• Search Research Projects
  • Search Researchers
  • How to Use
  1. Back to previous page

Functional and phenotypic characterization of cancer-reactive T cells in tumor and lymph nodes

Research Project

Project/Area Number 23K27469
Project/Area Number (Other) 23H02778 (2023)
Research Category

Grant-in-Aid for Scientific Research (B)

Allocation TypeMulti-year Fund (2024)
Single-year Grants (2023)
Section一般
Review Section Basic Section 50020:Tumor diagnostics and therapeutics-related
Research InstitutionNational Institutes of Biomedical Innovation, Health and Nutrition

Principal Investigator

清谷 一馬  国立研究開発法人医薬基盤・健康・栄養研究所, 医薬基盤研究所 難病・免疫ゲノム研究センター, 副センター長 (30433642)

Project Period (FY) 2024-04-01 – 2026-03-31
Project Status Granted (Fiscal Year 2024)
Budget Amount *help
¥18,850,000 (Direct Cost: ¥14,500,000、Indirect Cost: ¥4,350,000)
Fiscal Year 2025: ¥5,460,000 (Direct Cost: ¥4,200,000、Indirect Cost: ¥1,260,000)
Fiscal Year 2024: ¥6,370,000 (Direct Cost: ¥4,900,000、Indirect Cost: ¥1,470,000)
Fiscal Year 2023: ¥7,020,000 (Direct Cost: ¥5,400,000、Indirect Cost: ¥1,620,000)
Keywordsがん特異的抗原 / リンパ節T細胞 / シングルセル解析
Outline of Research at the Start

がん局所に浸潤したT細胞はネオアンチゲンなどのがん特異的抗原を認識し、抗腫瘍効果を示す。代表者らは、リンパ節にもがん反応性T細胞が存在することを示してきた。本研究では、がん反応性を示す腫瘍浸潤T細胞およびリンパ節T細胞の機能と表現型を網羅的に解析することにより、リンパ節から得られるT細胞が有効な細胞のソースとなりうるか明らかにすることを目的としている。新鮮大腸がん手術検体を用いて、1)リンパ節T細胞中のがん反応性T細胞の同定と効率的な増殖系の開発、2) シングルセル解析によるリンパ節T細胞中のがん反応性T細胞の機能・フェノタイプ解析、の二つの項目について解析する。

Outline of Annual Research Achievements

がん局所に浸潤したT細胞 (腫瘍浸潤T細胞) は体細胞変異由来のネオアンチゲンなどのがん特異的抗原を認識し、抗腫瘍効果を示す。これまでの検討で、リンパ節にもがん反応性T細胞が存在することを示してきた。本研究では、がん反応性を示す腫瘍浸潤T細胞およびリンパ節T細胞の機能と表現型を網羅的に解析することにより、リンパ節から得られるT細胞が有効な細胞のソースとなりうるか明らかにすることを目的としている。新鮮大腸がん手術検体を用いて、1)リンパ節T細胞中のがん反応性T細胞の同定と効率的な増殖系の開発、2) シングルセル解析によるリンパ節T細胞中のがん反応性T細胞の機能・フェノタイプ解析、の二つの項目について解析を行った。
本年度は、4症例の大腸がん腫瘍組織のゲノムシーケンスを行った。ゲノムシーケンス情報から、ネオアンチゲン予測を行い、それらネオアンチゲンを10個程度タンデムにつないだTMG: tandem-mini gene constructを作製した。TCR-T細胞を用い、ネオアンチゲンに反応するTCRがリンパ節に存在することを明らかにした。
また、2023年度に同定したCD4/CD8ダブルネガティブT細胞は、疲弊・細胞障害活性は低く、メモリー様フェノタイプを示すことを明らかにした。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

1: Research has progressed more than it was originally planned.

Reason

本年度はネオアンチゲンを発現するTMGとTCR-T細胞を用いた共培養実験により、リンパ節にネオアンチゲンに反応するTCRを持つT細胞が存在することを明らかにした。さらに、CD4CD8ダブルネガティブT細胞のフェノタイプの解析を終了した。

Strategy for Future Research Activity

当初の計画に従い研究を進める。
1) リンパ節T細胞中のがん反応性T細胞の同定と効率的な増殖系の開発
リンパ節T細胞を用いて、患者由来がん細胞またはネオアンチゲン発現B細胞と共培養することにより、がん反応性もしくはネオアンチゲン反応性T細胞を増やす方法を開発していく。また、がん反応性TCR、特にネオアンチゲン反応性TCRを持つT細胞のフェノタイプの特徴について検証する。
2) シングルセル解析によるリンパ節T細胞中のがん反応性T細胞の機能・フェノタイプ解析
がん反応性TCR、特にネオアンチゲン反応性TCRを持つT細胞のフェノタイプの特徴について検証する。またこれまで同定したD4CD8ダブルネガティブT細胞の免疫染色による検出法を開発し、臨床予後との関連について検討を進める。

Report

(2 results)
  • 2024 Research-status Report
  • 2023 Annual Research Report
  • Research Products

    (26 results)

All 2024 2023

All Journal Article (12 results) (of which Int'l Joint Research: 5 results,  Peer Reviewed: 12 results,  Open Access: 9 results) Presentation (14 results) (of which Int'l Joint Research: 1 results,  Invited: 1 results)

  • [Journal Article] Retrospective Analysis of HLA Class II-Restricted Neoantigen Peptide-Pulsed Dendritic Cell Vaccine for Breast Cancer2024

    • Author(s)
      Morisaki T, Kubo M, Morisaki S, Umebayashi M, Tanaka H, Koya N, Nakagawa S, Tsujimura K, Yoshimura S, Kiyotani K, Nakamura Y, Nakamura M, Morisaki T.
    • Journal Title

      Cancers

      Volume: 16 Issue: 24 Pages: 4204-4204

    • DOI

      10.3390/cancers16244204

    • Related Report
      2024 Research-status Report
    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Comparative analysis of the B cell receptor repertoire during relapse and remission in patients with multiple sclerosis2024

    • Author(s)
      Perez-Saldivar M, Nakamura Y, Kiyotani K, Imoto S, Katayama K, Yamaguchi R, Miyano S, Martinez-Barnetche J, Godoy-Lozano EE, Ordonez G, Sotelo J, Gonzalez-Conchillos H, Martinez-Palomo A, Flores-Rivera J, Santos-Argumedo L, Sanchez-Salguero ES, Espinosa-Cantellano M.
    • Journal Title

      Clinical Immunology

      Volume: 269 Pages: 110398-110398

    • DOI

      10.1016/j.clim.2024.110398

    • Related Report
      2024 Research-status Report
    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] CD4+T cells with convergent TCR recombination reprogram stroma and halt tumor progression in adoptive therapy2024

    • Author(s)
      Wolf SP, Leisegang M, Steiner M, Wallace V, Kiyotani K, Hu Y, Rosenberger L, Huang J, Schreiber K, Nakamura Y, Schietinger A, Schreiber H.
    • Journal Title

      Science Immunology

      Volume: 9 Issue: 99

    • DOI

      10.1126/sciimmunol.adp6529

    • Related Report
      2024 Research-status Report
    • Peer Reviewed / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Enhancing the immunogenicity of Wilms tumor 1 epitope in mesothelioma cells with immunoproteasome inhibitors2024

    • Author(s)
      Ito M, Koido S, Iwamoto T, Morimoto S, Fujiki F, Sugiyama H, Matsumoto S, Effenberger C, Kiyotani K, Shiba K.
    • Journal Title

      PLOS ONE

      Volume: 19 Issue: 8 Pages: e0308330-e0308330

    • DOI

      10.1371/journal.pone.0308330

    • Related Report
      2024 Research-status Report
    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Characterization of double-negative T cells in colorectal cancers and their corresponding lymph nodes2024

    • Author(s)
      Okamura Kazumi、Wang Lifang、Nagayama Satoshi、Yamashita Makiko、Tate Tomohiro、Matsumoto Saki、Takamatsu Manabu、Kitano Shigehisa、Kiyotani Kazuma、Nakamura Yusuke
    • Journal Title

      OncoImmunology

      Volume: 13 Issue: 1 Pages: 2373530-2373530

    • DOI

      10.1080/2162402x.2024.2373530

    • Related Report
      2024 Research-status Report
    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Identification of RNF213 as a Potential Suppressor of Local Invasion in Intrahepatic Cholangiocarcinoma2024

    • Author(s)
      Chiablaem K, Jinawath A, Nuanpirom J, Arora JK, Nasaree S, Thanomchard T, Singhto N, Chittavanich P, Suktitipat B, Charoensawan V, Chairoungdua A, Jinn-Chyuan Sheu J, Kiyotani K, Svasti J, Nakamura Y, Jinawath N.
    • Journal Title

      Laboratory Investigation

      Volume: 104 Issue: 7 Pages: 102074-102074

    • DOI

      10.1016/j.labinv.2024.102074

    • Related Report
      2024 Research-status Report
    • Peer Reviewed / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Availability of genome-matched therapy based on clinical practice2024

    • Author(s)
      Hayashi N, Mori S, Ohmoto A, Fukada I, Yamazaki M, Hosonaga M, Wang X, Ueki A, Kiyotani K, Tonooka A, Takeuchi K, Takahashi S.
    • Journal Title

      International Journal of Clinical Oncology

      Volume: 29 Issue: 7 Pages: 964-971

    • DOI

      10.1007/s10147-024-02533-z

    • Related Report
      2024 Research-status Report
    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] One CD4+TCR and One CD8+TCR Targeting Autochthonous Neoantigens Are Essential and Sufficient for Tumor Eradication2024

    • Author(s)
      Wolf SP, Anastasopoulou V, Drousch K, Diehl MI, Engels B, Yew PY, Kiyotani K, Nakamura Y, Schreiber K, Schreiber H, Leisegang M.
    • Journal Title

      Clinical Cancer Research

      Volume: 30 Issue: 8 Pages: 1642-1654

    • DOI

      10.1158/1078-0432.ccr-23-2905

    • Related Report
      2024 Research-status Report 2023 Annual Research Report
    • Peer Reviewed / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Immunological analysis of hybrid peptide encompassing class I/II neoepitope-pulsed dendritic cell vaccine.2023

    • Author(s)
      Morisaki S, Onishi H, Morisaki T, Kubo M, Umebayashi M, Tanaka H, Koya N, Nakagawa S, Tsujimura K, Yoshimura S, Yew PY, Kiyotani K, Nakamura Y, Nakamura M, Kitazono T, Morisaki T.
    • Journal Title

      Front. Immunol

      Volume: 14 Pages: 1223331-1223331

    • DOI

      10.3389/fimmu.2023.1223331

    • Related Report
      2023 Annual Research Report
    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Clinical landscape of TP73 structural variants in ATL patients2023

    • Author(s)
      Hiramatsu Hiroaki、Yokomori Rui、Shengyi Liu、Tanaka Norio、Mori Seiichi、Kiyotani Kazuma、...., Imaizumi Yoshitaka、Iida Shinsuke、Utsunomiya Atae、Noda Tetsuo、Nishikawa Hiroyoshi、Ueda Ryuzo、Sanda Takaomi、Ishida Takashi
    • Journal Title

      Leukemia

      Volume: 37 Issue: 12 Pages: 2502-2506

    • DOI

      10.1038/s41375-023-02059-9

    • Related Report
      2023 Annual Research Report
    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Prognostic impact of cancer genomic profile testing for advanced or metastatic solid tumors in clinical practice2023

    • Author(s)
      Fukada Ippei、Mori Seiichi、Hayashi Naomi、Hosonaga Mari、Xiaofei Wang、Yamazaki Masumi、Ueki Arisa、Kiyotani Kazuma、Tonooka Akiko、Takeuchi Kengo、Ueno Takayuki、Takahashi Shunji
    • Journal Title

      Cancer Science

      Volume: 114 Issue: 12 Pages: 4632-4642

    • DOI

      10.1111/cas.15993

    • Related Report
      2023 Annual Research Report
    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Spatiotemporal commonality of the TCR repertoire in a T-cell memory murine model and in metastatic human colorectal cancer2023

    • Author(s)
      Haraguchi Mizuki, Kiyotani Kazuma, Tate Tomohiro, Sakata Seiji, Sagawa Ray, Takagi Satoshi, Nagayama Satoshi, Takeuchi Kengo, Takahashi Kazuhisa, Katayama Ryohei
    • Journal Title

      Cancer Immunology, Immunotherapy

      Volume: 72 Issue: 9 Pages: 2971-2989

    • DOI

      10.1007/s00262-023-03473-9

    • Related Report
      2023 Annual Research Report
    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Presentation] 患者個々のゲノム情報に基づく個別化がん免疫療法の開発.2024

    • Author(s)
      清谷一馬.
    • Organizer
      第57回日本整形外科学会骨・軟部腫瘍学術集会
    • Related Report
      2024 Research-status Report
    • Invited
  • [Presentation] 大腸がん組織におけるダブルネガティブT細胞の機能.2024

    • Author(s)
      清谷一馬, 中村祐輔.
    • Organizer
      第37回日本バイオセラピィ学会学術集会総会
    • Related Report
      2024 Research-status Report
  • [Presentation] Harnessing Bispecific Antibodies for Neoantigen-Specific Immunotherapy.2024

    • Author(s)
      Xiaojing Wu, Yusuke Nakamura, Kazuma Kiyotani.
    • Organizer
      第37回日本バイオセラピィ学会学術集会総会
    • Related Report
      2024 Research-status Report
  • [Presentation] Comprehensive screening of potential shared neoantigens derived from frameshift mutations.2024

    • Author(s)
      Peng Zhao, Tosihiro Tanaka, Yusuke Nakamura, Kazuma Kiyotani.
    • Organizer
      第83回日本癌学会学術総会
    • Related Report
      2024 Research-status Report
  • [Presentation] Mining tumor neoantigens generated by frameshift mutations based on TCGA data analysis.2024

    • Author(s)
      Peng Zhao, Tosihiro Tanaka, Yusuke Nakamura, Kazuma Kiyotani.
    • Organizer
      第37回日本バイオセラピィ学会学術集会総会
    • Related Report
      2024 Research-status Report
  • [Presentation] Neoantigens Derived from the APC Gene as Potential Targets for Immunotherapy.2024

    • Author(s)
      Peng Zhao, Tosihiro Tanaka, Yusuke Nakamura, Kazuma Kiyotani.
    • Organizer
      The 8th JCA-AACR Special Joint Conference
    • Related Report
      2024 Research-status Report
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] 泌尿器癌免疫チェックポイント阻害剤治療の最前線.2023

    • Author(s)
      加藤大悟, 清谷一馬, 野々村祝夫.
    • Organizer
      第36回日本バイオセラピィ学会学術集会総会
    • Related Report
      2023 Annual Research Report
  • [Presentation] 免疫療法におけるネオアンチゲンを標的としたbispecific抗体の作製.2023

    • Author(s)
      武曉セイ, 中村祐輔, 清谷一馬.
    • Organizer
      第36回日本バイオセラピィ学会学術集会総会
    • Related Report
      2023 Annual Research Report
  • [Presentation] Potential of mass spectrometry in antigen discovery for cancer immunotherapy.2023

    • Author(s)
      Yuriko Minegishi, Yoshimi Haga, Yuji Hakozaki, Kazuma Kiyotani, Satoshi Nagayama, Koji Ueda.
    • Organizer
      第82回日本癌学会学術総会
    • Related Report
      2023 Annual Research Report
  • [Presentation] 乳癌におけるネオアンチゲンを標的とした免疫療法の可能性.2023

    • Author(s)
      清谷一馬, 中村祐輔.
    • Organizer
      第31回日本乳癌学会学術総会
    • Related Report
      2023 Annual Research Report
  • [Presentation] Utilizing APC recurrent frameshift mutation-derived neoantigens as targets for immunotherapy.2023

    • Author(s)
      趙鵬, 田中敏博, 中村祐輔, 清谷一馬.
    • Organizer
      第36回日本バイオセラピィ学会学術集会総会
    • Related Report
      2023 Annual Research Report
  • [Presentation] 大腸がんリンパ節中の腫瘍反応性T細胞のシングルセル解析.2023

    • Author(s)
      清谷一馬, Lifang Wang, 中村祐輔.
    • Organizer
      第36回日本バイオセラピィ学会学術集会総会
    • Related Report
      2023 Annual Research Report
  • [Presentation] Single-cell analysis of tumor-reactive T cells in lymph nodes of colorectal cancer patients.2023

    • Author(s)
      Lifang Wang, Yusuke nakamura, Kazuma Kiyotani.
    • Organizer
      第82回日本癌学会学術総会
    • Related Report
      2023 Annual Research Report
  • [Presentation] Therapeutic bispecific antibody targeting neoantigens.2023

    • Author(s)
      Xiaojing Wu, Yusuke Nakamura, Kazuma Kiyotani.
    • Organizer
      第82回日本癌学会学術総会.
    • Related Report
      2023 Annual Research Report

URL: 

Published: 2023-04-18   Modified: 2025-12-26  

Information User Guide FAQ News Terms of Use Attribution of KAKENHI

Powered by NII kakenhi