual Research Report
  • [Journal Article] Survival outcomes including salvage therapy of adult head and neck para-meningeal rhabdomyosarcoma: a multicenter retrospective study from Japan2023

    • Author(s)
      Tsuchihashi Kenji、Ito Mamoru、Arita Shuji、et al.
    • Journal Title

      BMC Cancer

      Volume: 23 Issue: 1 Pages: 1046-1046

    • DOI

      10.1186/s12885-023-11528-4

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      2023 Annual Research Report
    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Repeated robotic pancreatectomy for recurrent pancreatic metastasis of mesenchymal chondrosarcoma: A case report2023

    • Author(s)
      Hayashida Sayuri、Ikenaga Naoki、Nakata Kohei、Nakamura So、Abe Toshiya、Ideno Noboru、Endo Makoto、Noguchi Shoko、Oda Yoshinao、Nakamura Masafumi
    • Journal Title

      Asian Journal of Endoscopic Surgery

      Volume: 16 Issue: 4 Pages: 795-799

    • DOI

      10.1111/ases.13240

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      2023 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Intraosseous synovial sarcoma of the mandible: A case report and review of the literature.2023

    • Author(s)
      Imajo I, Yamada T, Chikui T, Kiyoshima T, Ito M, Kohashi K, Sakamoto E, Oda Y.
    • Journal Title

      Oncol Lett.

      Volume: 26 Issue: 1 Pages: 318-318

    • DOI

      10.3892/ol.2023.13904

    • Related Report
      2023 Annual Research Report
    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Secondary Peripheral Dedifferentiated Chondrosarcoma2023

    • Author(s)
      Yoshimoto Masato、Setsu Nokitaka、Yokoyama Nobuhiko、Taguchi Kenichi、Kohashi Kenichi、Oda Yoshinao
    • Journal Title

      JBJS Case Connector

      Volume: 13 Issue: 2

    • DOI

      10.2106/jbjs.cc.21.00783

    • Related Report
      2023 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Clinical significance of signal regulatory protein alpha and T cell immunoreceptor with immunoglobulin and immunoreceptor tyrosine-based inhibition motif domain expression in undifferentiated pleomorphic sarcoma2022

    • Author(s)
      Ishihara Shin、Iwasaki Takeshi、Kohashi Kenichi、Kawaguchi Kengo、Toda Yu、Fujiwara Toshifumi、Setsu Nokitaka、Endo Makoto、Matsumoto Yoshihiro、Nakashima Yasuharu、Oda Yoshinao
    • Journal Title

      Journal of Cancer Research and Clinical Oncology

      Volume: 1 Issue: 6 Pages: 1-1

    • DOI

      10.1007/s00432-022-04078-y

    • Related Report
      2023 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Presentation] 軟骨肉腫におけるDNAメチル化異常と予後予測因子の解析2024

    • Author(s)
      古川寛、岩崎健、川口健悟、園田裕樹、孝橋賢一、山元英崇、小田義直
    • Organizer
      第113回日本病理学会総会
    • Related Report
      2023 Annual Research Report
  • [Presentation] RAD-PATH-SURG Musculoskeletal Course: MUSCULOSKELETAL: NEOPLASTIC Intraarticular Tumors - Interdisciplinary Perspectives2023

    • Author(s)
      Oda Y.
    • Organizer
      Members Meeting of the 50th International Skeletal Society(ISS)Annual Meeting
    • Related Report
      2023 Annual Research Report
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] A 54-year-old female had presents with biting, spontaneous pains and hypesthesia in her left mandible for four months.2023

    • Author(s)
      Mori T, Imajo I, Yamada T, Kiyoshima T, Oda Y.
    • Organizer
      Members Meeting of the 50th International Skeletal Society(ISS)Annual Meeting
    • Related Report
      2023 Annual Research Report
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] 骨腫瘍病理診断における新疾患概念と分子遺伝学的知見2023

    • Author(s)
      小田義直
    • Organizer
      第33回骨軟部放射線研究会
    • Related Report
      2023 Annual Research Report
  • [Presentation] 骨軟部腫瘍の診断と治療に関連した遺伝子異常と腫瘍微小環境研究の現状と展望2023

    • Author(s)
      岩崎健、小田義直
    • Organizer
      第112回日本病理学会総会
    • Related Report
      2023 Annual Research Report
  • [Presentation] WHO 2020年骨軟部腫瘍分類における病理診断と分子遺伝学的解析2023

    • Author(s)
      小田義直
    • Organizer
      56回日本整形外科学会骨・軟部腫瘍学術集会
    • Related Report
      2023 Annual Research Report
  • [Presentation] 肝芽腫におけるFOXM1およびCHD4発現解析と化学療法抵抗性との関連2023

    • Author(s)
      日野祐子、孝橋賢一、濵田洋、玉城昭彦、川久保尚徳、田尻達郎、小田義直
    • Organizer
      第112回日本病理学会総会
    • Related Report
      2023 Annual Research Report
  • [Presentation] 卵巣癌肉腫におけるクロマチンリモデリング変異および遺伝子発現と予後解析2023

    • Author(s)
      片山由大、岩崎健、古川寛、曲淵直未、小田義直
    • Organizer
      第82回日本癌学会学術総会
    • Related Report
      2023 Annual Research Report
  • [Presentation] 高悪性度脂肪肉腫におけるperilipin1およびadipophilinタンパク質発現の予後的意義2023

    • Author(s)
      川口健悟、孝橋賢一、毛利太郎、岩崎健、木下伊寿美、薄陽祐、古川寛、佐藤ちあ紀、園田裕樹、中島康晴、小田義直
    • Organizer
      56回日本整形外科学会骨・軟部腫瘍学術集会
    • Related Report
      2023 Annual Research Report
  • [Book] 病理診断 日本整形外科学会、編 悪性軟部腫瘍取扱い規約 第4版2023

    • Author(s)
      小田義直(分担執筆)
    • Total Pages
      148
    • Publisher
      金原出版
    • Related Report
      2023 Annual Research Report

URL: 

Published: 2023-04-18   Modified: 2024-12-25  

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