Gene-environment interactions inducing spatial expansion of mutant clones in human normal tissues

• Project/Area Number: 23K27447
• Project/Area Number (Other): 23H02756 (2023)
• Research Category: Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
• Allocation Type: Multi-year Fund (2024); Single-year Grants (2023)
• Section: 一般
• Review Section: Basic Section 50010:Tumor biology-related
• Research Institution: Sasaki Foundation
• Principal Investigator: 中岡 博史 公益財団法人佐々木研究所, 附属研究所, 部長 (70611193)
• Co-Investigator(Kenkyū-buntansha): 椙村 春彦 公益財団法人佐々木研究所, 附属研究所, 研究所所長 (00196742) ; 吉原 弘祐 新潟大学, 医歯学系, 教授 (40547535) ; 国定 充 神戸大学, 医学研究科, 非常勤講師 (80566969) ; 須田 一暁 新潟大学, 医歯学総合研究科, 特任講師 (80650621) ; 福本 毅 神戸大学, 医学研究科, 准教授 (80778770) ; 後藤 明輝 秋田大学, 医学系研究科, 教授 (90317090)
• Project Period (FY): 2023-04-01 – 2027-03-31
• Project Status: Granted (Fiscal Year 2024)
• Budget Amount: ¥18,590,000 (Direct Cost: ¥14,300,000、Indirect Cost: ¥4,290,000); Fiscal Year 2026: ¥4,030,000 (Direct Cost: ¥3,100,000、Indirect Cost: ¥930,000); Fiscal Year 2025: ¥4,550,000 (Direct Cost: ¥3,500,000、Indirect Cost: ¥1,050,000); Fiscal Year 2024: ¥4,550,000 (Direct Cost: ¥3,500,000、Indirect Cost: ¥1,050,000); Fiscal Year 2023: ¥5,460,000 (Direct Cost: ¥4,200,000、Indirect Cost: ¥1,260,000)
• Keywords: 正常組織 / がん関連遺伝子 / 体細胞変異 / 変異クローン / 空間的増殖

Outline of Research at the Start

子宮内膜、皮膚、肺、胃において、一見正常な組織や前がん病変を採取し、組織透明化、譲歩組織マーカーによる蛍光染色、シート顕微鏡を用いた三次元イメージング解析を行い、クローン性増殖に関わる特徴的な三次元構造を探索する。組織の構造特性を理解した上で、細分化した組織から上皮成分と間質成分(線維芽細胞、免疫細胞、血管内皮細胞)を選択的に回収し、空間的な位置情報を保持した状態でゲノム解析・エピゲノム解析を行う。変異クローンによって占有された領域と変異クローンによる増殖が限定的な領域のエピゲノム表現型を比較することにより、変異クローンの空間的増殖を誘導する遺伝・環境相互作用の組織特異性について検討する。